植物のミカタ

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クエン酸は植物の根から分泌されるだけでなく、コウジカビもグルコース分解の過程で生成する。米ぬかボカシ肥作りと同様に、廃菌床とく溶性苦土を混ぜると、廃菌床内の発酵過程で生成されたクエン酸がく溶性苦土を水溶化する可能性がある。キノコはリグニン分解時にクエン酸を生成し、培地内の炭酸塩を溶かしてミネラルを取得。余ったミネラルは培地のCECが捕捉し、生態系が上手く機能している。

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牛糞堆肥は土壌改良に有効とされるが、窒素過多による生育阻害、雑草種子混入、病害虫リスク、臭気問題などデメリットも多い。特に老朽化水田のような硫化鉄(II)を含む土壌では、牛糞堆肥の窒素により硫化水素が発生し、根腐れを引き起こす可能性がある。さらに、牛糞堆肥の分解過程で生成されるアンモニアは土壌pHを一時的に上昇させ、硫化水素発生を促進する。したがって、老朽化水田の改良には牛糞堆肥ではなく、腐植酸やミネラル豊富な堆肥を選択するべきである。

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奄美大島の大島紬の泥染めは、テーチ木のタンニン酸と泥田の鉄の反応を利用している。しかし、染色の過程で鉄分が消費されるため、ソテツの葉を泥田に浮かべて鉄分を補給するという伝統的な方法がある。ソテツは「蘇鉄」と書き、まさに鉄を蘇らせる役割を果たす。ソテツの根には藍藻類が共生し、窒素固定を行うため痩せ地でも生育できる。この窒素固定にも鉄が必要とされるため、ソテツは鉄を蓄積していると考えられる。同様の窒素固定を行うマメ科植物でも、ソテツのように鉄分補給が可能かどうかは興味深い点である。関連する「新しく借りた水田が老朽化水田だった時は」では、老朽化水田の土壌が還元状態になりやすく、鉄や硫化水素による根腐れが発生しやすいことが解説されている。解決策として、土壌の酸化を進めるために、代かき時に石灰窒素を散布し、水持ちをよくするために堆肥を施すことが推奨されている。また、雑草の繁茂を抑えるために、田植え前に除草剤を使用することも有効である。

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吉備津神社の矢置岩を訪問した著者は、神社背後の山が堆積岩と花崗岩から成る隆起地形であることを地質図で確認した。この経験から、花崗岩地帯の土壌が白いという推測を立て、実際に現地で白い土壌を多数確認、地図情報と一致することを確認した。この発見により、未知の土地の地質を予測する可能性が広がったと結論付けている。

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土壌中の腐植量測定は、分光光度計を用いた紫外-可視吸収スペクトル測定で行われる。腐植は複雑な構造で、末端のカルボキシル基や水酸基が水の保持やpH緩衝、イオン保持に寄与する。測定は水溶液サンプルに光を当て、吸収された波長から量を計算するが、腐植の抽出の難しさから参考値となる。論文では、腐植量とCECには高い正の相関(R²=0.7)が見られた。腐植はアルミニウムと強く結合し長期間保持されることから、腐植のパフォーマンス向上策が重要となる。

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川の上流の石の下には、風化した砂や粘土、落葉などが混ざった川砂がある。これは良質な粘土と腐植を含み、砂の大きさもトラクターの刃を傷つけない程度であるため、客土として畑に入れるメリットがある。川砂の粘土は保水性を高め、腐植は土壌生物の活動を促進し、団粒構造の形成を助ける。適切な大きさの砂は水はけを良くし、通気性を確保する。これらにより、水はけと水持ちのバランスが良くなり、肥沃な土壌が作られる。つまり、川砂は土壌改良に有効な資源と言える。

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京都北部の岩倉にある山住神社で、基盤岩であるチャートを観察した。茶色のチャートは酸化鉄を含み、周辺の土壌の色にも影響を与えていると考えられる。木の根元の土壌は教科書通りの茶色よりやや薄く、京都で見られる茶色っぽい土壌はチャート由来の可能性がある。山住神社は平安時代に石座神社に遷された歴史を持つ。

