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プログラミング教材開発
大阪府高槻市原地区で肥料教室を開いています
 

藍藻から発見された植物の芳香族アミノ酸等の合成を阻害する糖

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藍藻の一種 *Synechococcus elongatus* が産生する希少糖7-デオキシセドヘプツロース (7dSh) は、植物のシキミ酸経路を阻害する。シキミ酸経路は芳香族アミノ酸や特定の植物ホルモンの合成に必須であるため、7dShは植物の生育を阻害する。この作用は除草剤グリホサートと類似しており、シロイヌナズナを用いた実験で生育阻害効果が確認された。7dShは酵母など他の生物にも影響を与える。微細藻類である藍藻の研究はこれまで困難だったが、急速な研究進展により、7dShのような新規化合物の発見につながり、除草剤開発などへの応用が期待される。

 

ビタミンAとロドプシン

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ニンジンに含まれるβ-カロテンは体内でビタミンAに変換され、視細胞でロドプシン合成に利用される。ロドプシンは光受容体で、光を感知し視覚情報を脳に伝える。興味深いことに、細菌にもバクテリオロドプシンという類似タンパク質が存在する。これは光エネルギーを利用して水素イオンを輸送するプロトンポンプとして機能する。ロドプシンとバクテリオロドプシンの類似性は、動物の視覚と細菌のエネルギー産生という一見異なる機能が、進化的に関連していることを示唆している。つまり、動物が植物の色素を利用する仕組みは、太古の生物が獲得した機能に根ざしていると考えられる。

 

SOY CMSのブログのカレンダープラグインで日毎の記事数に応じてリンクの出力内容を変えてみた

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SOY CMSブログのカレンダープラグインを改良し、日毎の記事数に応じてリンク先を変更しました。従来は記事数に関わらず日毎アーカイブページへのリンクでしたが、記事が1件だけの日は記事詳細ページへ直接遷移するように変更。これにより、より自然な導線を実現しました。改良版プラグインはsaitodev.co/soycms/からダウンロード可能です。

 

赤橙色の色素からビタミンAができる

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β-カロテンなどのカロテノイドは、植物性食品に含まれるプロビタミンAとして摂取される。小腸でβ-カロテンは2分子のレチノール(ビタミンA)に変換され、肝臓に貯蔵される。ビタミンAは、眼の桿状体細胞でロドプシンという視色素の構成成分となり、視覚に重要な役割を果たす。ビタミンAが不足すると夜盲症などを引き起こす。また、免疫機能の維持にも関与し、欠乏すると感染症にかかりやすくなる。かぼちゃはβ-カロテンを豊富に含むため、風邪予防に効果的と言える。

 

京のこだわり旬野菜の会で有機JASで使える資材についての話をしました

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京都市西部農業振興センターで開催された「京のこだわり旬野菜の会」で、有機JAS適合資材について講演を行いました。慣行栽培と有機栽培は、互いの技術を取り入れることで、双方とも品質向上が可能という持論に基づき、土壌分析に基づく施肥設計の重要性を説明しました。京都農販の木村氏による有機JAS肥料解説に先立ち、生産法人向けに行っている内容を共有。有機栽培においても、(工業的に合成されたものではない)無機肥料の活用で秀品率向上を期待しており、講演を通じてその一助となることを願っています。詳細は京都農販日誌を参照ください。

 

冬至にかぼちゃを食べると風邪をひかないというけれど

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冬至にかぼちゃを食べると風邪をひかないと言われるが、かぼちゃにはβ-カロテン、ビタミンC、E、B1、B2、ミネラル、食物繊維が豊富に含まれる。ビタミンB1は糠漬け、ビタミンCとEは別記事で触れたため、今回はミネラルとβ-カロテンについて考察する。ミネラルは果菜類の果実内発芽から鉄やカリウムが多いと予想される。β-カロテンは赤橙色の色素で、植物では補助集光作用がある。生物史初期に誕生した赤橙色の色素は紅色細菌が持っていたもので、植物の色素が人にとって有益な理由を考察したい。

 

京都北部の舞鶴全般の土壌の考察

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舞鶴でのグローバック栽培に関する勉強会をきっかけに、地域の土壌と水質について考察。グローバック栽培は初期費用が安く土壌病害のリスクも低い一方、水耕栽培のため原水のpH調整が重要となる。舞鶴のある施設では原水pHが7.5と高く、周辺の地質が斑れい岩であることを確認。斑れい岩は塩基性火成岩で、pHを高める鉱物を多く含むため、水質も高pHになると推測。さらに、塩基性火成岩はカリウム含有鉱物が少なく、土壌分析の結果もカリウム不足を示唆。カリウムは根の吸水に重要で、舞鶴の栽培ではカリウム肥料の施用が必須。土壌だけでなく、散水に使う川の水のミネラル組成も考慮する必要がある。

