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プログラミング教材開発
大阪府高槻市原地区で肥料教室を開いています
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旨味成分のコハク酸

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コハク酸は、貝類や日本酒に多く含まれる酸味と旨味を持つ有機化合物です。クエン酸回路の中間体として、生体内エネルギー産生に重要な役割を果たします。構造的には、2つのカルボキシ基を持つジカルボン酸で、クエン酸から数段階を経て生成されます。 旨味成分として知られるグルタミン酸は、コハク酸の前駆体であるα-ケトグルタル酸と関連しており、コハク酸もグルタミン酸に似た旨味を持つと考えられます。貝類に多く含まれる理由は、エネルギー代謝経路の違いや、浸透圧調整に関与している可能性などが考えられています。

 

春の山菜ツクシの続き

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ツクシはミネラル豊富だが、チアミナーゼ、アルカロイド、無機ケイ素の摂取には注意が必要。 チアミナーゼはビタミンB1を分解する酵素だが、ツクシのアク抜きで除去可能。 ビタミンB1は代謝に重要だが、チアミナーゼは植物、魚、細菌などに存在し、その役割は不明。 ツクシは適切に処理すれば健康 benefitsを提供できる。

 

青酸の毒性

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この記事では、青酸(シアン化水素)の毒性について解説しています。シアン化合物は反応性が高く、呼吸に必要なヘム鉄と結合し、エネルギー産生を阻害することで毒性を発揮します。 具体的には、シアン化合物はヘム鉄内の鉄イオンに結合し、酸素との結合を阻害します。結果として、細胞は酸素を利用したエネルギー産生ができなくなり、窒息と似た状態に陥ります。 ただし、少量のシアン化水素は体内で分解され、蟻酸とアンモニアになるため、直ちに危険というわけではありません。未熟なウメなど、シアン化合物を含む食品は、適切に処理することで安全に摂取できます。

 

消化汚泥から得られる溶解性リン酸態リン

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リン鉱石の枯渇が懸念される中、下水処理場の消化汚泥からリンを回収する技術が注目されています。消化汚泥とは、下水を処理する過程で発生する有機物をメタン菌によって分解した後のアルカリ性の汚泥です。 この消化汚泥に硫酸やクエン酸などの酸を加えることで、リン酸を溶解させて回収します。しかし、強酸である硫酸は施設の腐食や重金属の溶出が懸念され、クエン酸は有機物負荷による水質汚染の可能性があります。 消化処理自体もメタン発生による温室効果の問題を抱えているため、リン回収だけでなく、汚泥肥料としての活用など、包括的な解決策が求められています。

 

炎光光度法でマグネシウムを測定しないのは何故か?

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炎光光度法でマグネシウムを測定しない理由は、マグネシウムが発する光が人の目で見えない紫外線であるためです。マグネシウムの炎色反応の波長は285.2nmと、可視光線の範囲外です。一方、炎光光度法で測定されるカリウムは766.5nmと、可視光線の赤色の範囲に収まります。 マグネシウムは燃焼すると強い白色光を発しますが、これは燃焼力が強いためであり、炎色反応とは異なる現象です。マグネシウムは光合成において重要な葉緑素の中心に位置していますが、その発熱力との関連は明らかではありません。

 

疲労回復でBCAAの摂取が挙がる理由を知りたい

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BCAA (分岐鎖アミノ酸)は、筋肉のエネルギー源となり、運動中の筋肉の分解を抑える効果があります。運動でBCAAが不足すると、筋肉が分解されてエネルギーとして使われてしまうため、疲労感が増します。 BCAAを摂取することで、筋肉のエネルギー源を補給し、筋肉の分解を防ぐことができるため、疲労回復効果が期待できます。また、運動後の筋肉痛の軽減にも効果があると言われています。

 

稲作でカリウムの施肥を減らして、二酸化炭素の排出量の削減に貢献

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農研機構の研究報告によると、稲作でカリウム施肥を減らすと、イネが土壌鉱物を分解し難分解性炭素が土中に蓄積される。これにより土壌の物理・化学性が改善され、翌年の収量・品質向上が期待できる。同時に土壌がCO2を吸収・固定し、地球温暖化対策に貢献。中干し時の土のひび割れも抑制され、環境負荷が低減されるため、持続可能な稲作には「土作り」が重要となる。

 

トマトにケイ素を施用した時の効果を考えてみる

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トマトへのケイ素施用は、葉内マンガンの均一化を通じて光合成効率向上に寄与する可能性がある。マンガン過剰による活性酸素発生と葉の壊死、マンガン欠乏による光合成初期反応の阻害という問題をケイ素が軽減する。キュウリで確認されたこの効果がトマトにも適用されれば、グルタチオン施用時と同様に光合成産物の移動量増加、ひいては果実への養分濃縮につながる。つまり、「木をいじめる」ストレス技術に頼らずとも、ケイ素によって果実品質向上を図れる可能性がある。

 

牛糞で土作りをした時の弊害をまとめてみると

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兵庫の進学校の高校生に肥料の話をした著者は、窒素肥料を減らして炭素資材を増やす土作りを提案した。生徒は土壌中の炭素の役割を理解し、微生物の餌となり土壌構造を改善することを説明できた。しかし、窒素肥料を減らすことによる収量減を懸念し、慣行農法との比較で収量が減らない具体的な方法を質問した。著者は、土壌の炭素貯留で肥料コストが下がり収量が上がる海外の事例を挙げ、炭素資材の種類や施用量、土壌微生物の活性化、適切な窒素肥料量の見極めなど、具体的な方法を説明する必要性を認識した。生徒の疑問は、慣行農法に慣れた農家にも共通するもので、新たな土作りを広めるには、具体的な成功事例と収量への影響に関するデータが重要であることを示唆している。

