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プログラミング教材開発
大阪府高槻市原地区で肥料教室を開いています
検索キーワード:「星屑から生まれた世界」
 

銅から活性酸素が生成される仕組みを知りたいの続き

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酸素発生型光合成の誕生前は、酸素を発生しない光合成生物しかいませんでした。しかし、ある時、シアノバクテリアの祖先が、マンガンを含む酸素発生系を獲得しました。これは、水を分解して電子を取り出し、その際に副産物として酸素を発生させるシステムです。この酸素発生型光合成の誕生により、地球上に酸素が蓄積し始め、私たち人類を含む好気性生物の進化が可能になりました。

 

野菜の美味しさとは何だろう?マグネシウム

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マグネシウムは苦味を持ち、人体にとって重要な役割を果たすミネラルである。苦土(くど)の由来は、マグネシウムの苦味からきている。マグネシウムは体内で酵素反応の補因子、骨の構成要素として必須であり、欠乏すると低カルシウム血症、痙攣、骨粗鬆症、心疾患のリスクを高める。また、血管拡張作用により脳への酸素供給を促進し、めまいを軽減する効果も示唆されている。DNAの構造にも関与している。しかし、過剰摂取は排泄器官への負担を増す可能性がある。 食塩に塩化マグネシウムを加えると塩味と味の濃さが低下する一方、海水塩はまろやかさを増すことから、マグネシウムは味覚の複雑さに寄与していると考えられる。野菜、特に葉物野菜にはマグネシウムが多く含まれ、その苦味は健康的な食味の一部を形成していると考えられる。

 

酸素発生型光合成の誕生の前に

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藻類の進化に関する書籍を元に、酸素発生型光合成誕生以前の生命活動について考察。太古の海ではFe²⁺イオンによる過酸化水素発生が頻繁に起こり、生物は自己防衛のため過酸化水素を分解するカタラーゼを獲得した。カタラーゼはマンガンを補酵素として利用する。後に酸素発生型光合成を担うマンガンクラスターもマンガンを利用しており、水から電子を取り出す構造がカタラーゼと類似していることから、レーンの仮説では、カタラーゼから光合成の機能が進化した可能性を示唆。仮説の真偽は今後の研究課題だが、マンガンが光合成において重要な役割を持つことは明らかである。

 

ビタミンAとロドプシン

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ニンジンに含まれるβ-カロテンは体内でビタミンAに変換され、視細胞でロドプシン合成に利用される。ロドプシンは光受容体で、光を感知し視覚情報を脳に伝える。興味深いことに、細菌にもバクテリオロドプシンという類似タンパク質が存在する。これは光エネルギーを利用して水素イオンを輸送するプロトンポンプとして機能する。ロドプシンとバクテリオロドプシンの類似性は、動物の視覚と細菌のエネルギー産生という一見異なる機能が、進化的に関連していることを示唆している。つまり、動物が植物の色素を利用する仕組みは、太古の生物が獲得した機能に根ざしていると考えられる。

 

石と恐竜から学んだ沢山の知見

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著者は、石の観点から生物誕生を考察し、微量要素への理解を深めることから探求を開始。息子の恐竜への興味を機に大量絶滅の歴史を学び、福井恐竜博物館での体験を通じて植物と恐竜の相互進化、そしてコケから藻類へ至る植物の進化過程に再注目します。これら異分野の知見を繋ぎ合わせる中で、技術屋として「異なるジャンルの知識を統合すること」の重要性を再認識。最終的に「堆肥と追肥の質を格段に向上させる」実践的な知見を獲得したと語り、子供の純粋な好奇心が自身の専門分野で大きな成果を生み出した一年間を振り返ります。

 

重要だけど扱いにくいものでもある二価鉄

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二価鉄(Fe²⁺)は、電子を容易に受け渡しできるため、光合成を含む植物の生命活動において電子の運搬役として不可欠です。電子は物質の合成や分解、エネルギー源として重要であり、二価鉄はその供給を担います。しかし、二価鉄は酸化しやすく活性酸素を発生させるリスクがあるため、過剰症に注意が必要です。植物は、土壌中の三価鉄(Fe³⁺)を還元して二価鉄として吸収する戦略を持ち、体内で糖などから電子を得てこの還元を行います。二価鉄を肥料として利用する場合、酸化を防ぐため有機酸で包み込んだキレート鉄が用いられます。二価鉄は、リスク管理が必要だが、成長を促進する重要な要素です。

 