 

舞鶴の万願寺唐辛子等の栽培者向けに土壌分析と施肥設計の話をしました

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京都府舞鶴市の万願寺唐辛子やイチゴ農家を対象に、土壌分析に基づく施肥設計の勉強会が開催されました。講師は土壌分析値の解釈と、それに基づいた適切な肥料選択について解説しました。この勉強会は、より効果的な施肥による収量向上と品質改善を目的としており、他のテーマも併せて実施されました。詳細は京都農販日記の記事「舞鶴の万願寺唐辛子等の生産者向けに現場巡回と勉強会をさせて頂きました」に掲載されています。

 

植物ではビタミンCの合成はどのように行われるか?

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二価鉄は植物の生育に必須の微量要素だが、その扱いは難しい。光合成、呼吸、窒素固定など生命活動の根幹に関わる多くの酵素の活性中心として機能する一方で、過剰な二価鉄は活性酸素を発生させ、細胞に損傷を与える。そのため、植物は巧妙な制御機構を備えている。鉄の吸収、輸送、貯蔵、利用を調節するタンパク質群が働き、必要量を確保しつつ過剰を防いでいる。鉄欠乏になるとクロロシス(葉の黄化)などの症状が現れ、生育が阻害される。土壌pHや他の金属イオンの存在も鉄の吸収に影響を与えるため、適切な土壌管理が重要となる。

 

遥か昔に植物が上陸にあたって獲得した過剰な受光対策

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植物は陸上に進出する際、強光による活性酸素の発生という問題に直面した。その対策として、キサントフィルサイクルという仕組みを獲得した。これは、強光下ではビタミンC(アスコルビン酸)を使ってキサントフィルという色素を変換し、集光効率を下げて活性酸素の発生を抑える仕組みである。逆に弱光下では、変換を逆向きに行い集光効率を上げる。ビタミンCを多く含む小松菜のような緑黄色野菜の存在は、このキサントフィルサイクルと関連づけて理解できる。このことから、作物栽培においてビタミンC合成に着目することで生産性向上につながる可能性がある。

 

ワードやエクセルファイルの編集はDropboxフォルダで行おう

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IT関連以外の方との共同作業で、Wordファイルの消失を恐れる相手にDropboxの活用を提案した体験談。Dropboxにファイルを置くことで自動保存・共有、バージョン管理による変更履歴の保持が可能となり、ファイル消失や変更差し戻しへの不安を解消できる。バージョン管理はGit利用者には必須の機能で、DropboxのWebサイト上で過去のバージョンに戻せる。Dropbox利用でファイル名の変更によるバージョン管理の手間も省ける。ただし、企業によってはセキュリティ上の懸念からDropboxのような外部サービス利用を禁止している場合もある。競合他社はこうしたサービスを活用し、事務コスト削減で商品開発に注力し、競争優位に立つ可能性があるため、時代遅れにならないようWebサービス導入と個人スキルの向上が重要。

 

ビタミンCの多い食材と言えば?

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風邪予防で話題のビタミンCについて、含有量の多い食材を考察する記事。ビタミンCはアスコルビン酸という活性酸素を除去する還元剤で、ビタミンEと協力して細胞保護を行う。厚生労働省資料やWikipediaを参照し、活性酸素発生との関連から、葉緑素を持つ緑黄色野菜、特に小松菜に着目。光合成とビタミンCの関係性について、栽培への活用可能性を探るヒントとして紹介している。

 

SOY ShopでSOY Shop新機能紹介プラグインを作成しました

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SOY Shopの新機能紹介プラグインが開発されました。このプラグインは、SOY Shop管理画面の新着ページに、開発ブログで紹介されている新機能の記事一覧を表示します。開発者は、SOY Shopの豊富な機能をユーザーに最大限活用してほしいと考えていますが、新機能の情報が届きにくいことが課題でした。そこで、管理画面に新機能紹介記事を表示することで、ユーザーのオペレーション効率化や売上向上に繋がるヒントを提供することを目指しています。ただし、開発者寄りの情報になる可能性もあるため、掲載内容については、事例紹介なども含めて検討していく予定です。新機能紹介プラグインを含むパッケージはsaitodev.coからダウンロードできます。

 

