植物のミカタ

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もみ殻燻炭の土作りへの有効性を検証。栽培者は腐植酸に似た成分を求めており、その基となるリグニンやポリフェノールがもみ殻に含まれているか調査。農研機構の研究で、もみ殻からリグニンとポリフェノールが抽出できることが判明。今後は、炭化によってこれらの成分がどう変化するかを把握する必要がある。

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家畜糞の臭気成分トリメチルアミンは、酸化によりジメチルアミン、メチルアミンを経てアンモニアへと分解される。それぞれの過程でメチル基(-CH3)が外れ、最終的にアンモニア(NH3)となる。アンモニアは硝化され硝酸となり土壌に留まるため、トリメチルアミンは揮発または硝酸に変化することで臭いが消える。

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家畜糞の臭気成分トリメチルアミンは、刺激臭があり肥料利用時に問題となる。切り返しによる自然減に加え、酸化反応を抑制したい。穏やかな酸化剤（過酸化水素）と反応させると、トリメチルアミン-N-オキシド（無臭、揮発性）に変化する。これにより臭気を低減できる。今後は、トリメチルアミンの分解について検討する。

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家畜糞に含まれる臭気成分トリメチルアミンは魚臭が特徴。肥料として使用した場合の植物への影響は不明だが、人体には刺激性がある。刺激性の原因は今後調査予定。

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家畜糞の臭気成分メチルメルカプタンは、施肥時に根を傷める要因となる。Wikipediaによると、乳酸菌や真菌が含硫アミノ酸のメチオニンからメチルメルカプタンを合成する。家畜糞からの発生は、腸内細菌か発酵初期の真菌が関与していると考えられる。メチルメルカプタンは揮発し続けるため、硫黄が失われるのは避けられない。

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排出直後の家畜糞には、インドールに加え、刺激性のあるメチルメルカプタンや硫化水素といった臭気成分が含まれる。特にメチルメルカプタンは殺虫剤の原料にもなるため、植物の根を傷める可能性がある。家畜糞の熟成時の切り返しは、これらの揮発性物質をガス抜きする重要な作業と言える。

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排出直後の家畜糞に含まれるスカトールは植物の根を傷つける可能性がある。家畜糞を熟成させるとスカトールは酸化され、メチル基が開裂しアンモニアが外れる。最終的には二酸化炭素、水、アンモニアなどの無機物へと無機化されるため、熟成によってスカトールは消失すると考えられる。

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排出直後の家畜糞に含まれる臭い成分（スカトール等）が、肥料として使用時に植物の根や葉を傷める要因になる可能性について考察しています。一般的な原因とされるガスやpHだけでなく、スカトール自体が植物に影響を与える可能性に着目。AIへの質問から、スカトールが皮膚に炎症を引き起こす可能性があることが示唆され、その原因が自動酸化による酸化生成物であることから、植物への悪影響も考えられると結論付けています。

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魚粉にイノシン酸が豊富なのは、魚の死後に筋肉中のATPが分解されて生成されるため。生きている魚にはほとんど存在しない。さらに、魚粉の製造過程である乾燥で水分が蒸発し、イノシン酸が濃縮されることも理由。野菜やキノコでイノシン酸の話題を聞かないのは、生成過程が異なるためと考えられる。

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漫画「ヤンキー君と科学ごはん」で旨味成分の相乗効果に触発され、キノコに豊富なグアニル酸に疑問を持った筆者。グアニル酸はDNAやRNAの主要化合物であるグアノシン三リン酸(GTP)由来だが、なぜキノコに多いのか？Geminiに質問したところ、キノコはRNAを多く含み、乾燥過程でRNAが分解されグアニル酸の前駆体が生成されるためと回答があった。細胞密度や分裂速度からRNA量が多い可能性が考えられ、旨味成分の豊富さに納得した。

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葉緑素のヘムが窒素肥料の有機態窒素になるかを探る過程で、ヘムからステルコビリンへの分解経路を検討。今回は、その過程で生成されるウロビリノーゲンが酸化されてウロビリンになる点に着目。ウロビリンの構造から、ポリフェノールやモノリグノールとの反応可能性を推測し、有機物分解における光分解や酸化の重要性を強調している。