 

水田の鉄還元細菌が行っている詳細を知りたい

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水田の鉄還元細菌は、Fe₂O₃を還元し、鉄イオン(Fe²⁺)を水に溶出させる。この際、酸素は発生せず、水と二酸化炭素が生成される。溶出したFe²⁺は、イネの光合成や微生物の電子供与体として利用される。一方で、水田表面では、酸素とFe²⁺が反応し、土壌表面に灰色の堆積物を生成するなど、水田環境に影響を与えている。

 

キノコで食品軟化

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ブナシメジに含まれる酵素が豚肉を柔らかくする効果を持つという研究報告を紹介。この酵素は60℃以上で失活し、40℃でも活性が低下する。一般的な鍋料理では、キノコを煮込んだ後に豚肉を入れるため、酵素の軟化作用は期待できない。より柔らかい豚肉を鍋で食べるには、下ごしらえ段階で豚肉とキノコを接触させる必要がある。この酵素の働きは、窒素肥料過剰と稲の葉の関係性についての考察にも繋がる可能性がある。

 

SOY CMSのブログとOpenStreetMapで地図アプリを作ろう

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SOY CMSのブログとOpenStreetMapで地図アプリを作る手順は以下の通り。カスタムサーチフィールドで緯度(lat)・経度(lng)フィールドを作成し、地図ラベルを設定。地図出力ページを作成し、OpenStreetMap + LeafletのHTMLを貼り付ける。JavaScript内のマーカー情報をSOY CMSのタグに置き換え、記事タイトル、URL、緯度経度を動的に表示。標準ページに地図ラベルの記事一覧を表示する設定を行い、緯度経度情報付きの記事を投稿すれば、記事の位置にマーカーが設置された地図が自動的に生成される。

 

WordPressのデータベースのスキーマを調べる

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WordPressからのデータ抽出のため、データベーススキーマのバージョン調査を行った。テーブル名は`wp-includes/wp-db.php`に定義されており、バージョン2.5.0から変更がない。テーブルスキーマは`wp-admin/includes/schema.php`にSQLで定義され、バージョン3.3.0から変更がないことがわかった。よって、データ抽出ツールはWordPress 3.3.0以降に対応させ、それ以前のバージョンはアップグレードしてから利用するよう条件付けすれば良い。

 

データ構造のキューとリングバッファを見る

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Go言語のテスト方法に関する記事の要約です。Goでは`*_test.go`ファイルにテスト関数を記述します。テスト関数は`TestXxx`という命名規則に従い、`*testing.T`を引数に取ります。`t.Error`や`t.Errorf`でテスト失敗を報告し、`t.Log`でログを出力します。`go test`コマンドでテストを実行でき、`-v`オプションで詳細表示、`-cover`でカバレッジ計測が可能です。記事では具体的なテスト例として、文字列の等価性チェックやエラーハンドリングのテストが紹介されています。また、外部パッケージのテストやテストデータの扱いについても触れられています。

 

字句解析器を作る為にデータ構造のスタックを見る

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Go言語のテスト方法を解説した記事の要約です。Goでは`*_test.go`ファイルにテスト関数を記述します。テスト関数は`Test*`という名前で、`*testing.T`を引数に取ります。`t.Error`や`t.Errorf`でテスト失敗を報告、`t.Log`でログ出力、`t.Run`でサブテストを実行できます。`go test`コマンドでテストを実行し、カバレッジは`go test -cover`で確認できます。記事では具体的な例として、加算関数`Add`のテストコードを`add_test.go`に記述し、正常系と異常系のテストケースを実行する方法を紹介しています。また、テーブル駆動テストを用いて複数のテストケースを簡潔に記述する方法も説明しています。

 

リン酸欠乏で葉が赤や紫になることを考えてみる

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リン酸欠乏で葉が赤や紫になるのは、アントシアニンが蓄積されるため。疑問は、リン酸不足でエネルギー不足なのにアントシアニン合成が可能かという点。 紅葉では、離層形成で糖が葉に蓄積し、日光でアントシアニンが合成される。イチゴも同様の仕組みで着色する。 アントシアニンはアントシアン(フラボノイド)の配糖体。フラボノイドは紫外線防御のため常時存在し、リン酸欠乏で余剰糖と結合すると考えられる。 リン酸欠乏ではATP合成が抑制され、糖の消費が減少。過剰な活性酸素発生を防ぐため解糖系は抑制され、反応性の高い糖はフラボノイドと結合しアントシアニンとなる。

 

ケイ酸苦土肥料から稲作を模索する

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稲作において、カルシウム過剰を避けつつ苦土を補給できる「ケイ酸苦土」が推奨されます。重要なのは、植物が利用できるケイ酸が、石英のような風化しにくいものと異なり、風化しやすいケイ酸塩鉱物である点です。ケイ酸苦土の原料である蛇紋岩は、風化しやすいかんらん石から変質した蛇紋石を主成分とします。蛇紋岩が豊富な上流からの水が、非コンクリート水路を通じて田んぼに供給される環境であれば、猛暑下でも稲の登熟不良を防ぐ効果が期待されます。しかし、このような理想的な自然環境は、広範な水田地域では稀であると結論付けています。

 