糠漬けで豊富に含まれるビタミンB1

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糠漬けで増加するビタミンB1は、糖質やアミノ酸からのエネルギー産生に必須の補酵素チアミンの構成要素となる。チアミンは通常、食物中の酵素と結合した状態で存在し、加熱によって遊離する。米ぬかにビタミンB1が豊富なのは、種子の発芽・成長に必要なエネルギー源を確保するためである。親は子である種子に、米ぬかという形で豊富な栄養、特にエネルギー産生に不可欠なビタミンB1を蓄え、発芽時の成長を助ける。

 

SOY Shopで管理画面のみ使用モードを追加しました

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SOY Shopは、9年の歴史の中で機能強化を重ね、ネットショップだけでなく業務アプリとしての需要が高まっている。今回、業務アプリ利用時のサンプルデータ削除の手間を省くため、「管理画面のみ使用モード」が追加された。サイト作成時にチェックを入れるだけで、サンプルデータなしで管理画面を利用できる。 業務アプリとして利用する場合はMySQLデータベース推奨。併せて、管理画面の使い始めのガイダンスも追加された。このアップデートにより、在庫管理や顧客管理など、SOY Shopを業務システム基盤として活用する際の初期設定が簡素化される。ダウンロードは公式サイトから可能。

 

糠漬けの栄養に迫る

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糠漬けは、野菜に米ぬかの栄養が移行することで栄養価が高まる。特に糠に豊富なビタミンB1は、糠漬けによって野菜に取り込まれる。漬物体験をきっかけに、糠漬けの栄養に着目し、ビタミンB1の由来やGABAの増加といった点について考察している。GABAは乳酸菌がグルタミン酸から生成するpH調整の産物と考えられる。ビタミンB1は米ぬかから抽出されたオリザニンであり、糠漬けで摂取できる。

 

嫌気発酵の米ぬかボカシに作物への発根促進効果はあるか?

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嫌気発酵米ぬかボカシの発根促進効果について考察している。過去の栽培比較で、米ぬかボカシを施用した区画で発根が促進された傾向 observed 。これは米ぬかボカシに蓄積された過酸化水素による可能性を推測。過酸化水素は酸素供給剤として働き、劣悪環境での根の酸素供給を助ける。実際に過酸化石灰由来の酸素供給剤で生育促進効果 observed 例を挙げている。ただし、厳密な比較試験ではないため断定は避けている。他に、米ぬかボカシに含まれる菌の死骸やアミノ酸も発根促進に寄与する可能性に触れている。結論として、米ぬかボカシの発根促進効果は過酸化水素や菌体成分など複合的な要因によるものと示唆。

 

SOY ShopでSQLiteからMySQLに移行するプラグインを作成しました

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SOY Shopの長年の運営でSQLiteからMySQLへのデータベース移行の需要が高まり、今回専用の移行プラグインが開発された。SQLiteはファイルベースでサーバーのスペックに依存する一方、MySQLはサーバーベースでリソース割り当てによるパフォーマンスチューニングが可能となる。ただし、MySQL移行自体が速度改善を保証するわけではなく、サーバー環境によっては逆効果になる場合もある。特に共有サーバーでは注意が必要。移行プラグインは、サーバー移転を伴うデータベース移行作業の簡素化を目的としており、チューニング可能なサーバーへの移転と合わせて検討することが推奨される。プラグインはsaitodev.coからダウンロード可能。

 

シアナミドは土壌の細菌にも効果があるのか?

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シアナミドは石灰窒素の主成分で、土壌消毒効果が期待される。酵母のような真核生物だけでなく、細菌にも効果があることが示唆されている。石灰窒素は酸化還元酵素や脱水素酵素を阻害することで、幅広い微生物に影響を与える。ヘアリーベッチはシアナミドを分泌するとされているが、根粒菌との共生など、根圏微生物への影響は限定的であると考えられる。つまり、シアナミド分泌は選択的に行われている可能性があり、そのメカニズムの解明が今後の課題となる。

 

酵母でのアセトアルデヒドの耐性

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石灰窒素の成分シアナミドは生物にアセトアルデヒドを蓄積させ、毒性を示す。酵母はこの毒性に対し、①NADPHを用いたオレイン酸増加、②グルタチオンによるアセトアルデヒド回収、という二つの防御策を持つ。①は糖からのエネルギー産生を抑制し、代わりにNADPH合成経路を活性化、オレイン酸を増やすことで耐性を得る。②はグルタチオンがアセトアルデヒドと結合し無毒化する。アセトアルデヒドはタンパク質とも結合し、重要な生理機能を阻害、死滅に至る可能性もある。

 