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土壌中のアルミニウムは、腐植の分解を抑制し土壌中に長期間貯蔵する役割を果たす。腐植は植物遺体などが微生物によって分解されたもので、土壌の肥沃度や保水性に大きく貢献する。しかし、腐植は微生物によってさらに分解され、二酸化炭素として大気中に放出される。アルミニウムイオンは、腐植の分子と結合し、微生物による分解から守る。特に酸性土壌ではアルミニウムイオンが溶出しやすく、この保護作用が顕著になる。このメカニズムは、土壌炭素貯留の観点から地球温暖化対策としても重要である。アルミニウムと腐植の相互作用を理解することは、持続可能な農業や環境保全に繋がる。

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畑作を続けると土壌中の鉱物が溶脱し、作物に悪影響が出る。昔は米と野菜の転作、特に水田に川から水を引くことで、川水に含まれるミネラルが供給され、土壌の鉱物不足を補っていた。また、洪水も新しい鉱物を運ぶ役割を果たしていたが、洪水を人為的に再現する手段として川砂客土が生まれた。川砂はミネラル豊富な一次鉱物が多いが、二次鉱物への風化には時間がかかる。つまり、川砂客土は、水田稲作における川からのミネラル供給や、洪水による新たな鉱物の供給を人為的に再現し、土壌のミネラルバランスを維持するための伝統的な手法と言える。

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ブラタモリ別府温泉の回で、温泉の源である由布火口の白い土壌が映し出された。これは風化しにくい石英が残り、植物の生育に不利な環境となっている。しかし、そこでススキらしき植物が育っているのを発見。通常、石英質の土壌では緑肥も効果が薄く、植物の生育は難しい。それなのに育つススキは、土壌を選ばない強い植物として知られる。著者は、このススキこそが、不利な土壌での栽培の鍵を握るのではないかと考え、現地調査を決意する。

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岩石の種類が土壌の性質に大きく影響する。真砂土の母岩である花崗岩は酸性岩でシリカが多く、有機物が蓄積しにくい。関東ローム層とは異なり、関西の内陸部など花崗岩地帯では、土壌改良に工夫が必要となる。有機物を単純に投入しても効果が薄く、保肥力向上には母岩の性質を理解した対策が重要。このため、関東で研修を受けた人が関西で土壌に苦戦する一方、関西で研修を受けた人は関東で容易に適応できるという現象が生じる。岩石を知ることで、地域による土壌の違いへの理解が深まる。

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寒起こしは、冬の低温を利用して土壌を改良する伝統的な農法です。土を凍らせることで土塊が破壊され、排水性と通気性が向上します。同時に、土壌中の微生物の活動が抑制され、病害虫のリスクも軽減されます。具体的には、秋に耕起した土をそのまま冬越しさせ、霜や雪にさらします。凍結と融解の繰り返しにより、土壌構造が変化し、ふかふかした状態になります。春になると、このふかふかした土は種まきや苗の植え付けに適した状態になります。寒起こしは、特に粘土質の土壌で効果的です。粘土質の土は、水はけが悪く、作物の生育に悪影響を与えることがあります。寒起こしにより、土壌の物理性が改善され、作物の生育が促進されます。また、化学肥料や農薬の使用量を減らすことにもつながり、環境保全にも貢献します。

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黒ボク土は腐植に富み、軽く、空気を取り込みやすい特徴から、栽培に適した土として認識されている。火山灰由来の鉱物に含まれるアルミニウムが腐植の分解を抑制することで、肥沃な土壌が形成される。しかし、火山灰由来であっても関東ローム層のように赤い土壌も存在する。これは火山灰の組成の違い、例えば石英の含有量などが影響すると考えられる。黒ボク土の形成には火山灰に加え、他の条件も関係しているため、より地球規模の視点、鉱物学的視点からの理解が必要とされている。

