植物のミカタ

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農薬や化学肥料の使用が土壌環境を悪化させるという意見に対して、反論を展開しています。著者は、土壌中の微生物の量と多様性は有機物量に影響を受け、農薬や化学肥料の影響は限定的だと主張。また、連作障害の原因は特定の栄養素の過不足や病害虫の発生であり、農薬や化学肥料が直接の原因ではないと説明しています。さらに、土壌pHの変化は施肥の影響を受けやすく、適切な土壌管理が必要だと指摘。結論として、農薬や化学肥料の使用と土壌環境悪化の因果関係は薄いと結論付けています。

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ボルタ電池は、金属のイオン化傾向の違いを利用して電気を発生させる装置です。この記事ではレモンを用いたボルタ電池を例に、その仕組みを解説しています。レモンの酸性度により、亜鉛板と銅板はそれぞれイオン化し電子を放出します。亜鉛は銅よりもイオン化傾向が高いため、電子を多く放出しマイナス極となります。電子は導線を伝って銅板側へ移動し、そこで水素イオンと結合して水素ガスを発生させます。この電子の流れが電流となり、電球を光らせることができます。

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花の色を決める4大色素とは、カロテノイド、アントシアニン、フラボノイド、ベタレインのこと。カロテノイドは黄～橙色、アントシアニンは赤～青紫、フラボノイドは白～黄色、ベタレインは赤～黄色を呈する。これらの色素の種類や量、さらには細胞のpHや金属イオンとの結合によって、花の色は多様に変化する。例えば、アジサイの色が土壌のpHによって変化するのは、アントシアニンと金属イオンの結合状態が変わるためである。

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この記事は、栽培用の測定器について理解を深めるための導入として、リトマス試験紙を取り上げています。リトマス試験紙は、水溶液のpHを測定し、酸性かアルカリ性かを判定するために用いられます。記事では、リトマス試験紙の由来である「リトマスゴケ」について触れ、それが地衣類の一種であることを説明しています。地衣類は藻類と菌類の共生体で、空気のきれいな場所に生息し、大気汚染の指標にもなっています。そして、リトマスゴケやウメノキゴケの色素がpH測定にどのように関わっているのか、次の記事で詳しく解説することが予告されています。

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ビールの香気成分であるα-テルピネオールは、植物の種子の発芽を抑制する効果を持つモノテルペンアルコールの一種である。土壌中の酵母はα-テルピネオールを生成することがあり、土壌環境によっては発芽抑制物質が蓄積される可能性がある。これは、土壌中の微生物の活動と植物の発芽の関係を示唆しており、農薬や化学肥料の使用が土壌環境に与える影響を考える上で重要な視点となる。食品加工の知識は、植物の生育環境を理解する上で役立つことが多い。

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落葉針葉樹の下は、広葉樹と比べて落葉の堆積が少なく、光が遮られにくいので、アベマキのドングリにとっては発芽しやすい環境に見えます。しかし、針葉樹の葉には、モノテルペンアルコールという物質が含まれており、これが植物の種子の発芽を抑制する効果を持つことが研究で明らかになっています。具体的には、クロマツやスギから抽出したモノテルペンアルコールが、ハツカダイコンの種子の発芽を抑制することが確認されています。このモノテルペンアルコールについて、さらに興味深い情報があるので、それは次回の記事で紹介します。

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落葉落枝が藻類の増殖を抑制する理由について、鉄のキレートに注目して解説しています。藻類は増殖に鉄を必要としますが、落葉落枝から溶け出す腐植酸が鉄と結合し、腐植酸鉄を形成します。これにより、藻類が利用できる鉄が減少し、増殖が抑制されると考えられます。窒素やリン酸への影響は不明ですが、落葉落枝が水中の鉄濃度を調整することで、藻類の増殖をコントロールできる可能性が示唆されています。

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記事は、水中の落葉を食べる「破砕食者」の栄養摂取に焦点を当てています。落葉には栄養が少ないのでは、落葉そのものではなく分解物を摂取しているのでは、という疑問を提示。さらに、落葉の色による破砕食者の好みの違いや、摂取したタンニンの行方についても考察。最終的に、これらの疑問は田んぼの生態系に関わると示唆し、更なる探求を示唆しています。

