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イネのウンカ類への抵抗性

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イネのウンカ抵抗性に関与する物質、安息香酸ベンジルは、フェニルアラニン由来のベンジルアルコールやベンズアルデヒドから合成される。ウンカの種類によって誘導抵抗性物質の発現量が異なることが報告されている。光合成を高め、自然に抵抗性を高めることが重要であり、シリカ吸収や川からの養分供給が有効である。登熟期には穂への養分転流を抑え、健全な葉でウンカの被害ピーク期を迎えることが重要となる。亜鉛欠乏はオートファジーを誘導し、老化を促進するため、適切な亜鉛供給も抵抗性強化に繋がる。

 

PHPのOPCacheで生成されるキャッシュを見る

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PHPのオペコードを確認するにはVLD拡張モジュールを使用します。VLDはPHPスクリプトをコンパイルし、生成されたオペコードを人間が読める形式で出力します。出力には、各オペコードの行番号、オペコードの種類、オペランド、結果などが含まれます。これにより、PHPスクリプトの実行方法を詳細に理解し、パフォーマンスのボトルネックを特定するのに役立ちます。VLDのインストールはPECLを利用し、php.iniで`vld.active=1`などを設定することで有効化できます。関数`vld_dump()`で特定の関数のオペコードを出力することも可能です。

 

SOY CMS / Shopで別サイトのモジュールを読み込む

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SOY CMS/Shopで、別サイトのHTMLモジュールを読み込む新機能が追加されました。サイトIDをプレフィックスとして`{siteId}.moduleName`のように指定することで、HTMLのみで構成されたモジュールを別サイトから呼び出せます。例えば、`{otherSite}.html.sample`と記述すれば、siteIdが"otherSite"のサイトにある"html.sample"モジュールが表示されます。ただし、SOY CMSとSOY Shop間でのモジュールの相互利用は不可で、データベースを参照するモジュールも使用できません。この機能は、最新版のSOY CMS/Shopパッケージで利用可能です。

 

【SEO対策】PHPのOPCacheの更新チェックの頻度を下げる

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PHPのOPCacheは、バイトコードをキャッシュしてパフォーマンスを向上させる機能。設定項目`opcache.revalidate_freq`はスクリプトの更新チェック頻度を制御する。デフォルトは2秒だが、CMSサイト等でPHPスクリプトの更新が少ない場合は、この値を大きくすることで更新チェックのオーバーヘッドを減らせる。設定変更は`php.ini`で`opcache.validate_timestamps`を有効化し、`opcache.revalidate_freq`を例えば86400(1日)に変更、サーバー再起動で行う。今回の検証ではパフォーマンスの顕著な差は見られなかった。

 

トビイロウンカは大陸から季節風にのってやってくる

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トビイロウンカは越冬できず、中国大陸から季節風に乗って飛来する。中国ではトビイロウンカへの農薬使用量が増加しており、薬剤抵抗性を獲得した個体が日本へ飛来するため、国内の農薬対策が難航している。中国で使用されている農薬を避けつつ、効果的な農薬を選択する必要があり、農薬の流行を常に意識しなければならない。農薬散布は益虫への影響もあるため、化学的知見に加え情勢判断も重要で、新たな対策が求められている。

 

PHPでforeach文の抜け方を見る

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PHPのforeach文でループ中にreturnで抜ける場合、メモリリークの懸念がある。VLDでforeachのオペコードを見ると、ループ終了時にFE_FREEで変数を解放している。しかし、ループ中のreturnでもFE_FREEが実行されるか検証した結果、return前にFE_FREEが挿入されていた。つまり、foreach中にreturnしてもメモリリークは発生せず、PHPが適切にメモリ管理を行っていることが確認できた。

 

