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卵の殻は物理的な防御だけでなく、化学的な防御機構も備えている。卵白に含まれるオボトランスフェリンは鉄と結合し、細菌の増殖を抑制する。リゾチームは細菌の細胞壁を破壊する酵素である。オボアルブミンは加熱で変性し、細菌を包み込んで不活性化する。さらに、卵殻膜にも抗菌作用がある。卵は多重防御システムにより、胚を微生物から守っている。特に、リノール酸は酸化しやすく発がん性物質に変化する可能性があるため、抗酸化作用を持つフェニルプロパノイド類との併用が重要となる。