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## 中干しなし稲作の利益率向上：250文字要約筆者は、硫安由来の硫化水素による根腐れを防ぐため慣習的に行われてきた稲作の中干しを、土壌改良と適切な施肥により省略することで、収量減なく利益率を向上できることを実証した。中干しの省略は労働時間削減と水資源の節約になるだけでなく、高温による稲のストレスを軽減し、品質向上にも寄与する。中干し廃止は慣行農法を見直す契機となり、持続可能な稲作の実現に貢献する。

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水田からのメタン発生抑制のため、使い捨てカイロの活用を提案する。メタン生成は鉄や硫酸イオンの存在下では抑制される。使い捨てカイロには酸化鉄と活性炭が含まれており、土壌に投入するとメタン生成菌を抑え、鉄還元細菌の活動を促す。さらに、活性炭は菌根菌を活性化し、土壌環境の改善にも寄与する。使い捨てカイロの有効活用は、温室効果ガス削減と稲作の両立を実現する可能性を秘めている。

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落葉樹は秋に葉緑素を回収した後、残ったカロテノイドにより黄色く色づきます。さらにその後、タンニンが蓄積して茶褐色になります。 タンニンは土中のアルミニウムと反応し、微細な土壌粒子を作ります。これは団粒構造の形成を促進し、水はけや通気性を良くする効果があります。ヤシャブシなど、タンニンを多く含む植物は、かつて水田の肥料として活用されていました。自然の循環を巧みに利用した先人の知恵と言えるでしょう。

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この記事では、中干しを行わない稲作が、収益性向上と環境改善に有効であることを論じています。従来、中干しは雑草抑制に有効とされていましたが、著者は中干しを行わない田んぼで雑草が生えないことを観察。これは、良好な田んぼの状態がイネのアレロパシー効果を高め、さらに天敵の活動も活発化するためだと推測しています。中干しは除草剤や殺虫剤の使用増加につながる可能性があり、著者は、周囲の慣習にとらわれず、物理性の改善など、収益性と環境性を両立させる稲作を推奨しています。

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硫安などの化学肥料は土壌に悪影響を与えるという俗説がありますが、実際には土壌構造を直接破壊することはありません。記事では、有機物が豊富な黒い土壌層が、化学肥料の使用によりやがて下の層のように有機物の少ない状態に戻るのかという疑問が提起されています。そして、硫安のような強い酸性肥料が、土壌粒子と腐植酸の結合を断ち切り、腐植酸を土壌深くに流出させる可能性について考察しています。しかし、化学肥料の多くは土壌構造を破壊するような直接的な作用を持たないことが補足されています。結論としては、化学肥料が土壌に与える影響は複雑であり、一概に土壌を壊すと断言することはできません。

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除菌剤・消臭剤入りのベントナイトは、土壌改良材として使用しても問題ないか？という質問に対する回答です。結論としては、問題ありません。一般的に使用されている除菌剤のヒノキチオール、消臭剤のカテキンは、どちらも土壌中の微生物によって分解され、最終的には土の一部になる成分です。ヒノキチオールは抗菌・抗ウイルス作用を持つ成分ですが、土壌中では分解されてしまいます。カテキンは消臭効果を持つ成分ですが、土壌中のアルミニウムと結合することで吸着され、効果を発揮しなくなります。そのため、除菌剤・消臭剤入りのベントナイトを土壌改良材として使用しても、土壌や植物に悪影響を与える心配はありません。

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イネは水を求めて発根するのではなく、土壌中の窒素量と植物ホルモンが関係している可能性が高い。中干ししない場合、土壌中の有機物が分解され窒素量が増加、サイトカイニン合成が促進され発根が抑制される。一方、乾燥ストレスがオーキシンを活性化させるという報告は少なく、保水性の高い土壌での発根量増加事例から、イネにおいても乾燥ストレスとオーキシンの関係は薄いと考えられる。中干しなしの場合、初期生育に必要な栄養以外は有機質肥料を用いることで、サイトカイニン合成を抑え、発根を促進できる可能性がある。