目に見えない銅欠乏

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植物の銅欠乏は、目に見えにくい問題です。銅はリグニンの合成に関わり、植物の防御力を高めます。また、腐植蓄積にも関与し、健全な発根を促進します。しかし銅の必要量は微量で、主要肥料にも含まれないため、土壌中の銅は不足しがちです。特に畑作では、鉱物由来の銅が供給されにくいため、欠乏が深刻化します。銅欠乏の初期症状は防御力の低下で、害虫の食害や、それに続く病原菌の侵入として現れます。つまり、害虫被害や病気の発生は、銅欠乏の指標となる可能性があります。

 

量子力学で生命の謎を解く

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酵素の働きを量子力学的に理解すると、そのメカニズムがより明確になる。生物は高カロリー物質を低カロリー物質に変換する際、酵素を用いて必要なエネルギーを減少させ、その差分を生命活動に利用する。酵素反応は、電子の授受という観点から説明できる。金属酵素では、マンガンなどの金属が基質を引きつけ、反応を促進する役割を担う。つまり、酵素は電子の移動を制御することで、効率的なエネルギー変換を実現している。

 

元素118の新知識から金属酵素の働きを知る

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亜鉛はI-W系列の元素であり、農薬に含まれることで植物の生育を促進します。I-W系列の元素は相互に関わり合いながら、酵素などの生体分子を構成しています。 亜鉛を含む金属酵素には、炭酸無水化酵素、アルコール脱水素酵素、カルボキシペプチダーゼなどがあります。これらの酵素は、炭酸の除去、アルコールの酸化、タンパク質の分解などに重要な役割を果たします。 さらに、亜鉛はジンクフィンガータンパク質にも含まれており、遺伝子発現の制御に関わっています。植物における亜鉛欠乏は、光合成の低下、成長阻害、花の減少などの症状を引き起こす可能性があります。

 

蛇紋岩とニッケル

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蛇紋岩は苦土と鉄を豊富に含み、栽培に有益と思われがちだが、土壌専門家はpH上昇とニッケルの過剰を懸念している。 ニッケルは尿素分解酵素の必須元素だが、過剰は有害となる。 しかし、稲作や蛇紋岩を含む山の麓の畑では、pH上昇やニッケル過剰の影響が異なる可能性がある。 専門家が局所的な観点から欠点と捉える特徴も、より広範な視点から見直す必要がある。

 

遺伝子の水平伝播

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遺伝子の水平伝播は、親から子への垂直伝播以外で個体間や種間で起こる遺伝子の移動です。微生物では、プラスミドによる遺伝子の移動が知られていますが、死んだ細菌から取り込むという手段もあると考えられています。 この水平伝播により、微生物は抗生物質耐性などの便利な形質を容易に獲得でき、農薬開発などの対策を困難にします。また、いったん獲得した形質が水平伝播で維持されれば、その形質を捨てて増殖を改善するということも起こりにくくなります。そのため、微生物は耐性を保持したまま、長期間にわたって脅威となり続ける可能性があります。

 

殺菌剤の標的とSH酵素阻害

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マンゼブなどのジチオカーバメート系殺菌剤は、SH酵素阻害を通じて殺菌活性を示す。SH酵素阻害とは、システインのSH基を活性中心とする酵素の直接阻害、補酵素CoAやリポ酸のSH基との反応による阻害、酵素反応に必要な重金属のキレートによる阻害を指す。マンゼブに含まれる亜鉛は、I-W系列の規則に従い金属酵素を阻害する。システインは硫黄を含むアミノ酸で、タンパク質の構造維持や活性酸素の除去に関わるグルタチオンの構成要素となる。ジチオカーバメートは、2つの硫黄を含むウレタン構造を指す。

 

亜鉛を含む農薬の作用をI-W系列から考えてみる

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マンゼブは亜鉛を含む農薬で、I-W系列に基づくと、亜鉛は強力な結合力を持ちます。この亜鉛がマンガンや鉄を利用する酵素タンパク質に結合すると、酵素の作用が阻害されます。 I-W系列では、結合力が強い金属ほどリグニンなど強固な物質の合成に関与しますが、結合力が強すぎると生命活動に悪影響を及ぼします。銅は生理作用を維持できる範囲で結合力が強く、リグニン合成に必須ですが、アルミニウムは強すぎて毒性があります。 亜鉛は銅に次ぐ結合力を持ち、生命活動に不可欠な微量要素でもあります。マンゼブが亜鉛を含んでいるため、病原菌の酵素を阻害する効果がありますが、植物は微量要素として亜鉛を利用するため、予防薬として用いることができます。

