植物のミカタ

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本ブログ記事は、油脂酵母における脂肪酸の生合成メカニズムを解説しています。油脂酵母の培養時にキシロースを添加すると、アセチルCoAの合成量が増加し、脂肪酸合成が促進されることが示唆されています。この脂肪酸合成に関わる酵素群は、ニコチンアミドアデニンジヌクレオチドリン酸（NADPH）を重要な補酵素として利用します。NADPHは電子運搬に関与し、油脂酵母がキシロースと共にNADPHを豊富に利用できれば、脂肪酸合成がより活発になると推測。今後は、外部からの資材投入によるNADPH量増加の可能性が課題として挙げられています。

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キュウリグサを抜いた際に感じた強烈な香りの正体について、筆者が生成AI（Gemini）に質問し、その回答の一つを深掘りする記事。AIが示した香りの化合物名は「2,6-ノナジエナール」である。これは芳香性のアルデヒドで、多価不飽和脂肪酸であるリノレン酸が酸化されることで生成されることが分かった。筆者は、ウリ科のメロンの風味に関する過去記事でも同様の話題に触れたことを想起。この共通点から、ウリ科の果実が脂肪酸を多く含む傾向にあるのかという新たな考察を提示している。

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植物はニコチン酸を吸収すると、エネルギー運搬に関与するNADHなどの合成に必要な反応ステップ数を節約できるため、乾燥耐性が向上します。では、ニコチン酸吸収によって具体的に何ステップ省略できるのでしょうか？ 植物はアスパラギン酸から始まり、イミノアスパラギン酸、キノリン酸を経てニコチン酸モノヌクレオチドを合成し、最終的にNADHが生成されます。ニコチン酸はニコチン酸モノヌクレオチドからNADを経て生成されますが、今回の目的はNADH合成の省略ステップ数なので、この経路は関係しません。 現状では、ニコチン酸吸収によるNADH合成の省略ステップ数を明確にすることは難しいですが、このような視点を持つことが重要です。 なお、ナイアシン含有量が多い食品として、米ぬかとパン酵母が挙げられます。酵母が米ぬかを発酵すると、ナイアシンが大量に合成される可能性も考えられます。

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国際農林水産業研究センター（JIRCAS）の研究報告によると、ダイズやシロイヌナズナは、葉がしおれない程度の「見えない干ばつ」でもリン酸欠乏応答を示すことが分かりました。リン酸は植物の三大要素であり、軽微な欠乏でもその後の生育に大きなロスをもたらすため、この現象は看過できません。特に夏の果菜類などでは頻繁に発生しやすく、土が締まる時期に顕著です。この発見は、作物の増収には土の保水性を早期に向上させることの重要性を示唆しています。

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これからの稲作は、気候変動による水不足に対応するために、土の保水性を高めることが重要になります。従来の品種改良や窒素肥料中心の栽培では、水不足による収量低下が懸念されます。そこで、土壌中の有機物を増やし、保水力を高める土づくりが重要になります。特に、土壌微生物の活性化による団粒構造の形成が、保水性の向上に大きく貢献すると考えられます。

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ブルーベリー由来のアントシアニンは、網膜の炎症を軽減し、光受容体であるロドプシンの減少を抑制する抗酸化作用があります。これらの効果により、目の健康を維持し、視力低下を防ぐことが示唆されています。 アントシアニンは植物が光ストレスから身を守るために合成するフラボノイドの一種です。過剰な光を吸収し、活性酸素の発生によるダメージを防ぐ働きがあります。 それゆえ、ブルーベリーのサプリメントの摂取は、現代社会における青色光による光ストレスに対抗し、目の機能を維持するのに役立つ可能性があります。

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目のサプリとして知られるブルーベリー。その効能は、豊富に含まれるアントシアニンという成分が、網膜で光を認識するロドプシンという物質の再合成に関与しているためとされています。 ロドプシンは光を感知すると構造変化を起こし、その信号が脳に伝わることで視覚が生じます。その後、ロドプシンは再合成されて再び光を感知できる状態に戻ります。 ブルーベリーのアントシアニンがこの再合成を助けることで、視覚機能の維持に貢献すると考えられています。しかし、アントシアニンが具体的にどのように再合成に関与するのか、詳しいメカニズムは記事では触れられていません。