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霜柱は土壌の水分が凍結・膨張することで形成され、地表を押し上げ、土壌構造に変化をもたらす。記事では、霜柱が土壌を下から持ち上げる現象を観察し、そのメカニズムと農業への影響について考察している。霜柱の形成には、適切な土壌水分量、気温の低下、土壌中の毛細管現象が関与する。水分が凍結すると体積が増加し、地表を押し上げることで霜柱が形成される。この現象は、土壌を耕す効果があり、通気性や排水性を向上させる一方で、作物の根を傷つける可能性もある。特に、土壌が凍結と融解を繰り返すことで、土壌が持ち上げられ、最終的に地表に露出する「凍上」現象は、作物の根を切断し、生育に悪影響を与える。凍上の影響を軽減するためには、土壌の排水性を高める、マルチングを行うなどの対策が有効である。記事は、霜柱を観察することで、土壌の状態や自然のメカニズムを理解し、農業に活かす重要性を示唆している。

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雪に覆われた畑を見て、著者は師の教えを思い出します。師は雪を有効活用して収量を上げていました。雪の重みは、かまくらのように内部を保温し、分解されにくい有機物の分解を促進します。植物繊維を分解する高熱性細菌は65℃付近で活性化しますが、自然界でこの温度に達するのは容易ではありません。しかし、有機物を山積みし圧をかけると内部で発熱します。ただ、山積みのままだと乾燥しやすく、熱がこもりません。そこで雪が役立ちます。雪は圧をかけ続け、水分と熱の放出を防ぎ、分解を促進する理想的な条件を作り出します。雨では持続的な圧力と保湿が難しいため、雪の役割は重要です。師は雪をも利用して農業を成功させていたのです。

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京都市内の畑で、肥料過多と土壌pHの低下により野菜が育たない問題が発生。土壌分析の結果、リン酸過剰とpH4.5という強酸性が判明。施肥設計書に基づき堆肥と石灰を投入してきたことが原因で、土壌中のリン酸が鉄やアルミニウムと結合し、植物が利用できない状態になっていた。さらに、石灰過剰によりカルシウム濃度が異常に高く、マグネシウム欠乏も引き起こしていた。解決策として、有機物を投入し微生物の活性化を図り、リン酸を可給化することが提案された。この事例は、過剰な肥料投入とpH調整が土壌劣化につながることを示す重要な教訓となる。

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ヒマワリは土壌のリン酸吸収力を高める緑肥として有効です。リン酸を吸収したヒマワリを土にすき込むことで、土壌のリン酸過剰状態を改善できます。特に家畜糞堆肥の使用でリン酸値が高くなった土壌で有効です。ヒマワリは大きな根を張り、土壌深くのリン酸も吸収します。地上部はカリウムを多く含み、すき込みによりカリウムも土壌に供給できます。リン酸過剰でカリウム不足になりやすい土壌で、ヒマワリはバランスを整える効果を発揮します。ただし、ヒマワリは土壌の水分を多く吸収するため、乾燥に注意が必要です。

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日本の栽培と畜産は肥料飼料を海外に依存している。食品残渣由来の有機肥料ですら、海外工場産のため輸入品。化学肥料も輸入燃料使用。飼料もトウモロコシ主体で輸入頼み。特に鶏は消化効率が悪く、鶏糞堆肥は実質輸入資源の塊。だからこそ、貴重な海外資源を日本で有効活用すべき。イネ科緑肥と組み合わせ、土壌へ確実に固定し、地下水汚染を防ぐことが重要。これが真の意味でのいいとこ取りであり、持続可能な農業への道。

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家畜糞堆肥は、土壌改良に有効な成分を含む一方で、過剰な硝酸態窒素や石灰、有機態リン酸の蓄積による問題も引き起こす。これを解決する手段として、イネ科緑肥の活用が有効である。イネ科緑肥は、これらの過剰成分を吸収し、土壌への悪影響を抑える。また、緑肥の生育状況から次作に必要な肥料を判断できる利点もある。耕作放棄地に家畜糞堆肥と緑肥を用いることで、新規就農者の初期費用を抑えつつ、安定した収量と品質を確保できる可能性がある。研修生への暖簾分けのような形で畑を提供する仕組みが確立されれば、耕作放棄地の減少、家畜糞処理の効率化、新規就農者の独立支援に繋がる。実際に、鶏糞堆肥とエンバクを用いたカボチャ栽培で無肥料・無農薬ながら高い秀品率を達成した事例も紹介されている。