カメムシが殺虫剤の抵抗性を得る仕組み

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カメムシは、殺虫剤を無毒化する細菌と共生することで殺虫剤抵抗性を獲得している。カメムシの消化管には共生細菌を宿す器官があり、土壌中の細菌から共生相手を選んでいる。殺虫剤も土壌微生物によって分解されるため、殺虫剤の使用は抵抗性を持つ細菌の増殖を促進する。地域一斉の農薬散布は、この現象を加速させ、カメムシの抵抗性獲得を早め、益虫を死滅させる。結果として害虫は増加し、農薬使用の悪循環に陥る。農薬被害軽減のためには、農薬使用からの脱却が急務となっている。

 

レンゲ栽培の田のイネの出穂数を見てみる

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猛暑日が続く中、中干しの効果について再検討が求められている。伝統的に中干しは土壌の亀裂を促し、根の成長を促進するとされているが、近年の猛暑下では土壌が極度に乾燥し、かえって根の生育を阻害する可能性がある。特に、保水性の高い圃場では過度な乾燥は逆効果となる。さらに、中干しによる急激な乾燥はイネにストレスを与え、生育に悪影響を及ぼす恐れもある。そのため、猛暑日が多い年には中干しの期間を短縮したり、土壌水分計などを活用して土壌の状態を適切に管理したりするなど、柔軟な対応が必要となる。また、品種や栽培方法によっても最適な中干しの方法は異なるため、それぞれの状況に合わせた対応が重要である。

 

薄い色の花弁のアサガオからフラボノイドのことを考える

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薄い花弁のアサガオの生育不良と黄緑色の葉の関連性について考察した記事です。生育の遅延は、フラボノイドの合成量の低下が原因だと推測されています。通常、植物は紫外線対策としてフラボノイドを葉に蓄積しますが、合成量が減少すると紫外線による活性酸素の発生が増加し、活性酸素除去のためにグルタチオン合成にアミノ酸が消費されます。結果として成長に必要なアミノ酸が不足し、生育が遅延すると考えられています。記事では、青色色素合成酵素の欠損ではなく、フラボノイド自体の合成量の低下が原因であると推測しています。その理由は、もし酵素が欠損しているだけであれば、中間生成物である黄色や赤の色素が蓄積し、花弁や葉がこれらの色になるはずだからです。この黄葉の性質は、今後のアサガオ栽培における一つの知見となります。

 

PHPで変数に割り当てた無名関数を解除できるか?

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PHPで変数に割り当てた無名関数は、unset()関数で解除できる。unset()は変数の割当を解除し、メモリを解放する。記事では、文字列を格納した変数と、無名関数を格納した変数でunset()の効果を検証している。どちらもunset()後にはメモリの使用量が減少し、変数自体のメモリ使用分(約32バイト)のみが残った。つまり、無名関数も他の変数と同様にunset()で解除でき、メモリ解放の対象となる。

 

薄い色の花弁のアサガオの花が咲きました

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夏休み明けにアサガオの観察記録。一つの株に複数の種を蒔いた結果、紺や紅などの定番色に加え、薄い紫色の花が咲いた。この淡い色は、朝顔百科と照らし合わせると淡鼠(薄い灰色)か水浅葱(薄い青)に該当する。灰色という言葉の認識の難しさに触れつつ、発芽時の双葉と本葉に見られた気になる点について、今後の記録で考察していく予定。

 

放棄された田はカヤツリグサでも生き残れない

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耕作放棄された水田は深刻なひび割れが生じ、土壌が劣化している。稲作はおろぼず、通常強いカヤツリグサさえも枯死していることから、土壌劣化の末期状態と考えられる。カヤツリグサ科の植物は土壌が固い場所を好むため、これらの植物の出現は土壌劣化、特に土壌の弾力低下を示す指標となる可能性がある。この状態では、緑肥を蒔いても効果は期待できない。土壌の劣化は作物の発根を阻害するため、カヤツリグサ科の植物の繁茂は、栽培を見送る、あるいは堆肥を増やすなどの対策が必要なサインとなる。

 