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花の色を決める主要な色素は、フラボノイド、カロテノイド、ベタレイン、クロロフィルです。フラボノイドは、アントシアニン、フラボン、フラボノールなどを含み、赤、青、紫、黄など様々な色を作り出します。カロテノイドは、黄色、オレンジ、赤色の色素で、トマトやニンジンなどに含まれます。ベタレインは、赤や黄色の色素で、サボテンやオシロイバナなどに含まれます。クロロフィルは、緑色の色素で、光合成に不可欠です。これらの色素の組み合わせや濃度、pH、金属イオンとの相互作用などによって、花の色は多様に変化します。また、色素の合成に関わる遺伝子の変異も花色の多様性に貢献しています。

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イネの葉面常在菌が合成するマンノシルエリスリトールリピッド（MEL）は、いもち病対策の鍵となる。MELは脂質と糖から合成されるが、脂質源は葉のクチクラ層を分解することで得られた脂肪酸、糖は葉の溢泌液に由来すると考えられる。つまり、常在菌はクチクラを栄養源として増殖し、MELを生産する。MELがあると様々な菌が葉に定着しやすくなり、いもち病菌のα-1,3-グルカンを分解することで、イネの防御反応を誘導する。このメカニズムを機能させるには、健全なクチクラ層と十分な溢泌液が必要となる。周辺の生態系、例えば神社や古墳の木々なども、有益な菌の供給源として重要な役割を果たしている可能性がある。

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いもち病菌の感染を防ぐため、酵母が葉の上にあることが有効かもしれない。しかし、葉面常在菌のある酵母が高濃度だと、トマトの葉を枯らすことが確認されている。これは、酵母が持つ酵素がクチクラ層の脂質を分解し、植物の防御機能を弱めるためだ。クチクラ層は、雨や病原菌から植物を守る重要な役割を果たす。つまり、いもち病対策として酵母を利用するには、濃度管理など、慎重なアプローチが必要となる。なぜ葉面常在菌がクチクラ層を分解するのかは、今後の記事で考察される。

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いもち病菌の感染を防ぐため、イネの葉面に有益な微生物を定着させる方法が模索されている。いもち病菌はα-1,3-グルカンでイネの免疫を回避するが、ある種の細菌由来酵素はこのグルカンを分解できる。そこで、葉面にこの酵素を持つ細菌や、その定着を助ける酵母を常在させることが有効と考えられる。農業環境技術研究所の報告では、酵母が生成する糖脂質MELが、コムギの葉面へのバチルス属細菌の定着を促進することが示された。この知見を応用し、酵母が葉面を占拠した後、α-1,3-グルカン分解酵素を持つ微生物が定着する流れを作れば、いもち病の発生を抑制できる可能性がある。残る課題は、いかにして酵母を葉面に定着させるかである。

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長雨による日照不足で稲のいもち病被害が懸念される中、殺菌剤使用の是非が問われている。殺菌剤は土壌微生物への悪影響や耐性菌発生のリスクがあるため、代替策としてイネと共生する窒素固定菌の活用が挙げられる。レンゲ栽培などで土壌の窒素固定能を高めれば、施肥設計における窒素量を減らすことができ、いもち病への抵抗性向上につながる。実際、土壌改良とレンゲ栽培後の稲作では窒素過多の傾向が見られ、減肥の必要性が示唆されている。今後の課題は、次年度の適切な減肥割合を決定することである。

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牛糞堆肥は土壌改良に有効だが、施用量や方法を誤ると弊害が生じる。未熟な牛糞堆肥はアンモニアガス害で植物を枯らし、土壌中の酸素を奪う。また、牛糞堆肥に含まれる窒素過多は硝酸態窒素の流出による地下水汚染、生育障害、軟弱徒長を引き起こす。さらに、過剰な塩類集積はEC値の上昇を招き、生育阻害や養分吸収阻害につながる。適切な施用量を守り、完熟堆肥を使用する、土壌分析に基づいた施肥設計を行うなどの対策が必要である。加えて、牛糞堆肥はリン酸、カリウムなどの養分過多にも繋がり、土壌バランスを崩す可能性もあるため、注意深い施用が求められる。