郵便番号を入力したら半径3km内のすべての町名を取得する

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Google Geocoding APIを用いて、指定住所(安岡寺)から半径3km以内の町名を取得する方法を検証した。APIで中心座標を取得後、緯度経度を0.01(約1km)ずつずらした地点の逆ジオコーディングを繰り返し、町名を収集した。しかし、1kmグリッドでは範囲内の全町名を網羅できず、グリッドを細かくするとAPI使用回数が増加する問題点が残った。より効率的な方法の検討が必要。

 

ブルーチーズ用のアオカビの増殖はパンを利用する

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ブルーチーズの製造過程、特にロックフォールにおけるアオカビ( *P. roqueforti* )の採取方法に焦点が当てられている。ロックフォールでは、洞窟内で大麦と小麦のパンにアオカビを生育させ、内部に繁殖したカビから胞子を得る。記事では、パン内部の隙間がカビの増殖に適した環境である可能性、パンの組成とカビの生育の関係、そしてパンがカビやすい食品であるが故に、カビの生態を理解する上で重要な知見となり得る点が考察されている。

 

ポリフェノールの二つの効能

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ウィルス感染症への正しい恐怖を持つには、十分な知見が必要です。ウイルスは変異しやすく、感染経路や重症化リスクも多様で、未知のウイルスも存在します。過去の感染症の歴史から学ぶことは重要ですが、現代社会の構造変化やグローバル化は新たな感染症リスクを生みます。そのため、過去の経験だけで未来の感染症を予測することは困難です。正確な情報収集と科学的根拠に基づいた対策、そして未知への備えが重要です。過剰な恐怖に陥ることなく、冷静な対応と適切な知識の習得が、ウイルス感染症への正しい恐怖へと繋がります。

 

ナチュラルチーズとは何だろう?

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ナチュラルチーズは、牛乳にレンネットや酸を加えて凝固させたカードを原料とする。レンネットは仔牛の胃から得られる酵素で、牛乳のタンパク質カゼインを凝固させる役割を持つ。カードを加熱・圧搾し、様々な菌で熟成させることで多様なチーズが作られる。熟成によりタンパク質や脂質が分解され、チーズ特有の風味と味が生まれる。青カビチーズやエメンタールチーズなど、熟成に用いる菌によって風味は異なる。ナチュラルチーズはそのまま食べられる他、プロセスチーズの原料にもなる。

 

フェニルプロパノイド類が血糖値の上昇を緩やかにするはず

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施肥設計の見直しで農薬防除の回数を減らせるという記事は、窒素過多による作物の徒長が病害虫発生の主要因であると指摘しています。窒素過多は細胞壁を薄くし、害虫の侵入を容易にする上、アミノ酸合成に偏り、病害虫抵抗性物質の生成を阻害します。適切なカリウム、カルシウム、マグネシウムなどの施肥は細胞壁を強化し、病害虫への抵抗力を高めます。また、微量要素の不足も抵抗力低下につながるため、土壌分析に基づいたバランスの取れた施肥設計が重要です。これにより、作物の健全な生育を促進し、農薬への依存度を減らすことが可能になります。

 

真核藻類の誕生

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植物にはビタミンB12がない一方で、海苔などの藻類には豊富に含まれる。藻類の起源を探るため、細胞内共生説を概観する。 酸素発生型光合成を行う細菌や酸素呼吸を行う細菌が登場した後、ある古細菌が呼吸を行う細菌を取り込みミトコンドリアを獲得し、真核生物へと進化した。さらに、真核生物の一部は光合成を行う細菌を取り込み葉緑体を得て、灰色藻のような真核藻類となった。この真核生物が他の細菌を取り込んで共生する現象を一次共生と呼ぶ。 海苔のビタミンB12の謎を解く鍵は、このような藻類誕生の過程に隠されていると考えられる。

 

ビタミンB3のナイアシン

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藍藻から発見された7-デオキシ-セドヘプツロース(7dSh)は、植物の芳香族アミノ酸などの合成経路であるシキミ酸経路を阻害する糖である。シキミ酸経路は植物や微生物に存在するが、動物には存在しないため、この経路を標的とすることで、植物特異的な作用を持つ除草剤の開発が可能となる。7dShは、シキミ酸経路の酵素である3-デオキシ-D-アラビノ-ヘプツロソネート7-リン酸合成酵素(DAH7PS)を阻害することで、芳香族アミノ酸、ビタミン、植物ホルモンなどの合成を阻害し、最終的に植物の生育を阻害する。これは、新たな作用機序を持つ除草剤開発の糸口となる可能性がある。

 

酸素発生型光合成の誕生の前に

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藻類の進化に関する書籍を元に、酸素発生型光合成誕生以前の生命活動について考察。太古の海ではFe²⁺イオンによる過酸化水素発生が頻繁に起こり、生物は自己防衛のため過酸化水素を分解するカタラーゼを獲得した。カタラーゼはマンガンを補酵素として利用する。後に酸素発生型光合成を担うマンガンクラスターもマンガンを利用しており、水から電子を取り出す構造がカタラーゼと類似していることから、レーンの仮説では、カタラーゼから光合成の機能が進化した可能性を示唆。仮説の真偽は今後の研究課題だが、マンガンが光合成において重要な役割を持つことは明らかである。

 

酸素供給剤が効く時に働く酵素

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酸素供給剤は過酸化石灰から発生する過酸化水素がカタラーゼ酵素によって酸素と水に分解されることで効果を発揮する。カタラーゼは、過酸化水素を酸化し電子を受け取ることで無害化する。この反応において、カタラーゼの補酵素としてヘムとマンガンが機能し、電子を受け取る役割を果たす。つまり、マンガンが欠乏しているとカタラーゼの働きが弱まり、酸素供給剤の効果が十分に発揮されない可能性がある。オキシドールのような過酸化水素を主成分とする消毒液も同様のメカニズムで効果を発揮するため、マンガンは重要な役割を担っている。