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エノコロの繁茂を見て、師は次作の豊作を確信していた。イネ科C4植物のエノコロはケイ酸を多く含み、土壌にケイ酸を含む有機物を還元する。これは土壌有機物の蓄積モデルに合致し、地力の維持に貢献する。師の畑は関西特有の真砂土で、粘土が少ないため有機物蓄積には不利なはずだが、師は高品質な作物を収穫し続けた。その秘訣は、エノコロのようなイネ科植物を育て土に還すルーチンを確立した点にある。この手法は土地を選ばず重要であり、師はそれを私に示してくれた。この話は畜産問題にも繋がるが、それはまた別の機会に。

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可溶性ケイ酸は植物の成長を促進する効果がある一方で、土壌中でケイ酸がどのような働きをしているかは未解明な部分が多い。ケイ酸は植物に吸収されると、細胞壁に蓄積して物理的強度を高め、病害虫や環境ストレスへの耐性を向上させる。また、ケイ酸は土壌中のアルミニウムと結合し、アルミニウム毒性を軽減する役割も持つ。さらに、ケイ酸はリン酸と鉄の可給性を高める効果も示唆されている。これらの効果は土壌の種類やpH、他の養分との相互作用に影響されるため、更なる研究が必要とされている。

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ポリフェノールとアミノ酸は反応し、メラノイジンと呼ばれる褐色物質を生成します。この反応は、食品の加工や貯蔵中に起こる褐変現象の原因となります。ポリフェノールは植物に含まれる抗酸化物質であり、アミノ酸はタンパク質の構成要素です。両者が反応するには、熱やアルカリ性の条件が必要です。メラノイジン生成反応は複雑で、様々な中間生成物を経て進行します。生成物の種類や量は、反応条件やポリフェノール、アミノ酸の種類によって異なります。この反応は食品の風味や色に影響を与えるだけでなく、栄養価の低下にもつながる可能性があります。

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収穫後の水田が緑の草で覆われている。早朝に撮影された写真には、水滴を帯びた葉が鮮やかに写り、まるで緑の絨毯のようだ。この水田は耕起後、急速に草が生育した様子。冬を迎えるにあたり、草の被覆は極端な環境変化から土壌を守る役割を果たす。この水田では、土壌改良のため「寒起こし」も行われていた。これは先代から受け継がれた知恵であり、長年米作りを続けるための工夫の一つ。継続的な米作りには、このような地道な努力が必要であることが伺える。

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夜久野の玄武岩公園、かつての採石場を訪れ、玄武岩の風化過程を観察した。柱状節理の玄武岩地表で、木の根が侵入した箇所は茶色の赤土になっていた。さらに、局所的に鮮やかな赤い部分を発見。これは玄武岩中の鉄が風化し、土壌化している過程だと推測。茶色の土は腐植を含んでいると考えられる。超望遠レンズで撮影した画像は、これらの変化を捉えており、土壌への遷移を理解する手がかりとなった。

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火山岩由来の赤土と花崗岩由来の真砂土では、赤土の方が腐植が多い理由について考察している。花崗岩は風化しやすく土になりやすい一方、安山岩は風化しにくいため、土壌化に植物の根や微生物の活動がより必要となる。つまり、安山岩の風化には生物の介入が多く、結果として生物の死骸由来の腐植が蓄積しやすいため、赤土の方が腐植が多くなるという仮説を立てている。この理解が正しければ、山を切り開いた農地への取り組み方も変わると述べている。

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安山岩柱状節理周辺の土壌を観察したところ、赤土が見られた。水田では黒みがかっており、畑では薄い茶色だった。赤土の赤色は、鉱物中の鉄が酸化したためである。柱状の安山岩にも茶色い箇所があり、この地域の赤土は安山岩由来と考えられる。長い時間をかけて、硬い火山岩が風化し土壌になったと考えられる。侵食が激しい場所はより茶色く、植物の根から出る酸や潮風も風化を促進する。次の記事では、一般的に赤土には腐植が多いと言われることについて考察する。

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福井県の東尋坊を訪れた著者は、柱状節理の岩場に生える松の生命力に驚嘆する。土壌のない岩場に根を張り、大きく成長する松だけでなく、その根元には広葉樹までもが生育していた。厳しい環境で育つ木々だが、そこで育ったとしても種子は崖から落ちて海に流されてしまう運命にある。その儚さに思いを馳せ、切ない気持ちになる様子が描かれている。

