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アレルギー反応緩和には、ヒスタミン代謝が重要で、銅を含む酵素ジアミンオキシダーゼ(DAO)とSAMを補酵素とするヒスタミン-N-メチルトランスフェラーゼ(HNMT)が関与する。野菜の栄養価低下、特に微量要素の欠乏によりヒスタミン代謝が弱まっている可能性がある。連作や特定産地のブランド化による弊害で、野菜のミネラル不足が懸念されるため、サプリメント摂取が必要かもしれない。喉の腫れ等の症状改善のため、ミネラルサプリを試す予定。効果があれば、健康な野菜の重要性を裏付けることになる。また、花粉症と乳酸菌飲料の関係性や、腸内細菌によるトリプトファン代謝の違いがアレルギー緩和に繋がる可能性も示唆されている。
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タンパク質はアミノ酸がペプチド結合で連なったもので、ペプチド結合はアミノ酸のアミノ基とカルボキシル基が脱水縮合することで形成される。この結合は加水分解で切断できる。しかし、蕎麦アレルゲンFag e 2は酵素分解されにくい。これはペプチド結合以外の結合、例えばジスルフィド結合などがタンパク質の構造を安定化させているためと考えられる。ジスルフィド結合の理解は、蕎麦殻の有効活用につながる可能性がある。
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蕎麦殻アレルギーは、殻に残留するそばアレルゲンタンパク質、特にFag e 2が原因である。Fag e 2は2Sアルブミンファミリーに属する種子貯蔵タンパク質で、水溶性が高い。本来は発芽時に利用されるアミノ酸貯蔵タンパクだが、蕎麦殻に残存しているとアレルギー反応を引き起こす。このため、蕎麦殻を堆肥に利用する場合、Fag e 2の残留が堆肥化プロセスに影響を与える可能性があり、高い水溶性も効果に繋がる可能性がある。