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ホウ素欠乏は、教科書上ではまれとされるが、現実では頻繁に発生する。これは、土作りを完璧にしても、ホウ素を多く必要とするアブラナ科野菜が、元来日本のようなホウ素濃度が低い環境では栽培に適していないため。ホウ素欠乏を補うためには、日本にほとんど存在しない硼砂（ホウシャ）や小藤石、高価なダイズ油粕などの輸入資材に頼らざるを得ず、海外資源への依存度が高くなる。そのため、キャベツやカブ栽培における収益性は、海外資源の価格に左右されることを認識しておくことが重要である。
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有機無農薬栽培では、カリウムやホウ素などの鉱物由来の肥料成分の補充が難しい。これらの肥料が適切に施肥されないことで、土壌中のミネラルが欠乏する。土作りで腐植を入れるだけではこの問題を解決できない。むしろ、腐植が過剰になると、作物の生育に見えても、収穫した野菜が内部に空洞や変色を持つ可能性がある。これは、ミネラル分の欠乏が原因となっている。
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土壌のpHが適正かどうかを判断するには、植物が効率的に吸収できるpH範囲を考慮する必要がある。最適な吸収ができるのは、窒素、リン、カリウムが最大吸収となるpH 6.5～7.5である。カルシウム、マグネシウム、鉄も考慮すると、pH 6.6～6.8が適している。つまり、肥料のパフォーマンスを最大化するために、土壌のpHを6.6～6.8に調整することが望ましい。このpH範囲から外れると、植物への栄養素供給が阻害される可能性がある。
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土壌のpHは、肥料の吸いやすさに大きく影響します。通常、微酸性のpH6.5～7.0では、ほとんどの肥料が効率的に吸収できます。pHが5.0以下になるとカリウムの吸収が低下し、8.5以上になると鉄の吸収が困難になります。この範囲内で最も理想的なpHは7.0で、すべての肥料が十分に吸収できます。ただし、モリブデンはpH6.5でも吸収率が低くなりますが、鉄の吸収が悪化するpH7.0よりは、影響が軽微です。そのため、土壌のpHを微酸性に保つことが、植物の成長にとって重要です。
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粘土鉱物を含む土壌は、粒子間のつながりによって保水性と保肥力を保つ。しかし、土壌が酸性化するとこのつながりが弱まり、保水・保肥力が失われる。例として、元水田の粘土質土壌が、酸の影響で乾燥しやすく保水・保肥力のない状態になる場合がある。これは施肥効率の低下につながるだけでなく、さらに深刻な問題を引き起こす可能性がある。
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畑作では、灌水による川からの養分補給がほとんどないため、鉱物由来のミネラルが減少する可能性がある。硫安などの酸性肥料の使用は、土壌鉱物の構造を壊し、ミネラルの溶出を促進する。畑作では、この酸性肥料の継続的な使用により、土壌の鉱物劣化が進むと考えられる。腐植の投入だけでは、鉱物劣化による根本的な問題を解決できない可能性がある。水田から畑作に転換する際には、酸性肥料の使用や鉱物劣化の影響を考慮することが重要になる。
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粘土鉱物は土壌の保水性と保肥力を高めますが、悪化した土壌に混入すると、圧縮が促進され、根の伸長を阻害します。土壌粒子が強く凝固し、水分や空気が浸透しにくくなり、排水が悪化します。その結果、作物は必要な水分や養分を十分に吸収できず、成長が抑制されます。粘土鉱物がすでに締まった土壌に混入されると、その悪影響はさらに顕著になります。
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粘土鉱物モンモリロナイトは土壌に潤沢にあると、水分と肥料分を保持し、作物の成長に役立つ。しかし、過多になると根付きにくくなる。
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京都農販のブログ記事は、マルチ栽培における酸素剤の効果について解説しています。酸素剤（過酸化カルシウム）は水と反応し、水酸化カルシウムと過酸化水素を生成します。過酸化水素は分解して酸素を放出するため、土壌への酸素供給が可能になります。これにより、根の発育が促進され、健全な生育につながります。特に雨が多い時期には、土壌中の酸素が不足しがちになるため、酸素剤の使用は有効な対策となります。酸素供給に加えて、カルシウム補給や土壌pHの調整といった効果も期待できます。マルチ栽培と組み合わせることで、生育環境を改善し、より良い作物の収穫を目指せます。
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腐植とは、植物の枯死体などが微生物によって分解され土に還元される過程の有機物のこと。落ち葉や木の枝などがこれにあたる。牛糞なども植物の未消化分を含んでいるため腐植とみなせる場合もあるが、基本的には植物由来のものを指す。腐植は土壌の保肥力や緩衝性を高め、作物の根張りを良くする効果がある。土砂に腐植が豊富に含まれていることは、植物の生育にとって良い影響を与えると言える。