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老朽化水田の問題は、特定の肥料成分、特に硫酸石灰の残留と嫌気環境下でのガス化に起因する。硫酸イオンのガス化により土壌中の鉄が作物に吸収できない形に変換され、生育に悪影響を与える。大規模稲作では収穫後、水田に水を張ったまま放置することが多く、この嫌気状態がガス化を促進する。解決策として、収穫後に水を抜き、荒起こしを行い、土壌を酸素に触れさせることが重要。さらに、緑肥を栽培することで過剰な硫酸イオンを消費させ、土壌環境を改善できる。エンバクなどの耐寒性緑肥や、伝統的に利用されてきたレンゲも有効。これらの対策は、水田の持続的な利用に繋がる。

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老朽化水田対策の要は、冬場湛水による土壌の還元化を防ぐこと。湛水すると硫酸還元菌が活性化し、硫化水素が発生、土壌中の鉄が反応し稲が吸収できない形になる。さらに硫化水素は稲の根に悪影響を与える。対策として、冬場は水を抜き酸素を供給することで硫酸還元菌の活動を抑制する。可能であれば、客土や堆肥で土壌改良を行う。さらに、老朽化の原因となる過剰な肥料成分を流出させるため、中干しを徹底する。日頃から土壌分析を行い、適切な肥料管理を行うことで老朽化の予防に繋がる。

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プランターの底が割れ、土がこぼれた際に、黒い楕円形の塊が大量に見つかった。これは甲虫類の幼虫の糞で、土を掘り返すと幼虫が多数出てきた。これらの幼虫は腐葉土などの有機物を食べて分解を促すため、土壌にとって有益な存在である。一緒に混ぜていたバーミキュライトも粉砕されており、周囲の土は良い状態になっていた。土壌微生物による分解の前に、昆虫による破砕が重要な役割を果たしていることを実感する出来事だった。

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師は1haの畑に木材チップを1600トン投入という常識外れの手法を用いた。通常、木材チップ過多は微生物が養分を消費し作物の生育を阻害すると考えられるが、3年以内に土地は安定し、豊かな土壌へと変化した。この変化の立役者はアメリカセンダングサ。窒素飢餓が予想される環境下で繁茂し、強靭な根で大きな木片を貫通。脆くなった木片は容易に微生物分解が可能となり、土壌化を促進した。センダングサは養分競争に勝ち、木片を破壊し土壌化を加速させる"開拓者"だった。有機物分解には微生物だけでなく、センダングサのような植物の物理的介入が不可欠であることを示唆する事例である。この経験は後に役立つという。

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センダングサの開花をきっかけに、著者は師の型破りな実験を回顧する。師は1ヘクタールの畑に1600キロリットルもの木材チップを投入するという、農学の常識では考えられない大胆な行動に出た。大量の木材チップは土壌のC/N比を過度に高め、数十年は耕作不能になるとされるが、師はあえてこれを実行した。結果、畑はセンダングサのモノカルチャー状態となり、ブルドーザーで踏み固められた場所にも生えるほどの生命力を見せた。このセンダングサの繁茂は、木材チップ投入による過酷な環境変化を示唆している。この実験は、常識を覆すことで新たな知見を得られることを示す一例であり、著者はその後の環境変化とそこから得られた知見についてもいずれ記すことを示唆している。

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カボチャの果実内発芽は、土壌の深刻な風化を示唆する指標となる。果実内発芽は、種子の休眠を誘導するアブシジン酸の不足によって引き起こされ、その原因として土壌中の硝酸態窒素過多またはカリウム不足が挙げられる。硝酸態窒素は施肥で調整可能だが、カリウムは土壌の一次鉱物の風化によって供給されるため、連作により枯渇しやすい。果実内発芽が発生した場合、土壌の風化が進みカリウム供給源が不足している可能性が高いため、単純な作物変更や休耕では改善が難しい。土壌の根本的な改善策として、一次鉱物を含む資材の投入や、カリウムを保持する腐植を増やす緑肥の導入などが有効と考えられる。