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葉緑素が窒素肥料になるかを検討。前回、ヘムからビリルビンへの変化を見た。今回は、ビリルビンが腸内細菌（土壌菌も同様と仮定）によってウロビリノーゲン、ステルコビリンへと変化する過程を紹介。しかし、ステルコビリン以降、有機態窒素として利用される過程の情報は見つからなかった。

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葉緑素中の窒素が有機態窒素肥料として機能するのかを、ヘムをモデルに考察。ヘムは土壌微生物に取り込まれ、ヘムオキシゲナーゼによって分解され、ビリベルジン、更にビリルビンへと変化する。この過程で窒素はアンモニア態や硝酸態に変換されるか否かが焦点だが、ビリルビンまでは有機態窒素として存在すると考えられる。つまり、葉緑素由来の窒素は、微生物に利用され分解される過程で、PEONのような有機態窒素肥料として機能する可能性がある。

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クチナシの果実から抽出される色素には、黄色と青色がある。青色色素ゲニポシドは、加水分解またはβ-グルコシダーゼ処理によって赤色のゲニポシド酸に変化する。クチナシは黄色、青色、赤色の三原色をすべて生成できるため、様々な色の表現が可能となる。人体への影響は今後の調査が必要だが、黄色のカロテノイドは安全と考えられる。

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クチナシは多様な色素を持つ天然色素原料である。黄色色素のクロシンはカロテノイドの一種、青色色素のゲニポシドはイリドイド配糖体である。クロシンはサフランなどにも含まれる黄色の色素成分で、ゲニポシドは青色の色素成分である。クチナシはこれら以外にも様々な色素を含んでおり、抽出・分離、化学反応によって様々な色を作り出すことができる。

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牛糞の初期発酵に関わる真菌は明確には特定されていないが、堆肥化プロセスから推測できる。堆肥化初期の糖分解段階では、アスペルギルス属（コウジカビなど）、ペニシリウム属、ムコール属などの真菌が関与し、発熱を伴う。温度上昇により真菌活性は低下し、好気性細菌が優位になる。 温度低下後のセルロース分解を経て、リグニン分解段階で再び真菌が活性化するが、牛糞の場合は窒素過多により白色腐朽菌の活動は限定的となる可能性があり、主要な真菌は不明である。

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この記事では、チョコレートの香りの化合物、特にアルデヒド類について掘り下げています。イソバレルアルデヒドを例に挙げ、これがイソアミルアルコールの酸化によって生成されることを説明。イソアミルアルコールは酢酸と反応して酢酸イソアミルという香気成分になることから、香りにおいてカルボン酸、アルコール、アルデヒドの重要性を指摘しています。過去の「チョコレートの香り再び」シリーズの記事を踏まえ、これらの知見が他の香料製品の理解にも繋がる可能性を示唆しています。

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チョコレートの香気成分は、メラノイジン、ケトン類、フラン類、エステル類に加え、テルペン類も含まれる。テルペン類の例として、ファルネソールという大きな構造の化合物がある。揮発性にはメチル基の多さが関与していると考えられる。テルペンはイソプレン単位が複数結合した炭化水素で、植物の精油成分によく見られる。イソプレンは特定の構造を持つ炭化水素である。今回の調査では詳細は不明だが、チョコレートの香りにテルペン類が関与していることを覚えておこう。

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チョコレートの香気成分の一つ、酢酸イソアミルについて解説。酢酸とイソアミルアルコールがエステル結合したこの化合物は、単体の酢酸とは異なり、チョコレートの甘さを引き立てる香りを持ちます。イソアミルアルコール自体がフルーティーな香りを持ち、酢酸の酸っぱい香りを中和することで、全体として好ましい香りを生み出していると考えられます。有機酸は炭素数が少ないほど刺激臭が強くなる傾向があり、化合物のわずかな構造の違いが香りに大きな影響を与えます。

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この記事では、チョコレートの香り成分の一つであるメチルフランについて解説しています。メチルフランはメイラード反応や熱分解など様々な経路で生成されるものの、詳細な生成過程は不明です。五員環上の酸素の反応性が高く、これが香りのもととなる一方、発がん性の懸念も示唆されています。過剰摂取は避けるべきですが、一体どんな香りがするのか興味をそそられます。筆者は、メチルフランの反応性の高さから、かつて研究で使用した発がん性のあるDEPCを想起しています。また、関連として糖の還元性や味噌の熟成についても触れています。

