サイト作成時にインストールされるプラグイン一覧をplugin.iniに入力します。
例:
common_customfield
item_review
order_invoice

plugin.iniがない場合はplugin.default.iniが読み込まれます。
plugin.iniがある場合は、管理画面の全てのプラグインのページで初期化実行を行うことができます