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納豆菌が生成するナットウキナーゼは、ヒトの血栓を溶解する効果があり、同時に含まれるビタミンK2が過剰な溶解を抑制する。これは、納豆菌が周囲のタンパク質を分解するためにナットウキナーゼを合成し、ポリグルタミン酸生成に必要なグルタミン酸を得ているためだと推測される。非殺虫性のBT菌も同様に、特定の物質を分解するために酵素を合成している可能性が考えられる。つまり、これらの菌が生成する酵素は、人間に有益な効果をもたらすが、本来は菌自身の生存戦略の一環として機能していると考えられる。

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琵琶湖では、農業肥料の流入による水質汚染対策として、蓮などの水生植物を植えて肥料を吸収させる試みが行われている。肥料や農薬が川に流れ込むと藻類が異常繁殖し、水質悪化や魚類の酸欠死を引き起こす。琵琶湖もかつては農業排水で緑色に濁っていた。この問題に対し、水路に蓮を植栽することで肥料成分を吸収させ、水質浄化を目指している。併せて、肥料の流出防止策として、土壌の保肥力向上や速効性肥料の使用制限も重要となる。 写真は蓮の植栽状況と地図を示しているが、訪問時期が早く蓮の花は咲いていなかった。

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非殺虫性のバチルス・チューリンゲンシス菌が生成する結晶性タンパク質「パラスポリン」が、ヒトの癌細胞を選択的に破壊することが九州大学の研究で判明した。このタンパク質は、培養した癌細胞を顕微鏡で観察すると破壊していく様子が確認できる。この発見は、以前話題になった遺伝子組み換え作物と土壌微生物の関係性を見直す契機となるかもしれない。土壌微生物が哺乳類に作用するタンパク質を生成する理由は不明だが、パラスポリンの安全性検証が進めば、癌治療や遺伝子組み換え作物の活用に新たな展開が期待される。

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農薬不使用のオーガニック栽培において、作物自身がBT毒素に似た殺虫性を持つ現象が確認された。これは遺伝子組み換え作物ではなく、F1品種で発生した。土壌中の細菌との共生により、作物がBT毒素を獲得した可能性が高い。つまり、オーガニック栽培でも、遺伝子組み換え作物と同様に植物以外の遺伝子が入り込み、同じ殺虫成分を持つことがある。オーガニック栽培で抵抗性獲得は大規模化が難しく、時間もかかるが、作物の味は圧倒的に優れる。ストレスが少ない環境で育つため、苦味成分が少ないためだ。自然の力を最大限に活かしたオーガニック栽培は、遺伝子組み換え技術とは異なるアプローチで同様の結果をもたらす可能性がある。

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BT剤は、バチルス・チューリンゲンシス菌由来の殺虫性タンパク質で、チョウやガの幼虫に効果がある。昆虫のアルカリ性腸内で活性化し、臓器を破壊するが、ヒトの酸性腸内では無毒とされる。BT剤の遺伝子は単離されており、アグロバクテリウム法を用いて他の植物に導入可能。害虫抵抗性を持つBT作物（BTトキシン産生作物）は、この遺伝子組み換え技術の代表例である。

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植物は土壌微生物と共生関係にあり、光合成産物と有用有機化合物を交換する。枯草菌の中には植物ホルモンのオーキシンを合成するものがあり、植物の根張りを促進する。オーキシンは植物の頂点で合成され根に届くまでに消費されるため、土壌中の枯草菌由来のオーキシンは根の成長に重要。枯草菌を増やすには、彼らが得意とする環境、つまり刈草のような環境を作る必要がある。納豆菌の例のように、特定の資材が豊富にあれば微生物は爆発的に増殖しコロニーを形成する。したがって、牛糞主体の土壌改良は、枯草菌の増殖には適さず、植物の生育促進には刈草成分が豊富な土壌が有効と考えられる。

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師匠の広大な無農薬畑で、アブラナ科作物の葉の上でミイラ化したイモムシが多数発見された。これは、作物自身が虫への抵抗性を得たことによるものと思われた。師匠曰く、土壌の状態が良くなるにつれ、この現象は頻繁に見られるようになり、しかも虫食い痕が目立つ前にイモムシが死ぬとのこと。周囲の農薬の影響や師匠による隠れた農薬使用の可能性は無い。この現象はBT剤という生物農薬の効果に似ているため、次回BT剤について掘り下げる。

