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2016年4月下旬、筆者はまだ全盛期の八重咲きの桜「関山」について綴ります。桜の散り際といえば桜吹雪の美しさが語られますが、この桜は花弁が風に乗るのではなく、花がまとまって落ちる独特の散り方を見せていました。この散り方もまた美しいと感じる一方で、花柄ごと落ちる様子を見て「子孫繁栄できない散り方」ではないかとの疑問を抱きます。しかし、最終的にはこの桜が八重咲きであるため、そもそも実がつかない可能性を指摘。桜の散り方の多様性と、見た目の美しさ、そして生命のメカニズムについて考えさせられるブログ記事です。
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蕎麦殻に含まれるジスルフィド結合切断後のシステイン分解に着目し、有効資材探索の手がかりを探っている。システイン分解過程ではピルビン酸が生成され、同時に硫化水素やアンモニアといった臭気成分も発生する。このことから、硫黄含有量の高いタンパク質は分解時に臭気を発しやすいと推測される。現状では蕎麦殻に有効な資材は不明だが、システイン分解経路の理解が今後の探索に繋がる可能性を示唆している。
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籾殻は水を弾くため分解しにくく、堆肥化が難しい。しかし、燻炭にしたり、適切な水分と圧力を加えることで分解を促進できる。籾殻は水を弾き、微生物分解が阻害される。しかし、適度な塊になると内部の水分蒸散が抑えられ、菌糸が繁殖しやすくなる。菌糸により撥水性が失われ、土壌への馴染みが向上する。つまり、籾殻の堆肥化には、水分と圧力を適切に管理することが重要となる。
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Windows7にPHP7をインストールする方法を解説。PHP7をダウンロード・展開後、C:\php7に配置。Apacheの設定ファイル(httpd.conf)を編集し、PHPモジュールを読み込む設定や、index.phpをDirectoryIndexに追加。PHPの設定ファイル(php.ini)で必要な拡張モジュールを有効化し、タイムゾーンを東京に設定。Apacheを再起動後、phpinfo()を表示するinfo.phpを作成し、ブラウザで確認することでインストール完了となる。
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楽天市場の商品登録作業効率化のため、PHPによるローカル検証環境構築を目指し、複数PCへのインストール手順を記録している。今回はApache2.4のインストール方法を紹介。まずPCが64ビットか確認後、Apache動作に必要なVisual C++再頒布可能パッケージをインストールする。次にApacheの64ビット最新版をダウンロード、解凍し、Apache24フォルダをCドライブ直下に配置。httpd.confのServerNameをlocalhost:80に修正する。Windows環境変数のPathにC:\Apache24\bin;を追加し、コマンドプロンプトでhttpd -k startを実行。ブラウザでhttp://localhostにアクセスし"It Works!"が表示されればApacheのインストールは完了。次回はPHPのインストールについて。
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普賢象という桜を観察した著者は、葉化した雌しべが象の鼻に見えるという由来に疑問を抱いた。緑色の雌しべを写真で確認するも、鼻には見えづらく、命名者の想像力に感嘆する。他の桜の雌しべと比較し、普賢象の雌しべが緑色であることを再確認。葉化とは雌しべの箇所に葉が生えるのではなく、雌しべ自体が葉緑素を持つ変異であることを理解し、その珍しさに感銘を受けた。
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外部からのSSHログインを安全にするため、鍵認証を設定する方法を解説。新規アカウント(hoge)作成後、ssh-keygenで鍵ペアを生成し、公開鍵をサーバにコピー、authorized_keysにリネーム、パーミッション変更。その後、/etc/ssh/sshd_configでPasswordAuthenticationをnoに変更し、sshdを再起動することでパスワード認証を無効化。WindowsではPuTTYgenを使用。無線LANのセキュリティ確認も重要。
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蕎麦アレルギー原因物質Fag e 2の酵素分解耐性は、多数のジスルフィド結合に起因する。ジスルフィド結合切断には、ジチオトレイオール等の還元剤が用いられ、S-S結合に電子を与え還元的に切断する。還元剤は有機物分解により電子を得るため、この過程はエネルギーを消費する。Fag e 2はジスルフィド結合が多く、分解に多くの糖が必要となる可能性が示唆される。このため、蕎麦殻の迅速な土壌還元には、Fag e 2の効率的な分解方法の確立が課題となる。