 

糠漬けで豊富に含まれるビタミンB1

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糠漬けで増加するビタミンB1は、糖質やアミノ酸からのエネルギー産生に必須の補酵素チアミンの構成要素となる。チアミンは通常、食物中の酵素と結合した状態で存在し、加熱によって遊離する。米ぬかにビタミンB1が豊富なのは、種子の発芽・成長に必要なエネルギー源を確保するためである。親は子である種子に、米ぬかという形で豊富な栄養、特にエネルギー産生に不可欠なビタミンB1を蓄え、発芽時の成長を助ける。

 

酵母でのアセトアルデヒドの耐性

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石灰窒素の成分シアナミドは生物にアセトアルデヒドを蓄積させ、毒性を示す。酵母はこの毒性に対し、①NADPHを用いたオレイン酸増加、②グルタチオンによるアセトアルデヒド回収、という二つの防御策を持つ。①は糖からのエネルギー産生を抑制し、代わりにNADPH合成経路を活性化、オレイン酸を増やすことで耐性を得る。②はグルタチオンがアセトアルデヒドと結合し無毒化する。アセトアルデヒドはタンパク質とも結合し、重要な生理機能を阻害、死滅に至る可能性もある。

 

Go言語とQtで計算フォームを作成してみる

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Go言語とQtでアルバイト給与計算フォームを作成。時給と時間を入力すると、合計金額が自動計算される。 QLineEditで入力値を取得し、strconv.Atoiで数値に変換、掛け算後、strconv.Itoaで文字列に戻し、goukeiInputに表示。入力値の変更を検知するために、jikanInputとjikyuuInputにConnectEditingFinishedを使い、calcAndInsert関数を呼び出している。 Clear()で以前の結果を消去してからInsert()で新しい結果を表示することで、値の更新を正しく行う工夫もされている。

 

光合成の明反応-後編

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光合成の明反応後編では、電子伝達系に関わる物質の詳細が説明されている。シトクロムb6f複合体にはヘム鉄を含むシトクロムが、プラストシアニンには銅が、フィレドキシンには鉄-硫黄クラスターが含まれ、それぞれ電子の運搬役を担う。これらの物質の合成にはグルタミン、マグネシウム、二価鉄、マンガン、カルシウム、硫黄などが必要となる。特に、これまで注目されてこなかった二価鉄の重要性が示唆されている。

 

JavaScriptのAnalyzerNodeで拾った音の周波数を可視化してみる1

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この記事は、JavaScriptで音の周波数を可視化する方法を学ぶための導入部分です。音のデジタル化に不可欠なフーリエ変換の概念を、三角関数のグラフを用いて分かりやすく解説しています。sin波、cos波、そしてそれらの合成波のグラフを示し、複雑な波形も三角関数の組み合わせで表現できることを説明。式の係数を配列データとして取り出すことで、音をデジタルデータとして扱えるようになることを示しています。最後に、高速フーリエ変換(FFT)に触れ、次回JavaScriptでの実装を示唆しています。記事には、HTML5 Canvasを使ったsin波を描画するコード例も掲載されています。

 

光合成の明反応-前編

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この記事では、光合成の明反応に関わる必須元素を解説しています。明反応は、水から電子を取り出しNADPHを生成する過程で、マンガンクラスターが水の分解にマンガンを必要とすることを説明しています。さらに、光化学系ⅠとⅡではクロロフィルが光エネルギーを吸収するためにマグネシウムが必須であることを述べています。加えて、高エネルギー反応に伴う活性酸素対策としてカロテノイドが存在し、βカロテンは炭素と水素のみで構成されていると補足しています。これらの元素の供給が光合成、ひいては植物の生育に不可欠であることを示唆しています。

 

SQLiteでデータを入れて取り出してみる

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Windows 10 で SQLite を使い、データを操作する方法を解説しています。SQLite をダウンロード、インストールし、環境変数を設定後、コマンドプロンプトでデータベースファイル(sample.db)を作成します。SQL文を用いて、テーブル作成、データ挿入、削除、並び替え、表示など基本操作を例示しています。`CREATE TABLE` でテーブルを作り、`INSERT INTO` でデータ挿入、`SELECT * FROM` で全データ表示、`DELETE FROM` でデータ削除、`ORDER BY` で並び替え、`LIMIT` で表示件数制限を行います。DB Browser for SQLite での確認方法にも触れています。

 

SOY CMSを介さずにSOY2DAOを使ってみる2

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SOY CMSを使わずにSOY2DAOでSQLを実行し、オブジェクトで結果を取得する方法を解説しています。 独自SQLの実行には`executeQuery()`ではなく`executeObjectQuery()`を使用します。`executeObjectQuery()`の第一引数にSQL文、第二引数にDAOクラス名を指定します。戻り値は指定したクラスのオブジェクト、もしくはオブジェクトの配列となります。記事では、`SOY2Sample`クラスと対応するテーブル`soy2_sample`を例に、`id`と`text`を取得するSQLを実行し、結果を`SOY2Sample`オブジェクトの配列として受け取る方法をコード付きで示しています。これにより、データベースから取得したデータをオブジェクトとして扱いやすくなります。

 

SOY CMSを介さずにSOY2DAOを使ってみる1

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SOY CMSを使わずにSOY2DAOを単体で利用する方法を紹介。SQLiteのインメモリデータベースを例に、テーブル作成、データ挿入、検索のコードを記述。WEBAPP_DIRの定義、SOY2のinclude、RootDir設定、SOY2DAOConfigによるDSN設定を行い、SOY2DAOでSQLを実行。結果として、挿入したデータが期待通りに取得できることを確認。次回はDAO本来の機能を探る。