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JIRCASが窒素肥料6割減でも多収小麦の品種改良に成功した。土壌中のアンモニア態窒素を硝酸態窒素に変える生物的硝化作用(BNI)を抑制することで、水質汚染や温室効果ガスである一酸化二窒素の排出を抑える。一方、牛糞の過剰施肥は土壌劣化を招き、植物の生育を阻害し、BNI促進や二酸化炭素固定量の減少につながる。SDGsの潮流で環境意識が高まる中、こうした窒素肥料施肥の悪影響に関する情報が増えれば、牛糞土壌使用のこだわり野菜の価値が下がる可能性がある。有機農業への転換など、早めの対策が必要だ。

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稲作では収穫後の稲わらの土壌還元が地力向上に重要だが、腐熟促進に石灰窒素を使う方法に疑問が提示されている。石灰窒素はシアナミドを含み、土壌微生物への影響が懸念される。稲わら分解の主役は酸性環境を好む糸状菌だが、石灰窒素は土壌をアルカリ化させる。また、シアナミドの分解で生成されるアンモニアが稲わらを軟化させ、速効性肥料成分が増加し、作物に悪影響を与える可能性も指摘されている。さらに、カルシウム過剰による弊害も懸念材料である。これらの点から、稲わら腐熟への石灰窒素施用は再考すべきと提言している。

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出穂した稲の籾の一部が黒ずんでいる現象が観察され、その原因を探っている。黒ずみは、8月中旬の長雨による冷害の影響と考えられる。周辺の田んぼでも同様の現象が見られるため、中干し不足の影響は低いと推測。冷害の種類として、定植初期の低温が影響する遅延型冷害、出穂後の低温が影響する障害型冷害、そして両者が混合した混合型冷害がある。黒ずんだ籾が膨らむかどうか、また黒ずみが遮光によるアントシアニンの蓄積によるものかなど、更なる調査が必要。追記として、長雨による穂いもちの可能性も示唆されている。

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麦茶を煮出し、冷やしたものを容器に注ぐと泡立つことがある。これはサポニンによる界面活性作用だけでなく、麦茶に含まれるアルキルピラジン類の化合物も影響している。カゴメの研究によると、この化合物は焙煎時のメイラード反応で生成され、血液流動性向上作用を持つ。つまり、麦茶の泡立ちと香ばしさは、健康 benefits に繋がる成分によるものと言える。メーカーによって泡立ち具合が違うのは、アルキルピラジン類の含有量が違うためと考えられる。

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2021年8月中旬の記録的豪雨の後、大阪の田んぼでは稲が大きく成長していた。長雨でも水没しなければ根腐れせず、イネは逞しく育つ。この成長を促すのが「稲妻」で、雷のエネルギーで生成される窒素化合物が関係すると言われる。しかし、今回雷は少なかったため、大気中の窒素化合物も成長に寄与している可能性がある。増加する豪雨への対策として、土作りが重要な役割を果たすかもしれない。今後の天候による影響も考慮しつつ、稲の生育を見守る必要がある。

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サンショウの辛味は、トウガラシのカプサイシンとは異なるサンショオールという成分による。カプサイシンはバニリル基を持ち、これが舌の受容体に結合して辛味（痛み）を感じさせる。しかし、サンショオールにはバニリル基がないため、カプサイシンほどの辛味ではなく、痺れのような感覚を引き起こす。この痺れは、舌の別の受容体が刺激されることで生じると考えられる。

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柑橘類の皮に含まれるリナロールは、抗菌作用を持ち、ミカンなどの果実を菌感染から守る役割を果たしている。このため、リナロールを含むミカンの香りを吸い込むことで、同様の抗菌効果が人体内で期待でき、鼻風邪やのどの痛みなどの風邪症状の予防や改善につながる可能性がある。さらに、リナロールはビタミンAやEの合成に必要な中間体でもあるため、植物にとって重要な物質と考えられている。

