カートに入っている商品の下の　お買い物を続ける　ボタンをクリックすると　次の https://****.com/shop/ のウェブページは見つかりませんでした　と出てしまいます。

管理画面を開き、「ショップ管理>設定>カートの設定」の順で移動し、カートの設定で「SSLを使用する」にチェックが入っていない場合はチェックを入れてみてください。

「SSLを使用する」にチェックは入っています

すみません、確認すべき内容を間違えていました。
「お買い物を続ける」ボタンですが、これのリンク先はJavaScriptのhistory.back()を指定しています。

history.back()は決め打ちで書いているだけですので、手打ちで存在するURLに書き換えたほうが良いです。
テンプレートの編集方法は、カートページのフォームの出力部分をカスタマイズする - SOY Shopを使ってみように記載があります。