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チョコレートの香りの成分、特にカカオ豆由来の脂質の香りが主題です。カカオ豆は脂質含有量が高いため、脂質由来の香りが顕著になります。具体的には、アセチルアセトンとジアセチルというケトンが挙げられ、これらは脂肪酸の自動酸化で生成されます。バターやチーズのような乳製品の香りも、これらのケトンが担っています。カカオ豆の豊富な脂質が、これらのケトンを生成し、チョコレート特有の香りを形成していると考えられます。以前の記事で触れたピラジンやキノンも香りに関わっており、脂質の酸化と香りの関係が示唆されます。

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チョコレート香を持つテトラメチルピラジン(TMP)の抗菌作用について調査した。農薬成分ピラジフルミドとの関連は見出せず、TMPの抗菌作用に関する研究報告は少ないものの、生成AI Geminiによれば抗菌・抗真菌作用の可能性が示唆されている。具体的には一部の真菌への抗真菌活性を持つと報告されているが、作用機序は細胞膜への作用や酵素活性阻害等、未解明な部分が多い。TMPは納豆菌が合成するため、土壌中の団粒構造に含まれる可能性があり、作用対象の菌種特定が今後の課題となる。

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チョコレートの香り成分であるピラジン類について、なぜ良い香りと感じるのかを考察している。ピラジンの一種であるテトラメチルピラジンには活性酸素を抑える効果があることがWikipediaに記載されていることから、人体にとって有益な物質を良い香りと認識している可能性を示唆。また、ピラジンは農薬にも使用されているため、更なる調査の必要性についても言及している。

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チョコレートの香気成分の一つ、トリメチルピラジンについて調べた。これはアミノ酸のスレオニンとグルコースのメイラード反応で生成されると言われるが、具体的な反応経路は不明。さらに、大豆発酵食品の納豆にも含まれ、納豆臭の一因となっている。トリメチルピラジンは大豆発酵に関わる微生物の働きで合成される可能性があり、生成メカニズムの解明は今後の課題となっている。

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チョコレートの香りは数百種類の成分からなり、メイラード反応もその一因である。メイラード反応とは、糖とアミノ酸が加熱により褐色物質メラノイジンを生成する反応で、チョコレートの香気成分も生成する。例えば、グルコースとバリン、ロイシン、スレオニン、グルタミンなどとの反応で特有の香りが生まれる。100℃加熱ではチョコレート香、180℃では焦げ臭に変化する。カカオ豆の焙煎温度が100〜140℃付近であることは、チョコレートの香りを引き出すための科学的知見と言える。

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カカオプロテインは難消化性タンパク質で、その原因はイソペプチド結合にある。通常、アミノ酸はアミノ基とカルボキシル基でペプチド結合を形成する。しかし、イソペプチド結合はアスパラギン酸やリジンの側鎖にあるカルボキシル基やアミノ基が、他のアミノ酸のアミノ基やカルボキシル基(側鎖も含む)と結合する。この側鎖同士の結合がタンパク質の構造を変化させ、消化酵素による分解を阻害し、難消化性につながると考えられる。カカオプロテインにはこのイソペプチド結合が多く含まれている可能性がある。

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カカオプロテインは、小腸で消化吸収されずに大腸に届き、便通改善効果を持つ可能性のある難消化性タンパク質。その構造の詳細は不明だが、難消化性タンパク質は一般的にレジスタントプロテインと呼ばれ、高次構造の安定性、特定の結合（イソペプチド結合）、糖鎖やリン酸による修飾、凝集といった要因で消化酵素が作用しにくくなると考えられる。チョコレート製造過程を考えると、カカオプロテインの難消化性は高次構造の安定性や糖鎖修飾によるものと推測される。

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チョコレートの原料であるカカオ豆に含まれるカカオポリフェノールについて解説。カカオポリフェノールは、エピカテキン、カテキン、プロシアニジンといった一般的なポリフェノールで構成されている。これらは、お茶にも含まれる成分である。カカオ豆の発酵過程で酸化が起こり、これらのポリフェノールは重合していると考えられる。そのため、カカオ特有のポリフェノールは存在しないと考えられる。