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カロテノイドは植物にとって光合成補助色素や抗酸化物質として必須の化合物である一方、植物を食べる動物にとってはビタミンAやEの前駆体として重要です。除草剤の中には、このカロテノイド生合成経路を阻害することで植物を枯らすものがあります。具体的には、フィトエン不飽和化酵素を阻害するノルフルラゾンや、ζ-カロテン不飽和化酵素を阻害するピフルジフェンなどがあります。これらの除草剤は、カロテノイドが合成できなくなることで光合成系が破壊され、植物を白化・枯死させます。これはカロテノイドの重要性を示すと同時に、特定の酵素を標的とする除草剤開発の巧妙さを示す例でもあります。

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サンショウの実の香りの主成分はd-リモネンと酢酸ゲラニルで、どちらもテルペノイドに属する。リモネンはミカン科のサンショウに含まれることは納得できる。テルペノイドはカロテノイド合成に関連しており、サンショウはカロテノイドも豊富に含むと推測される。先駆植物であるサンショウは、強光下で活性酸素の発生を抑えるキサントフィルサイクルのためにカロテノイドを蓄えている可能性がある。葉の表面のツヤではなく、カロテノイドで過剰な光エネルギーに対処していると考えられる。香りの良い葉にも注目することで、更なる発見があるかもしれない。

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植物の葉の香りは、損傷時にリノレン酸などの不飽和脂肪酸が酸化・分解され、揮発性が高まることで生成される。青葉アルコールを例に挙げると、リノレン酸より沸点・融点が大幅に低いため、気体になりやすい。この揮発した化合物を鼻で受容することで、人間は「青葉の香り」として認識する。葉で生成された香り化合物は、周辺植物に吸収され、害虫耐性向上や天敵誘引などの効果をもたらす。この仕組みを利用し、脂肪酸を多く含む緑肥を栽培し、刈り倒すことで、畑全体に香り化合物を充満させる方法が考えられる。

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殺虫剤抵抗性を持つカメムシ類の増加により、稲作における殺虫剤の効果は低下している。天敵に頼る防除が重要だが、精神的な負担も大きい。そこで、ドローンを用いた黒糖液肥散布が有効な予防策として考えられる。植物はグルタミン酸で防御反応を活性化させるため、黒糖液肥に含まれるアミノ酸がイネの物理的損傷への耐性を高める可能性がある。さらに、アミノ酸は防御物質の合成や天敵誘引にも関与し、総合的な防御力向上に繋がる。病気や害虫発生時の農薬散布といった対処療法ではなく、事前の予防が重要性を増している。

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ヤシャブシの葉は、水田の肥料として古くから利用されてきた。その肥効は、葉に含まれる養分だけでなく、鉄分供給による窒素固定促進の可能性がある。水田土壌には鉄還元細菌が存在し、鉄を利用して窒素ガスをアンモニアに変換する。ヤシャブシの葉に含まれるタンニンは鉄とキレートを形成し、鉄還元細菌の働きを助ける。さらに、キレート鉄はイネにも吸収されやすく、光合成を活性化し、養分吸収を高める。結果として、窒素固定の促進と養分吸収の向上という相乗効果で、イネの生育が促進されると考えられる。この仮説は、ヤシャブシの葉の伝統的な利用方法を科学的に説明する可能性を秘めている。

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トマトへのケイ素施用は、高温ストレスや病害抵抗性の向上に効果がある。ケイ素は細胞壁に沈着し、物理的なバリアを形成することで病原菌の侵入を防ぎ、植物の強度を高める。また、抗酸化酵素の活性を高め、活性酸素の発生を抑制することで、高温ストレスによるダメージを軽減する。さらに、ケイ素は蒸散を抑制し、水利用効率を高める効果も持つ。これは、ケイ素が葉のクチクラ層の形成を促進し、水分蒸散を抑制するためである。これらの効果により、トマトの生育が促進され、収量や品質の向上が期待できる。ただし、過剰な施用は他の栄養素の吸収を阻害する可能性があるため、適切な量を使用する必要がある。