石灰窒素の作用機序

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ヘアリーベッチの土壌消毒効果のメカニズムを探るため、その根から分泌されるシアナミドの作用機序に着目。シアナミドは石灰窒素の有効成分で、人体ではアルデヒドデヒドロゲナーゼを阻害し、アセトアルデヒドの蓄積による悪酔いを引き起こす。アセトアルデヒドはDNAと結合し、タンパク質合成を阻害することで毒性を発揮する。この作用は菌類にも影響を及ぼし、土壌消毒効果につながると考えられる。

 

SOY CMSでBootstrap4で作成したブログページ用のページ雛形を追加しました

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SOY CMSにBootstrap4ベースのブログページ用テンプレートを追加しました。ダウンロードURL(https://github.com/inunosinsi/soycms/raw/master/cms/common/logic/admin/Site/TemplatePack/bootstrap4.zip)からテンプレートzipファイルをダウンロードし、管理画面からアップロード・インストールすることで利用可能です。手順は添付画像を参照ください。新規サイト作成時にはこのテンプレートがデフォルトで含まれるようになりました。同梱パッケージはsaitodev.co/soycms/ からダウンロードできます。

 

土壌消毒として緑肥の栽培はどうか?

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ヘアリーベッチは、窒素固定に加え、アレロパシー作用で雑草を抑制する緑肥です。根から分泌されるシアナミドが雑草種子の休眠を打破し、時期外れの発芽を促して枯死させる効果があります。シアナミドは石灰窒素の成分であり、土壌消毒にも利用されます。裏作でヘアリーベッチを栽培すれば、土壌消毒と土壌改良を同時に行え、後作の秀品率向上に繋がると考えられます。さらに、ヘアリーベッチは木質資材の分解促進効果も期待できるため、播種前に安価な木質資材をすき込むことで、土壌改良効果とシアナミド分泌量の増加が期待できます。この手法は従来の太陽光と石灰窒素による土壌消毒より効果的かもしれません。今後の課題は、シアナミドの作用点と、効果のない土壌微生物の特定です。

 

エンドウの寒さへの強さの秘密はどこにあるのかい?

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道端のカラスノエンドウなどのマメ科植物は、真冬でも旺盛に生育している。11月頃から線路の敷石の間などから芽生え、1月後半の寒さの中でも葉を茂らせ、巻きひげを伸ばして成長を続けている。なぜエンドウやソラマメはこのような寒さに耐えられるのか? 考えられるのは、密集した葉によって代謝熱を閉じ込めていること、あるいは低温でも機能する葉緑素を持っていることだ。いずれにせよ、この寒さへの強さは、緑肥としての利用価値の高さを示唆している。葉物野菜が低温下で甘くなるのと同様に、エンドウも厳しい環境に適応するための独自のメカニズムを備えていると言えるだろう。

 

SOY Shopのデータベースのインデックスの見直しで運営の限界を上げる

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SOY Shopユーザーから、サイト表示速度の遅延に関する問い合わせを受け、SQLiteの限界(注文件数約1万件)を指摘した。ユーザー自身はデータベース設計の最適化を提案、実行速度の大幅改善に成功した。この貴重なフィードバックを基に、開発初期コードを大幅改修、最新版をリリースした。開発元を離れ孤独な開発を続ける中で、ユーザーによるコードレベルの貢献は開発者として大きな喜びとなった。SOY Shopの普及にはプログラマの参加が不可欠だが、コミュニティの活性化は課題となっている。

 

葉の先端に透き通る組織

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苔の中に芽生えた小さな草の葉先に、透明な組織が見られた。他の個体には見られない特徴で、正常な発達過程なのか変異体なのかは不明。葉緑素がこれから形成されるのか、あるいは形成されにくい組織なのかもわからない。葉緑素がないと葉は透明になるということが、この観察から推測される。ただし、この個体だけの特徴であるため、一般化するにはさらなる観察が必要である。

 

Windows10のApache2.4でVirtual Hostを設ける

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Windows10のApache2.4でバーチャルホストを設定する方法。httpd.confの`#Include conf/extra/httpd-vhosts.conf`の#を外し、httpd-vhosts.confを編集する。既存の`<VirtualHost *:80>`の設定に加え、新たな`<VirtualHost *:81>`ブロックを追加し、DocumentRootに任意のディレクトリを指定、アクセス許可を設定する。追加のバーチャルホストは、Listenポートと`<VirtualHost>`ブロックを追加することで設定可能。コマンドプロンプトで`httpd -k restart`を実行しApacheを再起動後、ブラウザで`localhost:81`等にアクセスし、意図したファイルが表示されれば設定完了。


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