 

とある籾殻が敷かれた通路の上での戦い

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籾殻が敷かれた通路に生えるキノコは、他の菌類との生存競争を繰り広げている。籾殻は保水性と通気性を高め、キノコにとって有利な環境を作り出す。特に、窒素が少なくグルコースが多い環境で優位となる。 鶏糞などの施肥はこの環境を一変させる可能性がある。窒素が増えることで、キノコは競争に敗れ、分解しやすいセルロースは消費され、分解しにくいリグニンが残るかもしれない。 いずれにせよ、菌類によるセルロース分解は熱を発生させるため、地温上昇は避けられない。知識を持つことで、一見ただのキノコも、微生物間の攻防という新たな視点で見ることができる。

 

スベリヒユの持つCAM回路

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牛糞堆肥の土壌改良効果を植物ホルモンの視点から考察した記事です。窒素過多による植物の徒長や病害虫発生リスクを指摘し、牛糞堆肥の緩やかな窒素供給が健全な生育を促すと説明しています。特に、植物ホルモンのサイトカイニン、オーキシン、ジベレリンのバランスが重要で、牛糞堆肥は土壌微生物の活性化を通じてこれらのバランスを整え、根の成長、栄養吸収、ストレス耐性を向上させると主張しています。化学肥料の多用は土壌の劣化につながる一方、牛糞堆肥は持続可能な農業に貢献するとして、その価値を再評価しています。

 

Go言語でhtmlからの文字の部分的取得

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Go言語でWebページから本文を抽出するプログラムの説明です。`https://saitodev.co/article/%E3%83%A4%E3%83%96%E3%82%AC%E3%83%A9%E3%82%B7%E3%81%AE%E5%9F%B7%E5%BF%B5` から、`<div class="post-content">` と `<!-- .post-content -->` で囲まれた本文を抽出します。 `bufio.NewReader` でHTMLを一行ずつ読み込み、`strings.Index` で "post-content" を検索。開始タグを見つけたら `readMode` フラグをtrueにして本文を `content` 変数に蓄積、終了タグを見つけたらループを抜けます。抽出した本文は `test.html` ファイルに保存されます。

 

トチノキの実の灰あわせ

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トチノキの実はサポニンが多く含まれ毒性を持つが、デンプンが豊富で、灰汁を使ったアク抜きにより食用となる。この「灰あわせ」は、実を水に浸した後、灰汁に浸すことでサポニンを溶出させる方法。灰汁のアルカリ性がサポニンの遊離を促す。この発見により雪国での永住が可能になった。灰は植物の金属系養分の酸化物塩や炭酸塩で、水に溶かすとアルカリ性を示す。薪を燃やした残りの灰には、リグニンなど木の成分が含まれている可能性がある。

 

地衣類という菌たちの巧みな生き方

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地衣類は、光合成を行うシアノバクテリアまたは緑藻と共生している菌類です。地衣類は、菌が光合成生物に必要な栄養を提供し、光合成生物が合成した産物を菌に返します。この共生関係により、地衣類は木の幹などの栄養分に乏しい環境でも生存できます。 地衣類の光合成にはマンガンが必要ですが、地衣類は宿主からマンガンを吸収していると考えられます。これは、死んだ幹に残った微量元素を活用している可能性を示唆しています。つまり、地衣類は木の残りを再利用することで、山の生態系における栄養循環に貢献している可能性があります。

 

php-webdriverでTinyMCEに値を挿入する

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php-webdriverを使用して、TinyMCEエディタに値を入力するには、iframeに切り替えてから入力し、その後親フレームに戻す必要があります。値を取得するには、再度iframeに切り替えてからテキストを取得し、親フレームに戻します。具体的には、`driver->switchTo()->frame()`と`driver->switchTo()->defaultContent()`を使用します。

 

SOY2HTMLで繰り返し表示 - HTMLList編

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SOY CMSのブロック内で繰り返し表示される記事に、一定の間隔で任意の文字列を表示するには、下記の手順に従います。 1. HTMLListクラスを継承したPHPクラスを作成し、populateItemメソッドで表示したい内容をHTMLタグで記述します。 2. HTMLファイルで、populateItemメソッドで作成したHTMLタグをsoy:idを使用して囲みます。 3. 表示する間隔をsoy:id="loop"に指定します。 4. 表示する文字列をsoy:id="index"に指定します。 これで、指定した間隔で任意の文字列が繰り返し表示されます。

 

SOY Shopの各種プラグインの設定を保存する方法

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SOY Shopのプラグイン設定を保存するには、SOYShop_DataSetsクラスのputメソッドを使用します。キーバリューストアのようにデータを保存でき、配列もシリアライズして文字列として保存できます。データの取得はgetメソッドで行い、指定したキーに対応する値を取り出します。第二引数で値がなかった場合の代替値を指定することも可能です。

 

果実の熟成と活性酸素の働き

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果実の熟成における活性酸素の役割は、着色と種子の休眠という二つの側面を持つ。アントシアニン色素の蓄積は、光合成過程で発生する過剰な活性酸素を抑制する反応として起こる。一方、果実内の種子の休眠には、適切な量の活性酸素が必要となる。活性酸素の不足は、果実内発芽を引き起こす。メロンの場合、硝酸態窒素過多やカリウム不足が活性酸素の発生量を低下させ、果実内発芽につながる。イチゴも同様のメカニズムを持つと仮定すると、高品質な果実生産には、生育段階に応じた適切な施肥管理と、熟成期の環境制御が重要となる。