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東京新聞の記事は、食肉生産に伴う温室効果ガス排出問題を取り上げている。牛肉1kgの生産には二酸化炭素換算で約27kgの温室効果ガスが排出され、これは鶏肉の約7倍、野菜の約270倍に相当する。家畜のげっぷや糞尿からのメタン、飼料生産・輸送、森林伐採などが主な排出源だ。食生活の変化、特に牛肉消費の削減は、地球温暖化対策に大きく貢献する。国連は肉の消費量を週2回に抑えるよう勧告しており、代替タンパク質の開発も進んでいるが、消費者の意識改革と技術革新の両輪が必要とされている。

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トマトの整枝作業で白い服に付く緑色のシミは、洗濯では落ちにくく、トマト特有の青臭い香りと共に発生します。これは、葉緑素ではなく、トマトが生成する3-ヘキサナールという物質によるものと考えられます。3-ヘキサナールは、リノレン酸から甘い緑の香りのヘキサナールが合成される過程で生じる中間体で、青臭さの原因となります。 ヘキサナールは、害虫防御や高温ストレス耐性に役立つ物質です。トマトは冷涼な気候を好み、日本の夏の暑さに弱いため、このシミは過酷な環境下で生き残ろうとするトマトの防衛反応の表れと言えるかもしれません。

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グローバック栽培は、ヤシガラを詰めた細長い袋を用いる水耕栽培の一種。ロックウールより栽培しやすいと言われる。ヤシガラは保水性が高いため水道代と肥料代を削減できる一方、養液のEC管理が難しく、濃い養液での施肥はできない。肥料の残留にも注意が必要で、化学的な知識が求められる。また、水質の影響を受けやすく、地域によっては金気残留の問題も考慮すべき。さらに、海外資材への依存度が高い点も留意点となる。

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水耕栽培では養液のpH管理が重要で、成分の吸収に影響を与える。pH調整にはアップ剤とダウン剤を使用するが、成分が非公開の製品が多い。しかし、General Hydroponicsの製品は成分を公開しており、アップ剤は水酸化カリウムと炭酸カリウム、ダウン剤はリン酸を使用している。これらは高濃度では危険な劇物であるため、取り扱いに注意が必要。pH調整は経験だけでなく、化学的な理解も重要であることを示唆している。農業高校の生徒に肥料の話をした経験から、土壌のpHや肥料成分の知識不足を実感し、経験だけでなく科学的知識に基づいた農業の必要性を訴えている。

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トマト果実の品質向上を目指し、脂肪酸の役割に着目した記事。細胞膜構成要素以外に、遊離脂肪酸が環境ストレスへの耐性に関与している。高温ストレス下では、葉緑体内の不飽和脂肪酸(リノレン酸)が活性酸素により酸化され、ヘキサナールなどの香り化合物(みどりの香り)を生成する。これは、以前の記事で紹介された食害昆虫や病原菌への耐性だけでなく、高温ストレス緩和にも繋がる。この香り化合物をハウス内で揮発させると、トマトの高温ストレスが軽減され、花落ちも減少した。果実の不飽和脂肪酸含有量を高めるには、高温ストレス用の備蓄脂肪酸を酸化させずに果実に転流させる必要がある。適度な高温栽培と迅速なストレス緩和が、美味しいトマトを作る鍵となる。

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トマトの栄養価に着目し、グルタミン酸による防御反応の活用で減農薬栽培の可能性を探る記事です。トマトには糖、リコピン、リノール酸、グルタミン酸が含まれ、特にグルタミン酸は植物の防御機構を活性化させます。シロイヌナズナではグルタミン酸投与で虫害に対する防御反応が見られ、トマトにも応用できる可能性があります。黒糖肥料の葉面散布によるグルタミン酸供給で、虫害を減らし光合成効率を高め、果実品質向上と農薬削減が期待できます。グルタミン酸は人体ではGABA生成に関与する旨味成分でもあります。ケイ素施用による効果検証記事へのリンクもあります。

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トマトへのケイ素施用は、葉内マンガンの均一化を通じて光合成効率向上に寄与する可能性がある。マンガン過剰による活性酸素発生と葉の壊死、マンガン欠乏による光合成初期反応の阻害という問題をケイ素が軽減する。キュウリで確認されたこの効果がトマトにも適用されれば、グルタチオン施用時と同様に光合成産物の移動量増加、ひいては果実への養分濃縮につながる。つまり、「木をいじめる」ストレス技術に頼らずとも、ケイ素によって果実品質向上を図れる可能性がある。

