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この記事では、過酸化水素が関与する酵素としてカタラーゼとリグニンペルオキシダーゼを比較している。カタラーゼは過酸化水素を分解して酸素を発生させるのに対し、リグニンペルオキシダーゼは過酸化水素を補因子として利用し、フェノール性化合物を変化させる。つまり、カタラーゼは過酸化水素の分解を目的とする一方、リグニンペルオキシダーゼは過酸化水素を利用して別の反応を促進する。この違いを理解することで、例えば、枝葉の分解に過酸化石灰が有効かもしれないという、有機質肥料の効率化に関するアイディアに繋がることを示唆している。
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キノコはリグニンを分解する際にリグニンペルオキシダーゼ等の酵素を用いる。この酵素反応は酸化還元反応であり、リグニンペルオキシダーゼは過酸化水素から電子を受け取り、リグニンを還元する。つまり、消毒液の成分である過酸化水素がキノコの酵素活性を促す。しかし、過酸化水素は自然界で常時発生する物質なのかという疑問が生じる。
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リグニンペルオキシダーゼは、白色腐朽菌がリグニンを分解する際に使う主要酵素。ヘムタンパク質で、過酸化水素を酸化剤としてリグニンの芳香族環を酸化的に開裂する。反応機構は、過酸化水素が酵素のヘム鉄に作用し、化合物Iと呼ばれる活性種を生成。これがリグニンから電子を奪い、ラジカルを形成。この不安定なラジカルが様々な反応経路を経て分解される。 リグニンペルオキシダーゼは非特異的な触媒作用を持ち、多様なリグニン構造を分解できる。この酵素によるリグニン分解は、自然界の炭素循環において重要な役割を果たし、バイオマス利用への応用も期待されている。