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Sambaサーバに外部からSSH接続できるよう設定した手順の記録。まずSambaサーバにSSHをインストールし、プライベートIPアドレス(192.168.11.8)を設定、ルーターのIPアドレスをゲートウェイに設定した。次に外部からのSSH接続のため、rootログインを禁止し、無線LANルーターでポートフォワーディング(外部ポート71823→内部ポート22)を設定。外部IPアドレス(例：127.0.0.1)へポート71823を指定してSSH接続を確認した。パスワード認証はセキュリティ的に不安なので、次回は鍵認証を設定予定。
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タンパク質はアミノ酸がペプチド結合で連なったポリペプチドが折りたたまれて機能を持つ。この折りたたみを安定させる結合の一つにジスルフィド結合がある。これは、アミノ酸のシステイン同士が持つチオール基（SH）が酸化反応により硫黄間で共有結合したもので、他の結合より強固で熱にも強い。ジスルフィド結合が多いほどタンパク質は分解されにくくなる。人体では毛や爪に多く含まれ、分解されにくい性質を説明している。
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京都の白川疎水沿いの桜の老木は、幹が朽ちて空洞化していた。しかし、その内部から新しい枝が芽生え、花を咲かせていた。この枝は老木自身から発生したもので、いずれ大きく成長するだろう。やがて、この新しい枝が老木の幹を破り、本体となる日が来るのだろうか？木の世代交代は、このように内側から外側を破るような形で行われるのだろうか？という疑問が湧いた。
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タンパク質はアミノ酸がペプチド結合で連なったもので、ペプチド結合はアミノ酸のアミノ基とカルボキシル基が脱水縮合することで形成される。この結合は加水分解で切断できる。しかし、蕎麦アレルゲンFag e 2は酵素分解されにくい。これはペプチド結合以外の結合、例えばジスルフィド結合などがタンパク質の構造を安定化させているためと考えられる。ジスルフィド結合の理解は、蕎麦殻の有効活用につながる可能性がある。
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ソメイヨシノが終わっても、桜の季節は終わらない。桜漬けに使われる関山や、多数の花弁を持つ菊桜など、これから咲く品種もある。京都府立植物園ではサトザクラ展が開催され、様々な桜の品種を観賞できる。三角フラスコに挿し木された桜はマニアックだが、品種改良の歴史を垣間見ることができる。ウワミズザクラ、緑の花弁を持つ鬱金と御衣黄など珍しい品種も展示されている。ソメイヨシノだけで桜の季節を判断するのはもったいない。植物園を訪れれば、まだまだ楽しめる桜の Vielfalt を発見できる。
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畑に蕎麦殻をまいた際、蕎麦の粉末が多く残っていることに注目。この粉末が蕎麦の貯蔵タンパク質であれば、土壌中の微生物を活発化させると推測されています。蕎麦アレルゲンであるFag e 2は酵素分解されにくいものの、植物の発芽時には分解されることから、土壌微生物がFag e 2分解を得意とする菌を増加させる可能性を示唆。追記では、Fag e 2が消化されにくい理由として、タンパク質内の強固なジスルフィド結合が多いことが挙げられています。
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蕎麦殻アレルギーは、殻に残留するそばアレルゲンタンパク質、特にFag e 2が原因である。Fag e 2は2Sアルブミンファミリーに属する種子貯蔵タンパク質で、水溶性が高い。本来は発芽時に利用されるアミノ酸貯蔵タンパクだが、蕎麦殻に残存しているとアレルギー反応を引き起こす。このため、蕎麦殻を堆肥に利用する場合、Fag e 2の残留が堆肥化プロセスに影響を与える可能性があり、高い水溶性も効果に繋がる可能性がある。
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九州の平飼い卵「つまんでご卵」は、梱包材に蕎麦殻を使用している。蕎麦殻は優れたクッション性で卵を保護し、かつては枕の中身としても重宝された。滑らかで変形しやすく、温度調節機能にも優れているため、蕎麦殻枕の愛用者は多い。しかし、蕎麦粉によるアレルギーの問題から需要が減少し、現在は農業利用（堆肥・飼料）が検討されている。蕎麦殻の新たな活用法に期待が高まる。
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Go製WebアプリをHTTP/2で運用するために、Let's EncryptでSSL証明書を取得した。取得手順は、letsencryptコマンドで証明書を作成し、Goのコードに証明書のパスを指定するだけ。`http.ListenAndServe`を`http.ListenAndServeTLS`に変更し、fullchain.pemとprivkey.pemのパスを設定することでHTTPS化。証明書取得後、サイトはHTTP/2で動作するようになった。
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さくらVPS上のApache2.4でSSL証明書を設定する方法を解説した記事です。opensslを用いて秘密鍵とCSRを作成し、認証局に提出、発行された証明書と中間CA証明書を所定のディレクトリに配置、Apacheの設定ファイルを編集してSSLを有効化します。設定ファイルでは、証明書ファイル、秘密鍵ファイル、中間CA証明書のパスを指定します。最後にApacheを再起動し、httpsでアクセスしてSSL設定を確認します。記事ではLet's Encryptを使った簡便な設定方法への言及もあります。