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ミルクチョコレートは、チョコレートにミルクを加えることで誕生した。ミルクの添加により、苦みが軽減され、食感が向上する。しかし、ココアバターとミルクは混ざりにくいため、粉乳の技術が開発される必要があった。粉乳化によりミルクの水分が除去され、ココアバターとの混合が可能になった。単に加熱するだけでは水分除去は難しく、粉乳化技術がミルクチョコレート誕生の鍵となった。

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ココア開発の過程でカカオから油脂（ココアバター）を脱脂することで、低融点を実現しヨーロッパでの飲料化を可能にした。しかし、ココアバターは副産物として扱われていた。後に、このココアバターをカカオマスに戻すことで融点が下がり、固形化しやすくなることが発見された。これがチョコレートの原型だが、現代の板チョコとは異なり、生チョコのような質感だった。 ココアバターの活用はチョコレート誕生の重要なブレークスルーだが、更なる改良が加えられて現在の形になった。

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ココアは、カカオ豆からココアバターを脱脂することで作られる。カカオ豆を発酵・焙煎・磨砕したカカオマスからココアバターを抽出することで、ココアパウダーが得られる。このココアパウダーは融点が高いため、冷やしても固まらず、アイスココアのような冷たい飲料として楽しめる。抽出されたココアバターはチョコレートの製造に重要な役割を果たす濃厚な油脂である。カカオ飲料とココアの大きな違いは、このココアバターの有無であり、ココアバターを除去することでココアは常温で固まらない性質を持つ。

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カカオ豆特有の成分、テオブロミンは、カフェインとよく似た化学構造を持つ。カフェインの左上の窒素原子に結合しているメチル基が、テオブロミンでは水素原子になっているだけの違いだ。この構造的類似性から、テオブロミンもカフェインと同様にアデノシン受容体に作用すると考えられる。カカオ豆にはテオブロミンが多く含まれるが、少量のカフェインも含まれており、テオブロミンにメチル基が付加されてカフェインが生成されている可能性がある。

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カカオ豆は成分の半分が脂質で、その融点が低いことがチョコレート誕生の鍵となる。カカオ脂質は32～33℃でほぼ完全に液体になるため、高温多湿な原産地では飲料として利用されていた。しかしヨーロッパでは気温が低いため飲料としては普及せず、需要も減少。カカオ豆の新たな利用法が模索され、ココアやチョコレートの開発へと繋がった。カカオ脂質の融点の低さが、チョコレートの製造を可能にした重要な要素である。

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カカオ豆は渋み・苦みを持つため、発酵を経て食用となる。発酵過程では、バナナの葉で包まれたカカオ豆の表面が白/紫色から褐色に変化する。この色の変化は、フラボノイドの変化を示唆する。紫色はアントシアニン系色素、白色は紫外線吸収色素であるフラボノイドに由来すると考えられる。そして褐色は、フラボノイドが重合したタンニンによるものだ。発酵には酵母、乳酸菌、酪酸菌が順に関与し、乾燥工程では芽胞細菌が関与する。全工程で糸状菌も関与する可能性があるものの、影響は小さい。

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チョコレートの原料カカオ豆は、元々は渋くて苦いため、果肉部分のカカオパルプのみが食用とされていた。しかし、カカオ豆を発酵させることで渋みや苦みが軽減され、食用に利用されるようになった。発酵はバナナの葉に包むことで行われ、葉の常在菌がカカオ豆に移り発酵を促す。このプロセスは乳の発酵に似ている。カカオ豆の渋み・苦み成分であるポリフェノールやタンニンは、微生物によって分解されると考えられる。チョコレート製造の知見から、これらの化合物を分解する新たな方法が見つかる可能性がある。

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アロフェンは、pH依存的に陽イオン交換容量(CEC)と陰イオン交換容量(AEC)を示す粘土鉱物です。低pH環境では、アルミニウムイオンが水と反応してプロトンを放出し、正に帯電した表面を形成するため、陰イオンを吸着しAECを示します。高pH環境では、水酸基がプロトンを放出し、負に帯電するため、陽イオンを吸着しCECを示します。つまり、アロフェンを含む土壌のイオン交換容量はpHに大きく影響され、酸性土壌ではAEC、アルカリ性土壌ではCECが支配的になります。この性質は、土壌の養分保持能力や土壌改良に影響を与えます。

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軽石の主成分である火山ガラスには鉄などの不純物が含まれ、水が作用することで酸化される可能性がある。酸化により火山ガラスが脆くなるかどうかは不明だが、不純物の酸化が風化に影響を与えるかもしれない。

