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内在性レトロウイルスは、古代のレトロウイルス感染によって宿主ゲノムに組み込まれたウイルス配列である。ヒトゲノムの約8%を占め、通常は不活性化されているが、一部は遺伝子発現に関与し、胎盤形成に必要なシンシチンなどのタンパク質をコードする。シンシチンは細胞融合を促進し、胎児と母体の栄養交換を可能にする合胞体栄養膜の形成に寄与する。 これらのウイルス由来遺伝子は進化的に保存されており、哺乳類の胎盤進化に重要な役割を果たしたと考えられている。一方で、内在性レトロウイルスの活性化は、自己免疫疾患やがんなどの病態に関与する可能性も示唆されている。