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お名前.comドメインをさくらVPSとさくらのメールボックスに適用する方法。共有サーバーからVPSへの移行に伴い、メールサーバーは共有サーバーを継続利用するため、ドメインを両方に割り当てる必要がある。お名前.comのDNSレコード設定で、AレコードにVPSのIPアドレス、MXレコードに共有サーバーのメールサーバーのドメインを設定する。MXレコードにはIPアドレスではなくドメインを指定する点が重要。設定後、MX lookupサービスで確認し、さくらの共有サーバーのコントロールパネルでドメインを追加する。Aレコードの反映には時間がかかる場合がある。
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無機肥料の水への溶けやすさは、根の部分の酸の強さ(pKa値)で決まり、値が小さいほど溶けやすい。硫酸＞硝酸＞クエン酸＞炭酸の順。しかしCa²⁺やMg²⁺を含む肥料は、陰イオンとの結合の強さも影響し、硫酸カルシウムより硝酸カルシウムの方が溶けやすい。水溶性肥料(硫酸塩、硝酸塩、クエン酸塩など)は水に溶けやすいが、く溶性肥料(炭酸塩、リン酸塩など)は水に溶けにくい。しかし、く溶性肥料は根から分泌されるクエン酸などの有機酸によって溶け、ゆっくりと肥効を発揮する。カキガラ石灰などは、このく溶性を活かした緩効性肥料である。
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無機肥料は、水に溶けてイオン化することで植物に吸収される。有機肥料のように微生物分解は必要ない。例えば硫酸カルシウム(CaSO₄)は、水に溶けるとカルシウムイオン(Ca²⁺)と硫酸イオン(SO₄²⁻)に分かれる。植物は主にカルシウムイオンを吸収する。肥料の効果は、いかに水に溶けやすいか、つまりイオン化しやすいかで決まる。溶けやすいほどイオンが土壌中に放出され、植物に吸収されやすくなる。
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京都大学の生協前にある鞠のような桜は、八重咲きで、花が集まって咲く様子が鞠に似ている。去年撮影したこの桜は、今年の天候の関係で満開はもう少し先になりそうだが、桜の季節の到来は確実だ。花房の上部からは未熟な葉が出ており、薄い色のリンゴのような果実にも見える。桜とリンゴは同じバラ科であり、桜がリンゴに憧れているという想像も膨らむ。
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デジカメのSDカードから外付けHDDへ写真移動中、エラーでデータが消失。SDカード側も削除済みで焦ったが、PhotoRecというオープンソースの復元アプリを発見。Ubuntuにインストール(sudo apt-get install testdisk)後、sudo photorecを実行。SDカードを選択し、ホームディレクトリに復元先を設定。あっという間にデータが復元され、事なきを得た。
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御衣黄桜は緑色の花弁にピンクの模様が特徴的な桜で、貴族の服の色に似ていることから命名された。開花時期は一般的な桜より長く、去年は今から約一週間後だった。緑色は葉緑素によるもので、花弁の裏には気孔も存在する。通常の桜は葉の機能を退化させて色素で彩られるが、御衣黄は葉の機能を残したまま色素が加わった変異種と考えられる。この変異が緑とピンクの独特な模様を生み出している。
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土壌のCEC測定では酢酸アンモニウムで土壌中のミネラルをアンモニウムと交換する。しかし、硫安（硫酸アンモニウム）のような強酸塩を施肥すると、CEC測定以上のミネラルが交換され、苦土などの養分が溶脱する可能性がある。肥料偽装で革粉の代わりに硫安を使用していた事例では、残留性だけでなくミネラルの効きも弱まり、野菜の品質低下を招いていた可能性がある。つまり、アンモニア態窒素肥料は土壌への影響を考慮し、施肥する必要がある。
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平野神社の八重紅枝垂はソメイヨシノより遅咲きで、今が見頃。紅枝垂より花弁の枚数が少ない種類も存在するが、美しさは好みの問題。既に満開の桜もある一方、平野神社の珍種10種は半分が未開花。ニュースで桜の散り始めが報じられているのは早咲きの種類であり、これからが見頃な桜も多い。桜の季節はまさにこれからが本番。来週、再来週も桜を見に行く予定。
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土壌のCEC（陽イオン交換容量）測定は、土壌が保持できる養分の量を測る方法です。まず酢酸アンモニウムで土壌中の陽イオンをアンモニウムイオンに置換し、エタノールで洗浄後、塩化カリウムでアンモニウムイオンを溶出させます。この溶出したアンモニウムイオン量を測定することで、土壌のCEC、つまりマイナスの電荷量を間接的に測ることができます。測定単位はmeq（ミリイクイバレント）で、イオンの電荷数を示します。