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ビール酵母由来の肥料は作物の抵抗性を高める効果がありますが、その効果を最大限に引き出すには工夫が必要です。抵抗性向上のカギとなるのは、活性酸素を除去する酵素SODの合成誘導。SODは鉄やマンガンなどの微量要素と多くのアミノ酸から作られるため、ビール酵母肥料を散布する際は、アミノ酸肥料や微量要素を混合して施肥することが不可欠です。また、ビール酵母に含まれるβ-グルカンと鉄・マンガンを混合した際に生じる反応が、作物に悪影響を与えないか事前の確認が極めて重要となります。これらの点に留意し、効果的な抵抗性向上と健全な作物育成を目指しましょう。
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水熱処理したビール酵母由来肥料から生成されるRCS（活性炭素種）は、植物の生産性向上に寄与します。RCSの刺激により、植物体内で活性酸素を除去するSOD（スーパーオキシドディスムターゼ）酵素の合成が誘導され、光合成等で自然発生する活性酸素の効率的な無毒化を促進します。これにより植物の抵抗性が高まり、病原菌侵入時の細胞自滅を軽減し免疫維持にも繋がります。ただし、SODの活性には鉄、マンガン、銅、亜鉛などの微量要素が不可欠であり、ビール酵母由来肥料の施肥にはこれらの微量要素も考慮した工夫が重要であると解説しています。
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植物のオートファジーは必須栄養素の欠乏時に活性化される。特に、世界の農耕地の約半数で欠乏し、植物の健全な生育に不可欠な亜鉛（Zn）の欠乏時に注目。亜鉛は金属酵素の補因子であるため、欠乏時にはオートファジーが亜鉛を含むタンパク質を分解し、再利用する。この機能がなければ、活性酸素抑制酵素（Cu/Zn SOD）への亜鉛再分配が滞り、葉に活性酸素が蓄積してクロロシスが発生するなど、植物に深刻な影響が出る。オートファジーは高品質な作物生産（秀品率）にも関与する重要なプロセスである。
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鉄イオンは電子を放出しやすく受け取りやすい性質から、生物の様々な反応に関与する。例えば、植物は鉄イオンを利用して硝酸イオンを還元し、窒素を同化する。また、生物は活性酸素を用いて菌を殺菌するが、活性酸素は自身の細胞も傷つけるため、スーパーオキシドディスムターゼ（SOD）とペルオキシダーゼを用いて活性酸素を鎮める。これらの酵素は鉄（もしくはマンガン）から電子を受け取り、活性酸素を無害化する。つまり、鉄は活性酸素の生成と消去の両方に重要な役割を果たしている。このように、鉄とうまく付き合うことで、生物は様々な代謝をスムーズに行うことができる。