【SEO対策】content-visibility:auto;でコンテンツの遅延読み込み

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Chrome 85から導入されたCSSプロパティ`content-visibility: auto;`を利用してコンテンツの遅延読み込みを試みた。このプロパティは、コンテンツが画面に表示されるまでレンダリングを遅延させることでパフォーマンス向上に繋がる。具体的には、`<head>`タグ内にスタイルを記述し、遅延させたい要素に`.content-lazy`クラスを付与した。ファーストビューとなるPC表示時は`content-visibility: visible;`、スマホ表示時はメディアクエリで`content-visibility: auto;`を適用することで、表示状況に応じて遅延読み込みを制御している。さらに、常に遅延読み込みさせたい要素には`.content-lazy-always`クラスを付与し、`content-visibility: auto;`を適用した。サイトの読み込み速度が元々速かったため、今回の変更による効果測定は明確ではなかった。

 

PHPのVLDで無名関数を見る

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PHPのVLDを使って無名関数のオペコードを確認した。無名関数は変数`$isEven`に格納され、if文で実行される。VLD出力では、通常の関数と異なり、function nameが`{closure}`と表示された。これはクロージャを示す。無名関数は関数自体を変数に格納し、後で実行できる。

 

川のオギたちがケイ素を吸収している

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川辺に群生するオギは、水からケイ素などを吸収して生育する。著者はかつて師匠が河川敷の刈草を畑に入れ、土壌を改善していたのを想起する。しかし、イネ科作物である稲作では、同じイネ科のオギをそのまま利用しても効果は薄いだろうと推測。そこで、オギの穂が実る前に刈り取り、堆肥化して秋のレンゲ栽培に用いることを提案する。これにより、ケイ素などミネラル分の供給、レンゲの生育促進、ひいては夏の猛暑対策といった複数の課題解決につながると期待している。

 

WSLのApacheをWindows起動時に自動起動させる [WSL/Ubuntu環境]

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Windows起動時にWSL上のApacheを自動起動させる方法。まず、sudoers.dディレクトリにmy-auto-startファイルを作成し、Apache起動コマンドをパスワードなしで実行できるように設定する。次に、.bashrcファイルにApache再起動コマンドを追加。最後に、スタートアップフォルダにmy-auto-start.vbsファイルを作成し、WSLを起動するVBScriptを記述する。Windows再起動後、Apacheが自動的に起動する。

 

SOY ShopでLogin with Amazonプラグインを作成しました

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SOY Shop用のLogin with Amazonプラグインが開発され、Amazonアカウントでのログインが可能になった。取得できるデータはAmazon ID、氏名、メールアドレスで、住所取得は今後の課題。このプラグインは、以前開発されたAmazon Payワンタイムペイメントモジュールと連携できる可能性がある。プラグインはsaitodev.coで提供されているSOY Shopパッケージに含まれる。

 

PHPのVLDで関数を見る

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PHP関数`isEven`のVLDによるオペコード解析結果を検証。`isEven(2)`呼び出しを含むコードでは、メイン部分と`isEven`関数のオペコードが別々に生成され、関数の定義位置に関わらず、実行時のオペコードでは呼び出し部分が先に現れる。定義位置による実行速度への影響は検証予定だが、計測方法未定のため保留。

 

ケイ素を利用する細菌たち

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水田土壌中の細菌がイネのケイ素吸収に関与する可能性が示唆されている。ケイ素を取り込む細菌24株は全てバチルス属で、食中毒菌のセレウス菌(B.cereus)や生物農薬に使われるBT剤(B. thuringiensis)なども含まれる。バチルス属はケイ素の殻を作ることで過酷な環境を生き抜くとされ、B.cereusはケイ素により耐酸性を得ている可能性がある。ケイ素の吸収にはマンガン、亜鉛、カルシウム、鉄等のミネラルが必要で、特に水田で欠乏しやすい亜鉛の供給が重要となる。土壌中の細菌がケイ素を吸収しやすい環境を整えることで、猛暑下でもイネの秀品率維持に繋がる可能性がある。

 