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軽石を落葉抽出液（おそらくタンニンを含む酸性）に浸したところ、黒い鉱物が脱落し、軽石に穴が空いた。軽石の主成分である無色鉱物（石英、長石）は酸に反応しないため、脱落した黒っぽい鉱物は有色鉱物（角閃石か磁鉄鉱と推測）と考えられる。これらの有色鉱物は酸に反応し溶解することで軽石から脱落した可能性がある。結果として軽石表面に穴が空き、水の浸透による風化が促進されると考えられる。

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軽石の化学的風化における酸の作用を検証するため、ブナ科の落葉からタンニンを含む褐色液体を抽出し、軽石を3日間浸漬した。液体を拭き取った結果、微細な小石が脱落し、軽石表面には多数の穴が観察された。これは落葉抽出液、つまりタンニンによる酸の作用で風化が進んだ可能性を示唆する。しかし、更なる検証が必要であり、現段階では断定的な結論は避ける。

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庭の軽石の表面の茶色い部分は風化によってできた粘土鉱物ではないかと考え、軽石の風化を早める方法を模索している。軽石の主成分である火山ガラスは、化学的風化（加水分解）によって水と反応し、粘土鉱物に変化する。水に浸けるだけでは時間がかかりすぎるため、より効率的な風化方法を探している。

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ヒスチジンのイミダゾリル基の反応性に着目し、他のアミノ酸のポリフェノールとの反応性を考察している。アミノ基を持つアミノ酸は、窒素原子に非共有電子対があるため、プロリンを除きポリフェノールと反応する可能性がある。特に、リシン（アミノ基）、アルギニン（グアニジノ基）、グルタミン（アミド基）などは反応しやすい候補として挙げられる。しかし、現時点では各アミノ酸の反応性の大小関係は不明。

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窒素を含む化合物は、非共有電子対を持つため求核剤となる。アミノ酸の中で特にヒスチジンは、イミダゾリル基に二つの窒素を持つ。イミダゾール環の1位と3位の窒素共に非共有電子対を持つが、3位の窒素の非共有電子対が環の外側を向いているため、求核付加反応への関与がより重要となる。

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腐植酸の形成過程におけるキノンの求電子性に着目し、土壌中の求核剤との反応を考察している。キノンは求核剤と反応しやすく、土壌中に存在する求核剤として含硫アミノ酸であるシステインが挙げられる。システインのチオール基は求核性を持ち、キノンと求核付加反応を起こす。この反応はシステインを含むペプチドにも適用でき、ポリフェノールが他の有機物と結合し、より大きな化合物、すなわち腐植酸へと変化していく過程を示唆している。

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有機化学の演習を通して、土壌理解に必要な芳香族化合物の学習を進めている。特に、ポリフェノールとモノリグノールの結合におけるキノンの役割に着目。ポリフェノールは酸化されてキノンとなり、このキノンが反応の鍵となる。キノンの酸素原子との二重結合は電子を引き寄せやすく、モノリグノールのような求核剤と反応する。具体的には、キノンの酸素に求核剤の電子が移動し結合が形成される。この反応によりポリフェノール同士やポリフェノールとモノリグノールが結合する。

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非鉄系の有機系脱酸素剤は、没食子酸やブチルヒドロキシアニソールなどの芳香族化合物で構成されている。これらの化合物はすべてベンゼン環を持ち、有機系脱酸素剤の効果に重要な役割を果たしていると考えられる。有機系脱酸素剤におけるベンゼン環の役割を理解することは、腐植の性質を検討する際にも重要である。

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脱酸素剤には、磁石にくっつく鉄系とくっつかない非鉄系がある。非鉄系は金属探知機に反応しないため、金属検知が必要な食品に使用される。非鉄系脱酸素剤の主要成分として、没食子酸やブチルヒドロキシトルエンなどが用いられる。

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サリチル酸はタンパク変性に加え、脱脂作用も持つ。ベンゼン環(疎水性)、ヒドロキシ基とカルボキシ基(親水性)という構造から、弱い界面活性剤のように働く。このため、角質層の油脂と反応し除去する。油脂は水を弾くため、その除去は角質層の水分の保持を促し、軟化につながる。サリチル酸の構造が界面活性剤と類似していることが、角質軟化作用の一因となっている。