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糞生菌は、動物の糞に生育する菌類で、主に草食動物の糞に見られる。ヒトヨタケ科など多くの種が存在するが、必ずしも科全体が糞生菌というわけではない。腐生菌である種も含まれる。糞生菌は、糞の中に含まれる未消化の植物組織や、排泄物中の窒素化合物などを栄養源としている。多くの糞生菌は、草に付着しており、動物が草を食べる際に体内に取り込まれ、糞と共に排出されることで生活環を完結させる。肥育牛の糞には、飼料や水分量の関係で菌が少ない場合もある。
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検索キーワード：「子嚢菌門」
牛糞に集まる真菌は何だ？の続き
森を学ぶ為にブナ科の木々を学ぶ
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ブナ科樹木の森林における優位性について、外生菌根菌との共生関係が要因として考えられている。京都大学出版会発行の「どんぐりの生物学」ではこの説を取り上げているが、決定的な証拠はない。外生菌根菌は、共立出版「基礎から学べる菌類生態学」によると、担子菌門や子嚢菌門の菌類で、マツ科、ブナ科などの樹木と共生する。テングダケ科なども含まれ、菌根ネットワークを形成することで宿主植物を強化する可能性がある。しかし、テングダケの毒性と菌根ネットワークの安定性との関連は不明であり、カバイロツルタケのようにブナ科と共生するテングダケ科の菌も存在する。
グラスエンドファイトとヨトウ
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ヨトウムシの食害が深刻な中、グラスエンドファイトという菌類に着目した。内生菌の一種であるグラスエンドファイトに感染したホソムギ（イタリアンライグラス）は、ヨトウムシの生育を抑制する効果があることが『基礎から学べる菌類生態学』で紹介されている。ヨトウムシは種類によってはイネ科を摂食しないため、全てのヨトウ対策に有効かは不明だが、イタリアンライグラス周辺を産卵場所としない可能性があり、幼虫の大移動を防げるかもしれない。農業への応用はまだ研究段階だが、グラスエンドファイトに関する翻訳本でさらに詳しく調べてみる。
白色腐朽菌とトリコデルマの戦い
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高C/N比の枝を堆肥化するには、窒素源が必要という通説への疑問を提起している。リグニン分解に必要な白色腐朽菌は、窒素過多だとトリコデルマ菌との競合に敗北し、分解が阻害される。木質堆肥に牛糞などを加える慣習は、速効性窒素によりトリコデルマを優位にし、リグニン分解を阻害する可能性がある。キノコの生育を観察すれば、窒素源が必要か判断できるはずで、土壌中には窒素固定菌も存在する。記事では、窒素源添加はむしろ有害である可能性を指摘し、自然界の分解過程に学ぶべきだと主張している。