 

葉でアントシアニンを蓄積させる意味

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植物の葉がアントシアニンを蓄積するのは、ストレス環境下で光合成のバランスを調整するためです。強光下などストレス環境では、光合成の明反応は進む一方、暗反応が抑制されます。すると、明反応で生じた電子が過剰となり活性酸素が発生しやすくなります。アントシアニンは濃い色素として光を吸収し、明反応を抑制することで活性酸素の発生を防ぐフィルターの役割を果たします。これは、果実の成熟時にアントシアニンが蓄積されるのとは別のメカニズムです。

 

SOY CMSの開発秘話後編

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SOY CMSはデザイナとプログラマの完全分業を目指し、機能はHTMLコメントタグの`<!-- cms:id="..." -->`に集約。これによりCMSを介さずともデザインが崩れず、改修コストを大幅削減。デザイナはPHP/SQLを触れずに済む一方、PHP記述許可モードで複雑な表示も可能に。不要な複雑さを排除し、クリエイティブな活動に注力させる開発理念が込められている。

 

Google Apps ScriptでJPEGの画像からOCRで画像内の文字列を取得してみた

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Google Apps ScriptでJPEG画像からOCRで文字列を取得する方法を検証。GoogleドキュメントでのOCRをGASで自動化する方法を紹介している。 Drive APIを有効化し、画像URLを指定して`Drive.Files.insert`メソッドでGoogleドライブに挿入、`ocr:true`オプションでOCRを実行。 生成されたGoogleドキュメントには画像とOCR結果のテキストが含まれる。日付や画像中の文字認識は難しいが、本文は高精度で取得できた。以前試したGoogleドキュメント直接OCRより精度は高い。

 

SOY Shopの管理画面の注文一覧ページで表示速度周りを改修しています

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SOY Shopの管理画面、特に注文一覧ページの表示速度改善に取り組んでいます。月商数千万円規模のショップで顕著になる速度低下の原因となっていた、顧客名表示等の処理をDAO経由からSQL直書きに変更。顧客情報全体を取得する代わりに必要な名前だけをデータベースから取得することで、処理を効率化しました。他にも例外処理の見直しやテストコードによるエラー修正を行い、体感できる速度改善を実現。今後も処理速度の改善を継続し、最新版はサイトからダウンロード可能です。

 

セリンの生合成

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光合成で生成されたグルコースは解糖系に入り、様々な物質に変換される。その中には、様々なアミノ酸の生合成に関わる中間体も含まれる。例えば、3-ホスホグリセリン酸はセリン、ピルビン酸はアラニン、アセチルCoAはロイシンなどの前駆体となる。さらに、クエン酸回路の中間体であるα-ケトグルタル酸はグルタミン酸へと変換され、そこから他のアミノ酸も合成される。つまり、光合成で得られた炭素骨格は、様々な経路を経てアミノ酸の生合成に利用されている。

 

物理障害のディスクのデータの復旧に挑戦

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デジカメの写真を誤って消去した場合の復旧ツールとして、PhotoRecが紹介されている。PhotoRecは、ファイルシステムを無視してデータ自体をスキャンするため、フォーマット後やファイルシステムが破損している場合でも復旧が可能。使い方は、PhotoRecをダウンロードし、対象のドライブを選択、保存先を指定するだけ。ファイルの種類を絞り込むこともでき、復旧率向上に繋がる。JPEGだけでなく、様々なファイル形式に対応しているため、デジカメ以外の機器でも活用できる。操作はコマンドラインベースだが、GUI版のQPhotoRecも用意されている。誤削除に気づいたらすぐに使用することで、上書きされる可能性を減らし、復旧率を高めることができる。

 

ハードディスクが壊れる日は突然やってくる

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外付けHDDの読み込み速度低下をきっかけに、ハードディスクの物理障害について調べた体験談。HDDケースに収納した古い1TB HDDの動作が不安定になり、業者に調べてもらった結果、物理障害と判明。論理障害と異なり物理障害はデータ復旧が困難なため、HDDの構造を理解する重要性を説く。記事ではHDDの磁気ディスクと磁気ヘッダの役割、そして物理障害の原因として磁気ヘッダの破損と磁気ディスクの劣化を挙げる。今回のケースは後者の可能性が高く、実際に取り出した画像データが破損していた。この経験から、複数のHDDを用いたバックアップの重要性を改めて強調している。

 

ハーバー・ボッシュ法と緑の革命

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緑の革命(1940~60年代)は、農薬、灌漑、合成窒素肥料、品種改良といった技術を発展途上国に広め、劇的な食糧増産を達成しました。中でもハーバー・ボッシュ法は、空気中の窒素からアンモニアを合成することを可能にし、肥料生産に革命をもたらしました。窒素ガス(N₂)と水素(H₂)からアンモニア(NH₃)を合成するこの方法は、高温高圧下で反応を進めることで、安定した窒素分子の三重結合を切断します。こうして得られたアンモニアは、硫安などの肥料の原料となり、植物の生育に不可欠な窒素を供給できるようになりました。この技術革新は、緑の革命の根幹を支え、世界的な人口増加を支える食糧生産を可能にしました。

 

SOY2DAOでトランザクションを利用する

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SOY2DAOではトランザクション処理が可能です。トランザクションを使用することで、複数のSQL文をまとめて実行し、処理に失敗した場合に一連の変更をすべて取り消すことができます。 トランザクションを開始するにはbegin()メソッドを使用し、終了するにはcommit()メソッドを使用します。処理中にエラーが発生した場合は、successedフラグをfalseに設定し、処理をロールバックします。 これにより、複数の処理が確実に実行されることが保証され、データの一貫性が維持されます。