 

あぐり翔之屋さんの社内研修で予防の話をしました

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京都府木津川市で九条ネギを周年栽培する「あぐり翔之屋」は、休耕田を活用し、地域活性化と雇用創出に貢献している。代表の田中さんは、納得できる品質のネギを作ることにこだわり、独自の栽培方法を確立。土壌分析に基づいた肥料設計や、温度・湿度管理を徹底し、害虫対策にも工夫を凝らす。また、販路拡大にも積極的に取り組み、京野菜のブランド力を活かした販売戦略で、販路の確保と収益向上を目指している。従業員教育にも力を入れ、技術の向上と安定生産を実現。地域農業の活性化に大きく貢献している生産者として注目されている。

 

I-W系列と各微量要素

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「星屑から生まれた世界」で紹介されているアーヴィング-ウィリアムズ(I-W)系列は、微量要素の化学的性質と生物学的役割の関係性を示す。化学データでは銅イオンの陰イオンへの結合力が最も強く、他イオンと結合し不活性化させる危険性がある。一方、生物学データでは細胞内銅イオン濃度は最低で、生物が銅の毒性を回避している様子がわかる。I-W系列は、マンガンから亜鉛にかけての微量要素の必要量と過剰害の傾向を理解するのに役立ち、植物における微量要素の役割の理解を深める視点を提供する。

 

アミノ酸、タンパク質と生命活動の化学

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この記事は、アミノ酸の理解を深めるための新たな視点を提供する書籍「アミノ酸 タンパク質と生命活動の化学」を紹介しています。著者は薬学の専門家で、アミノ酸を薬の前駆体として捉え、トリプトファンからオーキシンが合成される過程などを解説しています。この視点により、アミノ酸の側鎖の重要性や、カルボニル基やアミノ基の存在による酸性・塩基性の理解が容易になります。著者は、この本と「星屑から生まれた世界」を併せて読むことで、生物への理解が深まると述べています。

 

個々のアミノ酸は植物にどのような効果をもたらすのか?

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アミノ酸はタンパク質の構成要素であるだけでなく、個々のアミノ酸自体が植物に様々な影響を与える。例えば、プロリンは乾燥ストレス時に細胞内に蓄積し、植物の耐性を高める。また、チロシンは植物ホルモンであるサリチル酸の前駆体であり、サリチル酸は植物の病害抵抗性や成長に関与する。このように、アミノ酸は単なる材料ではなく、植物の様々な生理機能に直接関わる重要な役割を担っている。

 

植物は銅を何に活用するか?

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生物は常に活性酸素を発生しており、これは呼吸によるエネルギー産生の副産物である。活性酸素は細胞を傷つけるため、老化や病気の原因となる。しかし、生物は活性酸素を完全に排除するのではなく、免疫や細胞の情報伝達などにも利用している。活性酸素の発生源や種類、細胞への影響、そして生物がどのように活性酸素を利用し、防御しているかを理解することは、健康維持や病気予防に繋がる。

 

銅の機能を活かした農薬、ボルドー液

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ボルドー液は、硫酸銅と消石灰の混合溶液から成る農薬である。硫酸銅は胆礬(硫酸銅(II)五水和物)を原料とし、酸化帯に存在し水に溶けやすい。消石灰は炭酸石灰から生成され、土壌pH調整に用いられる。ボルドー液は、消石灰の石灰乳に硫酸銅を加えて作られる。酸性条件で活発になるカビ対策として、硫酸銅の銅イオンの殺菌力を利用しつつ、消石灰でアルカリ性にすることで、酸性環境を好むカビの繁殖を抑える効果が期待される。

 

太古の生物は酸素によって現れた銅を活用した

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ボルドー液は、硫酸銅と消石灰を混ぜて作る殺菌剤で、19世紀末にフランスのボルドー地方でブドウのべと病対策として開発されました。銅イオン(Cu²⁺)は殺菌効果を持ちますが、植物にも有害です。そこで、消石灰を加えて水酸化銅(II)を生成し、銅イオンの溶出速度を調整することで、植物への毒性を抑えつつ殺菌効果を発揮します。ボルドー液は、現在でも有機農法で広く利用されている、歴史ある銅製剤です。銅の結合力の強さは諸刃の剣であり、生物にとって必須であると同時に過剰になると有害となるため、その微妙なバランスが重要です。

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