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太陽熱土壌消毒が「悪い菌だけを死滅させ、良い菌は残すのか」という前回の問いを深掘り。作物に大きな影響を与えるのは真菌（糸状菌）であり、特にフザリウムのような病原性真菌は、植物寄生性と有機物分解の両面を持つと解説します。土壌消毒はフザリウムを減らすものの、同時に良い菌も減少させる可能性があります。消毒後、有機物が豊富な土壌では、天敵が少ないため病原菌が優位になりやすく、結果的に同じ病気が再発するケースが多いと指摘。土壌消毒だけでは病気が止まらない場合、解決の鍵は他の要素にあると結論付けています。
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レンゲを栽培した田んぼでは、入水が始まると土壌生物を求めて鳥が多く集まります。レンゲは冬の間も土壌生物を豊かにするため、入水によってそれらを狙う鳥が集まり、土壌中の生物層が調整されます。
一方、刈草を鋤き込まずに放置した場合は、分解が進まず代掻きに影響する可能性があります。
また、レンゲ栽培は土壌中の生物を通じて鉱物由来の微量要素を減少させる可能性があり、その後の稲作への影響が懸念されます。
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サツマイモ基腐病が産地で蔓延し、収入減を引き起こしている。病原菌 *Plenodomus destruens* による基腐病は、牛糞堆肥の使用と連作が原因と考えられる。牛糞堆肥は土壌の糸状菌バランスを崩し、基腐病菌の増殖を助長する可能性が高い。また、連作も発病を促進する。解決策は、牛糞堆肥を植物性堆肥に変え、緑肥を導入して連作障害を回避すること。しかし、緑肥は時間を要するため、肥料による対策も必要。農薬は、既に耐性菌が発生している可能性が高いため、効果は期待できない。天敵であるトリコデルマやトビムシの活用も、牛糞堆肥の使用を中止しなければ効果は薄い。
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トマトの青枯病対策として土壌消毒は効果が薄く、土壌中の原生生物に着目する必要がある。原生生物は細菌を捕食し、その際に植物ホルモンが増加して発根が促進される。青枯病菌は深さ40cmに潜伏するため、緑肥栽培で深く根を張らせることが有効である。緑肥栽培時は発根促進が重要なので、土壌改良材は緑肥に施肥する。根が土壌を耕し、形成する役割も重要。
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菌耕による排水性向上は、ミミズの活動が鍵となる可能性がある。ミミズは土壌中を深く移動し、1メートルに達するミミズ孔を形成する。孔の壁にはミミズの糞塊が付着し、微生物が繁殖して硝酸態窒素などを利用、好気性細菌の活動によりガス交換も起こる。ミミズは水分、酸素、栄養塩を求めて移動し、植物の根から分泌される物質に誘引される。耕盤層に酸素と栄養塩が供給されれば、ミミズが孔を形成し排水性を向上させる可能性がある。地表への有機物供給もミミズの活動を促し、土壌改良に繋がる。良質な粘土鉱物の存在も重要となる。