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葉の色が濃い野菜は硝酸態窒素濃度が高く、秀品率が低下する。牛糞堆肥中心から植物性堆肥に変えることで、ミズナの葉の色は薄くなり、秀品率は向上した。硝酸態窒素は植物体内でアミノ酸合成に利用されるが、その過程はフィレドキシンを必要とし、光合成と関連する。硝酸態窒素過多はビタミンC合成を阻害し、光合成効率を低下させる。また、発根量が減り、他の栄養素吸収も阻害される。結果として、病害抵抗性も低下する。葉の色は植物の健康状態を示す重要な指標であり、硝酸態窒素過多による弊害を避けるため、植物性堆肥の利用が推奨される。

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紅葉の鮮やかな赤色はアントシアニンによるもので、これが分解されると褐色になる。アントシアニンの一種シアニジンは還元されてフラバン-3-オール（例：エピカテキン）となり、これが重合して縮合型タンニン（プロアントシアニジン）を形成する。タンニンはさらに縮合し、腐植酸へと変化していく。腐植酸は土壌有機物の主要成分であり、植物の栄養源となる。つまり、紅葉の落葉は分解・重合・縮合を経て土壌の一部となり、新たな生命を育むための養分となる。

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植物の香り化合物（GLV）は、葉が損傷を受けた際にガラクト糖脂質から合成され、害虫や病害に対する防御機構として機能する。GLV合成経路の研究から、ヘキセナールなどの化合物が病害抵抗性に寄与することが示唆されている。このことから、草生栽培において、定期的な草刈りによって放出される香り化合物が作物の耐性を高める可能性が考えられる。逆に、除草剤の使用は香り化合物の放出機会を奪い、食害被害の増加につながる可能性がある。これは、殺菌剤使用による食害増加と同様に、栽培における新たな課題を示唆している。

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本記事は、白血球の一種である好中球の殺菌メカニズム、特に活性酸素生成に関わる酵素（NADPHペルオキシダーゼ、ミエロペルオキシダーゼ）の補酵素に焦点を当てています。NADPHは植物の光合成、ヘムはクロロフィルと共通の合成経路を持つことを解説し、好中球の活性酸素利用と光合成における恒常性維持の類似性を指摘。これらの生化学的関連性から、葉緑素が豊富な春菊のような食品が免疫力向上に繋がる可能性を提示しつつ、土壌環境の重要性も強調しています。追記では、ウイルス感染時の細胞性免疫における活性酸素の役割にも言及しています。

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自然免疫、特に好中球の機能向上に有効な食品を探る記事。好中球は活性酸素(次亜塩素酸、スーパーオキシド、過酸化水素)を産生し殺菌するが、その生成に関わる酵素の補酵素や活性酸素の過剰産生による弊害、スーパーオキシドから過酸化水素への変換メカニズムが不明点として挙げられる。活性酸素の産生と恒常性維持に関わる栄養素を含む食品、特に生鮮野菜の重要性が示唆されている。ただしウイルス感染時には好中球ではなくNK細胞が活躍するため、対策は異なる。

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植物における糖の機能の一つとして、解毒物質の供給がある。動物ではグルクロン酸が毒物と結合し排出されるグルクロン酸抱合が知られる。植物でもグルクロン酸はビタミンC（アスコルビン酸）の合成経路であるD-グルクロン酸経路の中間体となる。アスコルビン酸は抗酸化作用を持つため、間接的に解毒に関与していると言える。また、植物はD-ガラクツロン酸経路、D-マンノース/L-ガラクトース経路でもアスコルビン酸を合成する。糖はエネルギー源以外にも様々な機能を持ち、植物の生産性や病害虫耐性にも関わる可能性がある。

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植物におけるカロテノイド生合成は、IPPとDMAPPを前駆体として非メバロン酸経路またはメバロン酸経路で進行する。最終生成物はカロテノイドであり、様々な構造と機能を持つ。例えば、光合成の補助色素や抗酸化物質として働く。カロテノイド生合成の制御は、代謝工学的手法で遺伝子発現を操作することで可能となる。これにより、特定カロテノイドの増産や新規カロテノイドの創出が可能となる。栄養価向上や産業利用などへの応用が期待されている。

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ブロッコリーなどに含まれるスルフォラファンはイソチオシアネートの一種で、様々な健康効果が報告されている。イソチオシアネートは反応性の高いITC基を持ち、グルタチオンやタンパク質と結合することで解毒酵素を誘導し、活性酸素の発生を抑制する。また、スルフォラファンを含むブロッコリスプラウトは健康食品として注目されている。一方、非殺虫性のBT毒素は、特定の癌細胞を選択的に破壊する可能性が示唆されているが、スルフォラファンとの関連性については明示されていない。

