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植物のオートファジーは必須栄養素の欠乏時に活性化される。特に、世界の農耕地の約半数で欠乏し、植物の健全な生育に不可欠な亜鉛（Zn）の欠乏時に注目。亜鉛は金属酵素の補因子であるため、欠乏時にはオートファジーが亜鉛を含むタンパク質を分解し、再利用する。この機能がなければ、活性酸素抑制酵素（Cu/Zn SOD）への亜鉛再分配が滞り、葉に活性酸素が蓄積してクロロシスが発生するなど、植物に深刻な影響が出る。オートファジーは高品質な作物生産（秀品率）にも関与する重要なプロセスである。
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鉄イオンは電子を放出しやすく受け取りやすい性質から、生物の様々な反応に関与する。例えば、植物は鉄イオンを利用して硝酸イオンを還元し、窒素を同化する。また、生物は活性酸素を用いて菌を殺菌するが、活性酸素は自身の細胞も傷つけるため、スーパーオキシドディスムターゼ（SOD）とペルオキシダーゼを用いて活性酸素を鎮める。これらの酵素は鉄（もしくはマンガン）から電子を受け取り、活性酸素を無害化する。つまり、鉄は活性酸素の生成と消去の両方に重要な役割を果たしている。このように、鉄とうまく付き合うことで、生物は様々な代謝をスムーズに行うことができる。