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土壌の形成過程において、緑泥石は重要な役割を果たす。緑泥石は一次鉱物である雲母や長石などが風化・分解される過程で生成される二次鉱物で、粘土鉱物の一種である。緑泥石の生成は、カリウムやカルシウムなどの塩基が溶脱し、ケイ素とアルミニウム、鉄、マグネシウムなどが残留・再結合することで起こる。この過程で土壌は酸性化し、塩基は植物の栄養分として利用される。緑泥石自体は風化しにくいため、土壌中に長期間残留し、土壌の骨格を形成する。また、緑泥石は保水性や通気性を高める効果があり、植物の生育に適した土壌環境を作る。特に、火山灰土壌では緑泥石が主要な粘土鉱物となり、その特性が土壌の性質に大きく影響する。

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土壌微生物とケイ素は密接な関係を持つ。植物はケイ酸を吸収し、一部を土壌に放出する。このケイ酸は、特定の微生物によって利用される。例えば、珪藻や放散虫はケイ酸を使って殻を形成し、バクテリアの中にはケイ酸を細胞壁に取り込むものもいる。また、ケイ酸は土壌構造の改善にも寄与し、微生物の生育環境を良好にする。さらに、ケイ酸は植物の病害抵抗性を高める働きがあり、間接的に微生物の活動にも影響を与える。土壌中のケイ酸の存在は、微生物群集の構成や活動に影響を及ぼし、ひいては植物の生育にも関与する複雑な相互作用が存在する。

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ケイ素は植物に様々な効果をもたらす。レタスではマンガン毒性を緩和し、トウモロコシでは蒸散を抑制する。トマトはケイ素集積量が低いものの、全くないと奇形が生じるため微量は必要。トマト体内でのケイ素輸送機構に欠損があり、効率的に運搬できないことが原因と考えられる。ケイ素はトマトの葉内マンガンの分布均一化を通して光合成ムラをなくし生産性向上に寄与する可能性があり、蒸散にも影響すると思われる。

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トマト栽培の「木をいじめる」技術は、水や肥料をギリギリまで制限し、植物にストレスを与えることで糖度や収量を高める方法である。ただし、この方法は土壌を酷使し、慢性的な鉄欠乏を引き起こすリスクが高い。短期的な収量増加は見込めるものの、土壌の劣化により長期的な視点では持続可能な栽培とは言えず、経営の破綻に繋がる可能性も示唆されている。

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ハウス栽培では、軽微な鉄欠乏が問題となる。キレート鉄を用いることで灌注でも鉄欠乏を回避できるが、マンガンの欠乏は防げない。マンガンは光合成に必須の要素であるため、欠乏を防ぐ必要がある。キレートマンガンも存在するが、土壌環境を整えることが重要となる。具体的には、クエン酸散布による定期的な除塩が有効だ。クエン酸は土壌中の塩類を除去する効果があるが、酸であるため土壌劣化につながる可能性もあるため、客土も必要となる。これらの対策はトマトやイチゴだけでなく、ハウス栽培するすべての作物に当てはまる。葉色が濃くなることは、窒素過多や微量要素欠乏を示唆し、光合成効率の低下や収量減少につながるため注意が必要である。

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施設栽培では、トマトなどの作物は鉄欠乏に陥りやすい。土壌中に鉄は豊富に存在するものの、土壌の酷使による鉄の絶対量の減少と、土壌の化学性の変化が原因となる。施設内では降雨がないため、土壌pHが低下しにくく、石灰やリン酸が過剰になりやすい。鉄の吸収は低いpHで促進されるが、高いpHでは阻害される。植物は根から有機酸を分泌して土壌pHを下げようとするが、施設栽培では発根量も少なく、この作用も限定的となる。結果として、鉄欠乏が生じやすく、光合成に不可欠な鉄の不足は、軽微であっても大きな影響を与える。さらに、アルミニウム過剰な酸性土壌では、アルミニウム耐性植物は鉄吸収メカニズムを利用してアルミニウムを無毒化するため、鉄欠乏を助長する可能性もある。