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藍藻から発見された7-デオキシ-セドヘプツロース（7dSh）は、植物の芳香族アミノ酸などの合成経路であるシキミ酸経路を阻害する糖である。シキミ酸経路は植物や微生物に存在するが、動物には存在しないため、この経路を標的とすることで、植物特異的な作用を持つ除草剤の開発が可能となる。7dShは、シキミ酸経路の酵素である3-デオキシ-D-アラビノ-ヘプツロソネート7-リン酸合成酵素(DAH7PS)を阻害することで、芳香族アミノ酸、ビタミン、植物ホルモンなどの合成を阻害し、最終的に植物の生育を阻害する。これは、新たな作用機序を持つ除草剤開発の糸口となる可能性がある。

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アセトアルデヒドはDNAやタンパク質に結合し、生物に有害な毒性をもたらします。本記事では、酵母がこのアセトアルデヒドストレスにどう対応するかを解説。酵母は主に二つの耐性機構を持ちます。一つは、糖からのカロリー生成を抑制し、NADPHを介してオレイン酸を増やすことで耐性を得る方法。もう一つは、細胞内のグルタチオンを増加させ、アセトアルデヒドを結合・回収して無毒化する方法です。これらの機構は、アセトアルデヒド蓄積が酵母の重要な生理作用を抑制し、細胞死に至る可能性を示唆しています。

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ロゴデザイン練習のため、Inkscapeで家紋に挑戦。株式会社京源の紋章上絵師、波戸場承龍氏のナデシコの紋を模写。上記URLの氏のサイトを参考に、Inkscapeでナデシコの紋を再現した。完成図は添付画像の通り。

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発根は植物の生育に不可欠なプロセスで、複雑なメカニズムによって制御されています。オーキシンは主要な発根促進ホルモンであり、細胞分裂と伸長を促進することで根の形成を誘導します。サイトカイニンはオーキシンの作用を抑制する傾向があり、両者のバランスが重要です。エチレンは側根形成を促進し、傷害からの回復に関与します。アブシジン酸はストレス条件下で根の成長を抑制しますが、乾燥耐性獲得には重要です。ジベレリンは根の伸長を促進する一方、高濃度では抑制的に働きます。ブラシノステロイドは細胞分裂と伸長を促進し、根の成長をサポートします。環境要因も発根に影響を与え、適切な温度、水分、酸素が不可欠です。これらの要因が複雑に相互作用することで、植物の発根が制御されています。

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C4植物はCO2濃縮メカニズムにより高い光合成速度を達成する。CO2は葉肉細胞で炭酸脱水酵素(CA)の働きで炭酸水素イオンに変換され、リンゴ酸として貯蔵される。このCO2濃縮により、光合成の律速となるCO2不足を解消する。CAは亜鉛を含む金属酵素で、CO2と水の反応を促進する役割を持つ。C4植物のソルガムを緑肥として利用する場合、亜鉛の供給がC4回路の効率、ひいては植物の生育に影響を与える可能性がある。この亜鉛の重要性は、畑作の持続可能性を考える上で重要な要素となる。

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福井県勝山市の樫ヶ壁は、岩屑なだれ堆積物を九頭竜川が侵食してできた高さ50m、長さ1.2kmの河岸段丘です。かつて川だった場所が隆起し、現在の川は低い位置を流れています。樫ヶ壁中央には小さな滝があり、現在も侵食が進行中です。川の侵食力は、岐阜県飛騨小坂の溶岩流地形「巌立」を分断した例にも見られるように、火山活動が生み出した地形をも変えるほどの力強さを持っています。樫ヶ壁は、川と火山の相互作用が生んだダイナミックな地形の一例です。

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福井県勝山市の六呂師高原にある池ケ原湿原を訪れた著者は、その成り立ちが地すべりによってできた凹地に湧き水が溜まったものだと知る。以前訪れた大矢谷白山神社の巨岩と同様に、この湿原も経ヶ岳火山の山体崩壊に由来する。牧草地が広がる高原に突如現れる湿地帯は、遷移によっていずれは消失する運命にあるが、現在は保存のために人の手が入っている。このことから、著者は湿原がやがて泥炭土へと変化していく過程を身近に感じることができた。

