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花の色を決める主要な色素は、フラボノイド、カロテノイド、ベタレイン、クロロフィルです。フラボノイドは、アントシアニン、フラボン、フラボノールなどを含み、赤、青、紫、黄など様々な色を作り出します。カロテノイドは、黄色、オレンジ、赤色の色素で、トマトやニンジンなどに含まれます。ベタレインは、赤や黄色の色素で、サボテンやオシロイバナなどに含まれます。クロロフィルは、緑色の色素で、光合成に不可欠です。これらの色素の組み合わせや濃度、pH、金属イオンとの相互作用などによって、花の色は多様に変化します。また、色素の合成に関わる遺伝子の変異も花色の多様性に貢献しています。