PHPのVLDでforとforeachを比較する

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OPcacheは、PHPスクリプトをコンパイルしたオペコードを共有メモリにキャッシュすることで、PHPのパフォーマンスを向上させる強力なツールです。スクリプトがリクエストされるたびにコンパイルする必要がなくなり、ファイルシステムへのアクセスが削減されます。OPcacheは、PHP 5.5.0以降でデフォルトで有効になっています。 `opcache.enable`ディレクティブで有効化し、`opcache.revalidate_freq` でキャッシュの有効期限を設定します。`opcache_reset()`関数でキャッシュを手動でクリアすることも可能です。OPcacheは、Webサーバーのパフォーマンスを大幅に向上させるため、PHPアプリケーションには必須のツールです。

 

水素酸化能を有するイネの内生菌

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イネの生育に影響を与える水素酸化能を持つ内生菌に関する研究報告が紹介されている。この内生菌は土壌や海洋由来の水素を酸化すると考えられ、そのエネルギーを利用している可能性が示唆されている。 以前のケイ酸と土壌微生物の関係性についての考察を踏まえ、ストレプトマイセス属のような細菌とイネの共生関係について調査した結果、この水素酸化菌の報告に辿り着いた。水素酸化の目的は不明だが、今後の研究でケイ酸と微生物、そしてイネの関係性が解明される可能性に期待が寄せられている。

 

ケイ酸苦土肥料から稲作を模索する

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ケイ酸苦土肥料を用いた稲作の可能性を探る記事。ケイ酸は稲作に有効だが、風化しにくい石英ではなく、風化しやすいケイ酸塩鉱物である必要がある。ケイ酸苦土肥料の原料は蛇紋岩で、風化しやすいネソケイ酸塩であるかんらん石が変質して生成される蛇紋石を主成分とする。水田上流にこれらの岩石が存在し、水路がコンクリートで固められていない環境であれば、ケイ酸が水田に供給され、猛暑でも登熟不良を起こしにくい稲作が可能になる可能性がある。しかし、そのような環境は標高の高い涼しい地域に限られる。蛇紋石とかんらん石に加え、緑泥石の活用にも言及。さらに、植物が利用できるケイ酸は、微生物が鉱物から溶出したものが多いと指摘している。

 

猛暑日が多い中で中干しの意義を再検討する

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猛暑日が続く中、稲作における中干しの意義を再検討する必要がある。高温は光合成の低下や活性酸素の増加につながり、葉の寿命に悪影響を与える。中干しは発根促進効果がある一方、高温時に葉温上昇を招く可能性もある。レンゲ栽培田では中干しによるひび割れがないにも関わらず、高温に耐えているように見える。ケイ酸質肥料は高温時の光合成を改善し、特に中干し後の幼穂形成期に吸収量が増加する。ケイ酸吸収が少ないと気孔の開きが悪くなり、葉温上昇につながる。また、珪藻等の微細藻類の殻は、植物が吸収しやすいシリカの形になりやすい可能性がある。

 

中干し後のレンゲ米栽培の田の様子

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レンゲ米栽培田と慣行栽培田を比較観察した結果、中干し後、慣行栽培田では葉色が薄くなっているのが確認された。これは幼穂形成期における養分転流の影響と考えられる。養分転流は微量要素の移動にも関わり、根の活性が高いと新葉での転流利用率は低下する。サイトカイニンは葉の老化抑制に作用するため、発根が盛んなレンゲ米栽培田では葉色が濃いまま維持されている可能性がある。猛暑時期の光合成を盛んにするには、地温・外気温・紫外線対策といった水管理が重要となる。

 

PHPのVLDでfor文を見る2

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PHPのfor文で、条件式に`count($arr)`を直接記述するパフォーマンスへの影響を検証。VLDでオペコードを確認すると、ループごとに`count`が実行されていることが判明。しかし、`$cnt = count($arr)`として変数に代入してからループ条件に用いるコードと実行時間を比較した結果、有意な差は見られなかった。ループごとに`count`が実行されるのは非効率と考えられるが、`count`関数自体の実行コストは低い、またはPHPの最適化によって`count`の実行回数が減っている可能性がある。


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