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福井県勝山市にある恐竜渓谷ふくい勝山ジオパークの大矢谷白山神社には、巨大な岩塊が存在する。これは、約5km離れた山頂から山体崩壊による岩屑なだれで運ばれてきた安山岩・玄武岩類である。周辺の土壌は黒ボク土ではないが、山を下ると黒ボク土も見られる。神社手前の道路沿いには、岩屑雪崩堆積物の分布を示した看板がある。勝山ジオパークは恐竜化石の発掘地として有名だが、火山活動による山体崩壊地形も特徴の一つである。

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光合成の明反応後編では、電子伝達系に関わる物質の詳細が説明されている。シトクロムb6f複合体にはヘム鉄を含むシトクロムが、プラストシアニンには銅が、フィレドキシンには鉄-硫黄クラスターが含まれ、それぞれ電子の運搬役を担う。これらの物質の合成にはグルタミン、マグネシウム、二価鉄、マンガン、カルシウム、硫黄などが必要となる。特に、これまで注目されてこなかった二価鉄の重要性が示唆されている。

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この記事では、光合成の明反応に関わる必須元素を解説しています。明反応は、水から電子を取り出しNADPHを生成する過程で、マンガンクラスターが水の分解にマンガンを必要とすることを説明しています。さらに、光化学系ⅠとⅡではクロロフィルが光エネルギーを吸収するためにマグネシウムが必須であることを述べています。加えて、高エネルギー反応に伴う活性酸素対策としてカロテノイドが存在し、βカロテンは炭素と水素のみで構成されていると補足しています。これらの元素の供給が光合成、ひいては植物の生育に不可欠であることを示唆しています。

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恐竜が生きた時代、大気中の酸素濃度は低く、植物の分解が不十分で石炭が大量に生成された。石炭は炭素を地中に閉じ込め、酸素濃度の上昇を抑えた。低酸素環境は巨大な恐竜の呼吸を困難にした可能性がある。大型恐竜は効率的な呼吸器系や、低酸素への適応を進化させた可能性が示唆されている。石炭紀後期からペルム紀にかけて酸素濃度が上昇し、恐竜の巨大化を促した可能性もある。酸素濃度と恐竜の進化には関連があると考えられる。

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先日もりそばを食べた後、蕎麦湯を飲み、そばの栄養素について調べてみた。そばにはルチンという物質が含まれ、抗酸化、抗炎症、抗高血圧作用がある。ルチンは茹でる際に蕎麦湯に流出する可能性がある。ルチンは二価鉄に結合し、フリーラジカルの生成を抑え、細胞の損傷を防ぐ働きがあるようだ。蕎麦湯を飲むことで、ルチンの効果を期待したい。

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ペンチオピラドは、ミトコンドリアの電子伝達系を阻害する殺菌剤。コハク酸脱水素酵素（SDH）に作用し、コハク酸からユビキノンへの電子伝達を阻害することで、菌の呼吸を阻害する。この結果、NADHの生成が阻害され、ATP合成が阻害され、菌の生育が抑制される。黒腐れ菌核病対策として土壌pH調整と併用された事例も紹介されている。

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植物の成長に不可欠な最重要ホルモン「オーキシン（IAA）」の生合成経路を詳しく解説した記事です。芳香族アミノ酸「トリプトファン」が、シキミ酸経路を経てオーキシンへと変換される過程を化学構造を交えて紐解きます。トリプトファンのインドール環がIAAの骨格となり、アミノ酸共通部分が酢酸基に変わることでオーキシンが生成される仕組みを紹介。オーキシンは根の形成や脇芽の抑制など、植物の多様な生理作用を司りますが、その複雑な働きは前駆体トリプトファンだけでは説明しきれない深さを持つことを示唆しています。

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夜久野高原の宝山で採取した緑色の石の正体を考察する記事です。宝山は玄武岩質の火山で、麓の土は黒、壁面の土は赤です。採取した石の中には、山頂付近のスコリア、内部が割れて出てきたと推測される玄武岩がありました。注目すべきは全体的に緑色の石で、筆者はマグネシウムを含む鉱物、または粘土を含むチャートではないかと推測します。チャートの可能性は光沢がないことから否定し、火山であることから超塩基性火山岩コマチアイトの可能性を検討します。コマチアイトの画像と類似していることから、コマチアイトの可能性が高くなります。また、玄武岩マグマの冷却初期にかんらん石ができるとの記述から、かんらん石の可能性も示唆されます。コマチアイトとかんらん石はどちらもマグネシウムを豊富に含むため、緑色の石はマグネシウムを多く含むと結論づけられます。宝山は二酸化ケイ素が少ない超塩基性岩で、鉄とマグネシウムを豊富に含むことから、京都の一般的な土地とは異なる特性を持つと考察しています。