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老木の桜の幹の奥で、新たな生命が息づいている様子が観察された。木の幹の窪みに溜まった落ち葉や土壌には、多様な植物が生育し、独自の生態系を形成していた。これは、木の幹が単なる枯れた組織ではなく、他の植物の生育基盤となるポテンシャルを持っていることを示唆している。木は死後も、分解過程を通じて土壌に栄養を供給し、新たな生命を育む役割を果たしている。切り株の観察と同様に、老木もまた、次の世代の植物を支える重要な存在であることを再認識させられる。

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遺伝子組み換えは人工的なものと誤解されがちだが、自然界でも日常的に起こっている。例えば、アグロバクテリウムという細菌は植物の根に感染し、自身の遺伝子を植物のDNAに組み込み、根こぶを形成させる。これは、種を越えた遺伝子組み換えが自然界で起こっている例である。つまり、植物のDNAに他の生物の遺伝子が組み込まれることは不自然なことではない。遺伝子組み換え技術はこのような自然界のメカニズムを利用しているが、詳細はまた別の機会に。

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アサガオの行灯仕立ての手入れ中、ネキリムシが茎に向かっているのを発見。しかし、事前に設置しておいた卵の殻の壁がネキリムシの侵入を防いでいた。ネキリムシは卵の殻を超えられずにもがいていた。捕獲したネキリムシはアサガオから離れた場所に放り投げた。殺生は避けるべきだが、卵の殻の壁を最初から設置しておけば憎しみを抱くこともなかったと後悔している。ネキリムシに食害された握爪龍の株は既に失われている。卵の殻は物理的な防御だけでなく、カルシウムによる土壌改善効果や、ニオイによる忌避効果も期待できる。

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粘土は、粒子の大きさで定義される一次鉱物が風化した二次鉱物です。脂肪酸のように疎水性と親水性を持ち、水中でコロイドを形成します。その形状はハロイサイトのような中空管状や、モンモリロナイト・バーミキュライトのような薄板状など多様です。粘土は粒子が小さいですが、必ずしも土を重くするわけではありません。

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ヒマワリは景観だけでなく、緑肥としても優れた機能を持つ。特に土壌に蓄積した吸収できないリン酸を、吸収可能な形に変える効果がある。リン酸は有機質肥料や家畜糞に多く含まれ、過剰になりやすい。過剰なリン酸はカルシウム過剰によるミネラル欠乏や、有機態リン酸による様々なミネラルのキレート化で秀品率低下につながる。ヒマワリは菌根菌の働きでリン酸を可給化し吸収、土壌に残すことでリン酸量を減らしつつ可給態リン酸を増やす。無機リン酸の可給化には有機態リン酸分解菌資材、有機態リン酸にはクエン酸併用が有効と考えられる。これらの組み合わせで土壌のリン酸状態を改善できる。

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バーミキュライトは雲母由来の薄板状粘土鉱物で、保肥力・保水力が高い。モンモリロナイトと同じ2:1型鉱物。蛭石（ひるいし）を高温で膨張させたもので、蛭石は雲母が風化したもの。化学式から、風化により鉄とマグネシウムの供給源となり、保肥力と保水性が向上することがわかる。比較的高価なため、露地での使用は難しい。

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ヤブガラシが生い茂っていた畑が、廃菌床と二次鉱物の投入により土質改善後、ほぼ消滅した。ヤブガラシは土壌の指標植物になり得るのか？ 図鑑には記載がない。ヤブガラシが消えた土壌には弱酸性土壌の指標植物シロザが生育していた。シロザは土壌に良い影響を与える緑肥候補。ヤブガラシとシロザの生育時期は重なるため、ヤブガラシ優勢下ではシロザは育ちにくい。土壌pHが安定し緩衝能を持つ土壌ではヤブガラシは弱体化するようだ。ヤブガラシ旺盛な土壌は作物に不向き。ヤブガラシの繁茂は土壌改善のサインと言える。