 

SOY2DAOでSQLを実行して、オブジェクトで返す

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SOY2DAOで複雑なSQLを実行しつつ、結果をオブジェクトで取得する方法が紹介されています。顧客テーブルとカスタムフィールドテーブルを結合し、特定のカスタムフィールド値を持つ顧客情報を取得する例が示されています。 `SOYShop_UserDAO` の `executeQuery` でSQLを実行し、結果の配列をループ処理で `getObject` メソッドに渡すことで、各レコードが `SOYShop_User` オブジェクトに変換されます。これにより、カスタムフィールドの値で検索しながら、必要な顧客情報のみをオブジェクトとして扱いやすく取得できます。この手法は、以前紹介されたSOY CMSの検索フォーム追加の記事でも活用されています。

 

SOY2DAOでデータベースから値を取り出す

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SOY2DAOを用いたデータベースからの値の取得方法を解説。プリペアードステートメントに続き、今回はDAOの機能を活用した取得方法を紹介。SOY Shopの顧客情報を例に、`SOY2DAOFactory::create("user.SOYShop_UserDAO")` でDAOオブジェクトを生成し、`$userDao->get()` でデータを取得する様子をコードで示す。取得したデータはSOYShop_Userオブジェクトの配列となり、`$user->getName()` のようにゲッターメソッドで簡単に値にアクセスできる。SQL直接実行の場合と比べ、オブジェクト指向の恩恵で可読性・安全性が向上する点を強調。最後に、SQL実行結果もオブジェクトで扱いたいケースへの言及で締めくくっている。

 

アグロバクテリウム法で作物の遺伝子組み換え

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アグロバクテリウム法による作物遺伝子組み換えは、同細菌のプラスミドを利用する。まずプラスミドから毒性遺伝子を除去し、目的遺伝子と薬剤耐性遺伝子を挿入する。改変プラスミドをエレクトロポレーション法でアグロバクテリウムに導入後、作物に感染させる。感染部位をカルス化させ、シャーレ上で培養しクローン植物を育てる。実際には煩雑なため、この方法は行われておらず、より簡便な手法が存在する。

 

糖の万能性

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この記事では、植物が持つ繊毛の役割と、その構成成分について考察しています。植物は光合成で生成したグルコースを元にセルロースやデンプンといった多糖類を合成します。セルロースは植物の繊維の主成分であり、グルコースがβ1-6結合で直鎖状に連なった構造をしています。著者は、植物の繊毛もセルロースで構成されていると推測していますが、ケラチンなどのタンパク質の可能性も示唆しています。また、植物にとって糖はアミノ酸合成の原料となる重要な物質であり、アミノ酸はより貴重な資源であると述べています。繊毛の具体的な成分分析は行われていないものの、糖を原料としたセルロースで構成されている可能性が高いと推測しています。

 

SOY CMSに総当り攻撃を仕掛けてみる。その2

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Go言語でSOY CMSへの総当り攻撃コードを改良した。前回はトークンチェックで攻撃が無効化されたため、今回はトークン取得とセッションキー保持の処理を追加した。具体的には、ログインページからトークン値を抽出し、自作のCookieJarを用いてセッションキーを保持することで、正規のログインと同様にトークンを送信できるようにした。この改良により、辞書攻撃が可能になった。 最後に、管理画面URLの特定の容易性と攻撃のしやすさを指摘し、URLを複雑にする、IDを辞書攻撃されにくいものにするなどの対策の必要性を訴えている。

 

EC CUBEからSOY Shopにデータベースを引っ越す

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EC-CUBEの動作遅延に悩むユーザーが増加し、高速なSOY Shopへの移行ニーズが高まっている。そこでEC-CUBEからSOY Shopへのデータ移行プラグインが開発された。このプラグインはEC-CUBEのデータベースから直接データを読み込み、SOY Shop用に変換・挿入する。パスワードはセキュリティ上、ランダムに設定され、ユーザーには再設定を促すメルマガ送信が推奨される。EC-CUBE2系と3系のデータ移行実績があり、フォーラムで配布されている。

 

電子伝達系でATPをたくさん作る

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クエン酸回路で生成されたNADH<sub>2</sub><sup>+</sup>を利用し、ミトコンドリアの電子伝達系で大量のATPが合成される。葉緑体と同様にプロトン駆動力を使うが、ミトコンドリア内膜の内外でH+を移動させる点が異なる。NADHの電子を用いてH+を膜の外へ放出し、ATP合成酵素を通して内側に戻す際に生じるエネルギーでATPを生成する。これで糖からエネルギーを取り出す過程が完了し、全体の反応式C<sub>6</sub>H<sub>12</sub>O<sub>6</sub> + 6O<sub>2</sub> + 38ADP → 6H<sub>2</sub>O + 6CO<sub>2</sub> + 38ATPとも一致する。

 

クエン酸回路で電子をたくさん得る

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解糖系で生成されたピルビン酸は、ミトコンドリア内でクエン酸回路に入り、電子を放出する。この回路では、ケトグルタル酸など様々な有機酸を経由し、NADH₂⁺の形で電子を取り出す。ケトグルタル酸は植物のアミノ酸合成にも利用される物質である。つまり、植物はクエン酸回路で生成される有機酸をアミノ酸合成にも活用している。そのため、糖をアミノ酸合成に利用する植物にとって、アミノ酸を直接吸収する能力は大きなメリットとなる。

 

葉緑体は光合成に使用するATPを自前で用意する

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葉緑体は光合成で水を分解し、電子を取り出す過程で酸素と水素イオン(H⁺)を生成する。電子はNADPHに蓄えられ、後のブドウ糖合成に使われる。一方、H⁺は葉緑体内のATP合成酵素を通過する際に生じるプロトン駆動力によってADPからATPを生成する。このATPは、二酸化炭素からブドウ糖を合成する暗反応で使われ、光合成全体の反応が完結する。つまり、葉緑体は光エネルギーを利用して水を分解し、電子とH⁺からそれぞれNADPHとATPを作り、ブドウ糖合成に必要なエネルギーを自前で供給している。

 

植物は水から得た電子をどうやって蓄えている?