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ラウンドアップの有効成分グリホサートは、植物の必須アミノ酸合成経路を阻害することで除草効果を発揮する。しかし、論文によればグリホサートは人体において重要な酵素シトクロムP450の働きを抑制し、アルツハイマー病、癌、糖尿病などのリスクを高める可能性がある。シトクロムP450は解毒作用やステロイド合成に関与し、植物にも存在する。仮に植物のシトクロムP450がグリホサートによって阻害されれば、植物は一時的に無防備な状態になり、ダメージを受ける可能性がある。イネではシトクロムP450の候補遺伝子が多数発見されているものの、機能は未解明な部分が多く、グリホサートの影響を断言できない。そのため、分解が早くてもラウンドアップの安全性を断定するのは難しい。

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真夜中に咲くヘビウリの花の幽玄な美しさについて。純白で細い糸状の花弁が織りなすシルエットは、伊勢菊や伊勢撫子に通じる日本の美意識を想起させる。著者はこの花の造形美を称賛するが、一方で「気持ち悪い」と感じる人もいるという。野生種であるヘビウリの奇妙な形状は、夜間の暗闇の中で白い流線型が部分的に光を反射することで、大きな花のように見せかけ、受粉を促すための適応戦略なのかもしれない、と考察している。

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カーネーション（オランダナデシコ）は、バラ、シクラメンと並ぶ日本の三大園芸植物の一つ。野生種のカワラナデシコは花弁が少なく薄いピンク色だが、品種改良により、八重咲きで色鮮やかな現在の姿になった。花弁の形状や色素の変化は著しく、様々な品種が生み出されている。かつての園芸家はカワラナデシコから現代の多様なカーネーションを想像して品種改良を始めたのだろうか、と著者は考察している。

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牛糞堆肥の施用は、作物の免疫系を弱める可能性がある。植物は硝酸イオンを吸収しアミノ酸に変換するが、牛糞堆肥のような塩類集積を起こしやすい資材は、硝酸還元に過剰なエネルギーを消費させ、免疫系への負担となる。アミノ酸肥料は光合成産物の節約に繋がり有効だが、土壌に硝酸塩が多いと効果が薄れる。食品残渣発酵物や、特に廃菌床は、硝酸塩集積を起こしにくく、アミノ酸やミネラルも豊富なので、牛糞堆肥より優れた土壌改良材と言える。つまり、牛糞堆肥へのこだわりは、秀品率低下に繋がる可能性があるため、再考すべきである。

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植物は免疫機構として活性酸素を利用し、侵入した菌を死滅させる。活性酸素(スーパーオキシドアニオン)は、電子伝達系（呼吸）におけるエネルギー生産過程の副産物として常に生成されている。これは、菌侵入への迅速な対応を可能にする。しかし、過剰な活性酸素は自身を傷つけるため、マンガン等の電子を用いて除去する必要がある。つまり、免疫と活性酸素制御の両方に電子が不可欠で、光合成で得た電子を糖に蓄え利用している。この電子の流れとバランスが植物の健康を維持する鍵となる。

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クエン酸回路で生成されたNADH₂⁺を利用し、ミトコンドリアの電子伝達系で大量のATPが合成される。葉緑体と同様にプロトン駆動力を使うが、ミトコンドリア内膜の内外でH+を移動させる点が異なる。NADHの電子を用いてH+を膜の外へ放出し、ATP合成酵素を通して内側に戻す際に生じるエネルギーでATPを生成する。これで糖からエネルギーを取り出す過程が完了し、全体の反応式C₆H₁₂O₆ + 6O₂ + 38ADP → 6H₂O + 6CO₂ + 38ATPとも一致する。

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解糖系で生成されたピルビン酸は、ミトコンドリア内でクエン酸回路に入り、電子を放出する。この回路では、ケトグルタル酸など様々な有機酸を経由し、NADH₂⁺の形で電子を取り出す。ケトグルタル酸は植物のアミノ酸合成にも利用される物質である。つまり、植物はクエン酸回路で生成される有機酸をアミノ酸合成にも活用している。そのため、糖をアミノ酸合成に利用する植物にとって、アミノ酸を直接吸収する能力は大きなメリットとなる。