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植物は光合成の明反応で水から電子を取り出し、NADPHの形で蓄える。暗反応(カルビン・ベンソン回路)では、二酸化炭素からブドウ糖を合成する際に、このNADPHから電子が有機酸に渡される。結果として、ブドウ糖には水由来の電子が蓄えられることになる。生物はエネルギーが必要な時、このブドウ糖を分解することで電子を取り出し利用する。つまり、ブドウ糖は電子の貯蔵形態として機能している。

 

ちょいと光合成の話でも

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光合成の明反応は、光エネルギーを使って水分子を分解し、化学エネルギーを生成する過程です。葉緑体のチラコイド膜上で起こり、光化学系IIと光化学系Iという二つの光化学系が関与します。 まず、光化学系IIにおいて光エネルギーがクロロフィルに吸収され、水が分解されて電子、プロトン(H⁺)、そして酸素が生成されます。電子は電子伝達系を移動する過程でエネルギーを放出し、プロトンはチラコイドルーメンに汲み上げられます。このプロトン濃度勾配を利用してATP合成酵素がATPを合成します。 次に、光化学系Iでは再び光エネルギーがクロロフィルに吸収され、電子が再び励起されます。この電子は最終的にNADP⁺に渡され、NADPHが生成されます。生成されたATPとNADPHは、続く暗反応で二酸化炭素から糖を合成するために利用されます。

 

葉緑素の合成で苦土と同じぐらい大事なものは?

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鉄は葉緑素合成に必須のアミノレブリン酸生成に不可欠な要素である。土壌中に豊富に存在すると言われる鉄だが、過剰な炭素循環型農法では欠乏症による枯死も発生する。鉄吸収には、三価鉄を二価鉄に還元して吸収するストラテジーⅠ型と、三価鉄をキレートして吸収するストラテジーⅡ型がある。ストラテジーⅠ型では根の表面の還元酵素が利用される。植物は光合成で水から電子を得るが、鉄吸収にも電子が必要となる。鉄は日中に得た電子のプールとして機能し、鉄欠乏は電子の取りこぼしにつながる可能性がある。つまり、鉄吸収は光合成と密接に関連している。土壌の還元も鉄吸収に影響を与える。

 

ダイコンが去った後のこと

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大根を収穫した後の深い穴に、数日後、新しい命が芽生えていた。土から出た大根の根元部分の写真に続き、収穫後の穴、そしてその穴に発芽した草の写真が添えられている。発芽したばかりの双葉は、まだ種皮を被っており、誕生の瞬間を捉えた感動が表現されている。たくましい雑草の生命力に驚き、新しい生命の誕生を祝福している。

 

続・アンモニア臭は酸化で消そう

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アンモニア酸化細菌がアンモニアを亜硝酸に酸化し、さらに亜硝酸酸化細菌が亜硝酸を硝酸に酸化する一連の反応を硝化作用という。生物は物質を酸化し電子を得ることでエネルギーを産生する。アンモニア酸化でも細菌は電子を得て活動しており、有機物の分解によるエネルギー産生は酸化的リン酸化と呼ばれる。生物は電子を欲しがるため、還元されたアンモニアは誰が作ったのかという疑問が生じる。

 

アンモニア臭は酸化で消そう

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アンモニア臭の消臭方法として、酸化に着目。プロピオン酸のように塩にするのではなく、アンモニア酸化細菌の反応を参考に、アンモニアを酸化することで硝酸に変える方法を検討。アンモニアは酸化によってヒドロキシルアミン、さらに亜硝酸へと変化する。この過程で電子が放出されるため、酸化反応が成立。アンモニアが別の物質に変化することで臭いも軽減される。結論として、悪臭物質を酸素に晒すと酸化によって臭いが消える可能性がある。

 

あそこの水田から変な臭いがするよ

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水田から硫化水素による腐卵臭がするのは、老朽化水田と呼ばれる現象です。硫酸カルシウムが土壌に蓄積し、水が滞留する環境で硫酸還元細菌が活動することで発生します。通常、露地では降水で硫酸カルシウムは流出しますが、水田は水を溜めるため、特に水の入れ替えが少ないと土壌に残りやすいです。硫酸還元細菌は有機物から電子を取り出し、硫酸カルシウムと反応させて硫化水素を生成します。この現象は近年増加傾向にあり、様々な問題を引き起こしています。

 

キノコは消毒液がお好き?

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キノコはリグニンを分解する際にリグニンペルオキシダーゼ等の酵素を用いる。この酵素反応は酸化還元反応であり、リグニンペルオキシダーゼは過酸化水素から電子を受け取り、リグニンを還元する。つまり、消毒液の成分である過酸化水素がキノコの酵素活性を促す。しかし、過酸化水素は自然界で常時発生する物質なのかという疑問が生じる。

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