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植物にとって最も重要な植物ホルモンであるオーキシンは、成長や発達に様々な影響を与える。オーキシンは茎の先端で合成され、重力の方向に移動することで植物の成長方向を制御する。この重力による移動は、オーキシン排出キャリアのPINタンパク質が細胞膜の特定の位置に配置されることで実現される。オーキシンは細胞壁を緩めることで細胞伸長を促進し、高濃度では逆に成長を阻害する。この性質を利用し、植物は光の方向へ成長する屈光性を示す。オーキシンは側根の形成や果実の発達にも関与し、農業分野でも挿し木の発根促進などに利用されている。オーキシンは植物の形態形成に不可欠なホルモンであり、その作用メカニズムの解明は植物科学の重要な課題である。

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葉緑体は光合成で水を分解し、電子を取り出す過程で酸素と水素イオン(H⁺)を生成する。電子はNADPHに蓄えられ、後のブドウ糖合成に使われる。一方、H⁺は葉緑体内のATP合成酵素を通過する際に生じるプロトン駆動力によってADPからATPを生成する。このATPは、二酸化炭素からブドウ糖を合成する暗反応で使われ、光合成全体の反応が完結する。つまり、葉緑体は光エネルギーを利用して水を分解し、電子とH⁺からそれぞれNADPHとATPを作り、ブドウ糖合成に必要なエネルギーを自前で供給している。

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植物は光合成の明反応で水から電子を取り出し、NADPHの形で蓄える。暗反応（カルビン・ベンソン回路）では、二酸化炭素からブドウ糖を合成する際に、このNADPHから電子が有機酸に渡される。結果として、ブドウ糖には水由来の電子が蓄えられることになる。生物はエネルギーが必要な時、このブドウ糖を分解することで電子を取り出し利用する。つまり、ブドウ糖は電子の貯蔵形態として機能している。

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光合成の明反応は、光エネルギーを使って水分子を分解し、化学エネルギーを生成する過程です。葉緑体のチラコイド膜上で起こり、光化学系IIと光化学系Iという二つの光化学系が関与します。 まず、光化学系IIにおいて光エネルギーがクロロフィルに吸収され、水が分解されて電子、プロトン（H⁺）、そして酸素が生成されます。電子は電子伝達系を移動する過程でエネルギーを放出し、プロトンはチラコイドルーメンに汲み上げられます。このプロトン濃度勾配を利用してATP合成酵素がATPを合成します。 次に、光化学系Iでは再び光エネルギーがクロロフィルに吸収され、電子が再び励起されます。この電子は最終的にNADP⁺に渡され、NADPHが生成されます。生成されたATPとNADPHは、続く暗反応で二酸化炭素から糖を合成するために利用されます。

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ツバキの斑入りと絞りの違いを考察した記事。斑入りはウイルス感染で赤い色素が欠損した結果、白い斑点が生じる。一方、絞りは白い下地部分的に赤い色素が発現する遺伝的な現象で、白が劣性、赤が優性遺伝子による。記事は、斑入りと絞りの発現過程の違いを、優性・劣性遺伝子の活用に例え、自身の内面を発掘し活用することの重要性を示唆している。ナデシコにも絞り咲きがあることが補足されている。

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陽春園で見かけたカワラナデシコの花の美しさに感動した筆者は、野生で見たことがないことに気づく。河原は背の高い草が生い茂り、カワラナデシコのような50cmほどの植物が育つ環境ではないように思える。秋の七草として古くから知られるカワラナデシコだが、現代の河原は外来種の影響で大きく変化しているのではないかと推測する。もしかしたら、注意深く探せば近くの土手にも生えているかもしれないと期待を寄せている。絞り咲きカワラナデシコや伊勢ナデシコの画像も掲載されている。

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アンモニア酸化細菌がアンモニアを亜硝酸に酸化し、さらに亜硝酸酸化細菌が亜硝酸を硝酸に酸化する一連の反応を硝化作用という。生物は物質を酸化し電子を得ることでエネルギーを産生する。アンモニア酸化でも細菌は電子を得て活動しており、有機物の分解によるエネルギー産生は酸化的リン酸化と呼ばれる。生物は電子を欲しがるため、還元されたアンモニアは誰が作ったのかという疑問が生じる。